Elucidation of a novel DNA repair system from extremophiles and application to exploit of an available host.

阐明来自极端微生物的新型 DNA 修复系统并应用于利用可用宿主。

• 批准号: 23880022
• 负责人: MORITA Rihito
• 金额: $ 2.08万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23880022/
• 关键词: アーキア; 多機能酵素; マルチドメイン; 極限環境微生物; DNA 修復; アルキル化傷害; DNA修復系; 有用宿主

A novel proteins likely involved in multiple DNA repair systems were found in extremophiles. These proteins are comprised of two domains, an alkylated lesion repair protein-like domain in N-terminus and an Endonuclease V (EndoV)-like domain, deamination repair protein, in C-terminus. However, the pathways which is involved in these novel proteins are completely unknown. Since the most of extremophiles are unculturable and their genome sequences are unclear, the novel DNA repair systems potentially act in important pathway from extremophiles. From my prediction, it is important as applications and basic science to elucidate the functions of these novel proteins, AGT-EndoV and ATL-EndoV. I tried to elucidate the function in this project.

在极端微生物中发现了一种可能参与多种DNA修复系统的新蛋白质。这些蛋白由两个结构域组成，一个是位于n端的烷基化损伤修复蛋白样结构域，另一个是位于c端的内切酶V （EndoV）样结构域，即脱氨修复蛋白。然而，这些新蛋白质所涉及的途径是完全未知的。由于大多数极端微生物是不可培养的，其基因组序列尚不清楚，新的DNA修复系统可能在极端微生物的重要途径中起作用。根据我的预测，阐明这些新蛋白AGT-EndoV和ATL-EndoV的功能对于应用和基础科学具有重要意义。我试图在这个项目中阐明功能。

项目成果

アーキア由来マンノシルグリセリン酸合成酵素PH0925 の機能解析

古细菌来源的甘露糖甘油酸合酶 PH0925 的功能分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 森田理日斗;大島敏久;河原林裕
• 通讯作者: 河原林裕

Functional analysis of PH0925, a multifunctional enzyme working within the mannosylglycerate biosynthetic pathway in Pyrococcus horikoshii OT3

PH0925（一种在火球菌堀越 OT3 甘露糖基甘油酸生物合成途径中发挥作用的多功能酶）的功能分析

• 发表时间: 2012
• 作者: Rihito Morita;Toshihisa Ohshima and Yutaka Kawarabayasi
• 通讯作者: Toshihisa Ohshima and Yutaka Kawarabayasi

極限環境微生物由来アルキル基転移酵素様タンパク質の機能解析と転写解析

源自极端微生物的烷基转移酶样蛋白的功能和转录分析

• 发表时间: 2011
• 作者: 森田理日斗;菱沼久紘;大山礼雅;妻鹿良亮;太田敏博;中川紀子;上利佳弘;福井健二;新海暁男;倉光成紀;増井良治;河原林裕
• 通讯作者: 河原林裕

アーキア由来マンノシルグリセリン酸合成酵素 PH0925 の機能解析

古细菌来源的甘露糖甘油酸合酶 PH0925 的功能分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 森田理日斗;大島敏久;河原林裕
• 通讯作者: 河原林裕

Pyrococcus horikoshii 由来PH0925 タンパク質の機能解析

堀越火球菌PH0925蛋白的功能分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 森田理日斗;大島敏久;河原林裕
• 通讯作者: 河原林裕