次世代シーケンサーを用いた法科学的視点に基づく植物の個体識別法の開発

使用下一代测序仪开发基于法医学视角的植物单株识别方法

• 批准号: 22K21101
• 负责人: 中村 隆太
• 金额: $ 1.58万
• 依托单位: National Research Institute of Police Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-08-31 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K21101/
• 关键词: 植物系統分類; ヒヨドリバナ属; 次世代シーケンサー; MIG-seq; 個体識別

今年度の研究に関しては、まず研究に用いるヒヨドリバナ属のサンプル採集について、採集地点及び必要な許可申請について調査を行った。対象としているヒヨドリバナ属植物は、主に秋頃に開花する植物であるため、採集自体はほとんど実施できなかったが、一部の種に関しては採集を実施した。採集できた個体については、形態観察を行い、種の同定を行った。琉球地方には冬に開花する種が存在するため、これの採集を図ったが、所内の手続きの関係で、2023年4月に実施することになった。なお、計画時に考えていた国立科学博物館の筑波実験植物園で栽培されている、主に琉球列島に生育しているヒヨドリバナ属は、博物館の担当者に確認したところ利用不可であったため、琉球列島の個体についても自力で採集する必要があることが判明した。一方、東京大学大学院理学系研究科附属植物園（小石川植物園）のヒヨドリバナ属については、申請を行えば利用できることが確認できたため、2023年度にこれを行う。また、植物分類学会に参加し、現在の植物分類における形態観察、DNAを用いた系統解析の現状について情報収集を行った。形態観察については、あまり詳しい発表が無かったものの、本研究計画時に想定していたような、図鑑に記載されている内容を基にした観察が基本であった。DNAを用いた系統解析についても、本研究で計画しているMIG-seqを用いた研究が多数発表されていたことから、この手法の有用性が確認できた。

Our study の に masato し て は, ま ず research に with い る ヒ ヨ ド リ バ ナ is の サ ン プ ル acquisition に つ い て, gathering place and び necessary な licensing applications に つ い を line っ て survey た. Like と seaborne し て い る ヒ ヨ ド リ バ ナ genus は, main worthy of the に に autumn flowering す る plant で あ る た め and gathering of autologous は ほ と ん ど be applied で き な か っ た が, a の に masato し て は acquisition を be applied し た. Collect で で た た individuals に て て て, morphologically 観 observe を rows を, and species <s:1> determine を rows った. Ryukyu local に は に winter flowering す る が existence す る た め, こ れ の acquisition を 図 っ た が, within the の hand 続 き の masato で, in April 2023 に be applied す る こ と に な っ た. When に な お, project え て い た national science museum の tsukuba be で 験 botanical garden cultivation さ れ て い る, main に ryukyu islands に fertility し て い る ヒ ヨ ド リ バ ナ は and museum の undertaker に confirm し た と こ ろ using an で あ っ た た め, ryukyu islands の individual に つ い て も self-reliance で acquisition す る necessary が あ る こ と が.at し た. A botanical garden, courtyard at the university of Tokyo university, department of researchment department affiliated (small) ishikawa botanical garden の ヒ ヨ ド リ バ ナ genus に つ い て は line, apply for を え ば using で き る こ と が confirm で き た た め, 2023 annual に こ れ う を line. ま た, plant classification society に し and now の plant classification に お け 観 る form was found, DNA を い た status system analytic の に つ い を line っ て intelligence 収 set た. Form 観 examine に つ い て は, あ ま り detailed し い 発 table が no か っ た も の の, this research project に scenarios し て い た よ う な, 図 recorded に Chinese ancient さ れ て い る content を base に し た 観 examine が basic で あ っ た. DNA を with い た system analytic に つ い て も, this study で plan し て い る MIG - seq を with い た research が most 発 table さ れ て い た こ と か ら, こ の gimmick の usefulness が confirm で き た.