Higher-order epigenetic analysis of the INK4/ARF locus in oral cancer and development of novel diagnostic methods

口腔癌INK4/ARF位点的高阶表观遗传学分析和新型诊断方法的开发

• 批准号: 24890176
• 负责人: HIROSUE Akiyuki
• 金额: $ 1.91万
• 依托单位: Kumamoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-08-31 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24890176/
• 关键词: INK4/ARF遺伝子座; 高次エピゲノム; DNAメチル化; 口腔扁平上皮癌; 薬剤耐性; エピジェネティクス; クロマチン高次構造; INK4/ARF 遺伝子座

Three critical tumor suppressors (p15/ARF /p16) encoded by the INK4/ARF locus are key regulators of tumorigenesis. In this study, to elucidate a higher-ordered epigenetic regulation of the locus in oral squamous cell carcinoma (OSCC) and to develop novel diagnostic methods based on epigenetic profile, we investigated the relevance between clinical effect and epigenetic alterations inOSCC. Chromosome conformation capture assay revealed that higher-order chromatin structure of the INK4/ARF locus dynamically changed in OSCC cell line. DNA methylation analysis demonstrated that hypermethylation of MGMT and TFAP2E genes were associated with pathological response to 5-FU-based chemoradiotherapy. These results suggest that methylation status of these genes may provide the prediction of drug sensitivity in OSCC.

由INK4/ARF基因编码的三个关键抑癌基因(p15/arf/p16)是肿瘤发生的关键调控因子。在这项研究中，为了阐明口腔鳞状细胞癌(OSCC)中该基因的更高顺序的表观遗传调控，并开发基于表观遗传学特征的新的诊断方法，我们研究了OSCC的临床疗效与表观遗传学改变之间的相关性。染色体构象捕捉分析显示，口腔鳞癌细胞系中INK4/ARF基因座的高阶染色质结构发生动态变化。DNA甲基化分析显示MGMT和TFAP2E基因高甲基化与5-FU为主的放化疗的病理反应有关。这些结果提示，这些基因的甲基化状态可能提供口腔鳞癌药物敏感性的预测。

项目成果

Epigenetic alterations in the drug resistance of oral squamous cell carcinoma.

口腔鳞状细胞癌耐药性的表观遗传改变。

• 发表时间: 2014
• 作者: Matsushita Y;Yamaguchi A;Akiyuki Hirosue
• 通讯作者: Akiyuki Hirosue

A low dicer expression is associated with resistance to 5-FU-based chemoradiotherapy and a shorter overall survival in patients with oral squamous cell carcinoma

• DOI: 10.1111/jop.12140
• 发表时间: 2014-05-01
• 期刊: JOURNAL OF ORAL PATHOLOGY & MEDICINE
• 影响因子: 3.3
• 作者: Kawahara, Kenta;Nakayama, Hideki;Shinohara, Masanori
• 通讯作者: Shinohara, Masanori

口腔扁平上皮癌の抗癌剤耐性に関与するエピゲノム異常

表观基因组异常与口腔鳞状细胞癌抗癌药物耐药性相关

• 发表时间: 2013
• 作者: 廣末 晃之;中山 秀樹;中元 雅史;中村 智穂;川原 健太;中川 純泰;吉田 遼司;永田 将士;平木 昭光;牧 正啓;篠原 正徳
• 通讯作者: 篠原 正徳

Quantitative assessment of higher-order chiromatin structure of the INK4/ARF locus in reprogrammed human cells

重编程人类细胞中 INK4/ARF 位点高级手性结构的定量评估

• 发表时间: 2012
• 作者: Hirosue A;Nakamoto M;shihara K;Takehisa T;Narita M;Nakao M;Shinohara M;Akiyuki HIrosue;Akiyuki HIrosue
• 通讯作者: Akiyuki HIrosue

口腔扁平上皮癌の抗癌剤耐性に関与するエピケノム異常

口腔鳞状细胞癌抗癌药物耐药性相关的表观化学异常

• 发表时间: 2013
• 作者: 廣末晃之;中山秀樹;中元雅史;中村智穂;川原健太;中川純泰;吉田遼司;永田将士;平木昭光;牧正啓;篠原正徳
• 通讯作者: 篠原正徳