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血管内皮の時空間的トランスクリプトームの理解と病態研究への応用

了解血管内皮的时空转录组及其在病理研究中的应用

基本信息

批准号：
22K20716
负责人：
亀井竣輔
金额：
$ 1.83万
依托单位：
Kumamoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-08-31 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、血管病変の増生 (血管新生) 時において、中心的役割を担う血管内皮細胞の、発芽・伸長に至る転写調節機構の原理解明を目指し”、血管内皮のシングルセルレベルでの時空間的エピジェネティックス”の解明にとりかかる。研究計画は、以下の通りである。①Single cell RNA-seqおよびSingle cell ChIP-seqなどの解析技術を用いて、新生血管の各活性化内皮細胞の遺伝子発現パターンを経時的に明らかにする。②NFATシグナルの調節・相互作用因子の遺伝子改変マウスや細胞を用いて、各細胞の遺伝子発現パターンを解析・比較する。③各遺伝子改変マウスの生理学的な解析、および各病態誘導時の病態生理学的な解析を通して、血管内皮細胞の1細胞レベルでのNFATシグナルの活性化調節の変化が如何に各細胞での遺伝子発現変化やその先の表現型の変化に影響するかを明らかにする。①におけるSingle cell RNA-seq解析などは実施し、現在詳細な解析を行っている。②では、各マウスの遺伝子発現解析からまずマウス自体の有用性の検証を行い、その後に表現型解析に着手している。また③では、各種in vitro評価系も組み合わせて、細胞系での機能評価も実施している。上記の成果の一部は、各種学会（第８１回日本癌学会、第９５回日本生化学会、IVBM2022、CVMW2022、JPW2022など）にて報告を行い、JCA若手研究者ポスター賞やトラベルアワード（IVBM2022）を受賞するなど、各分野にて一定の評価をいただいている。

This study aims to clarify the mechanism of vascular endothelial cell growth, development and elongation during angiogenesis, and to clarify the mechanism of vascular endothelial cell growth and development during angiogenesis. The research plan is as follows. Single cell RNA-seq and Single cell ChIP-seq analysis techniques are used to analyze the expression of genes in activated endothelial cells of new blood vessels. (2) NFAT regulation, interaction factor gene change, cell use, cell gene expression analysis and comparison (3) Physiological analysis of each gene change, pathological analysis of each pathological induction, regulation of NFAT activation in a cell cycle of vascular endothelial cells, and influence of gene development and phenotypic changes in each cell. 1. Single cell RNA-seq analysis is performed in detail. (2) The analysis of gene expression of each gene is carried out in the evaluation of its own usefulness, and the analysis of phenotype is carried out in the future. All kinds of in vitro evaluation systems are organized and evaluated. Some of the achievements mentioned above were reported by various societies (81st Japanese Cancer Society, 95th Japanese Biochemical Society, IVBM2022, CVMW2022, JPW2022), JCA if the researcher was awarded the prize (IVBM2022), and each field was evaluated.