組織特異的なヘテロクロマチンサイレンシングに関わる新規因子の解析
組織特異的なヘテロクロマチンサイレンシングに関わる新規因子の解析
批准号:
26891018
负责人:
池田 陽子
金额:
$0.92万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-08-29 至 2015-03-31
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英文摘要
トランスポゾンを含むヘテロクロマチン領域のサイレンシング機構を明らかにするため、シロイヌナズナを用いて、特定の組織において特異的にヘテロクロマチンサイレンシングが解除される新規変異体kumonosu(kun)を単離した。kun変異体では、多数のトランスポゾン及びrDNAリピートを含むヘテロクロマチン領域の転写が活性化されていた。本年度において、KUNがどのような機構でヘテロクロマチン領域の転写制御に関わるかを明らかにするため、kun変異体を用いた機能解析を行い、次の点について成果を得た。1. kun変異体における特定のターゲット領域のDNAメチル化を解析したところ、CG, CHG, CHHすべてのタイプのメチル化のわずかな減少が見られた。2. kun変異体におけるターゲット領域のクロマチン構造を解析するため、ヒストンメチル化抗体を用いたクロマチン免疫沈降法により、ヒストン修飾を調べた結果、ターゲット領域における抑制型ヒストン修飾の減少を検出した。これらのことから、KUNはDNAメチル化及びヒストンメチル化を介してヘテロクロマチン領域のサイレンシングに関与すると考えられた。今後は、kun変異体におけるDNAメチル化及びヒストンメチル化のゲノムワイドな解析や、既知のヘテロクロマチンサイレンシングに関わる変異体との遺伝学的相互作用の解析を行う計画である。
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会议论文
Identification of Arabidopsis KUMONOSU gene involved in DNA methylation and heterochromatin-associated silencing.
拟南芥 KUMONOSU 基因的鉴定涉及 DNA 甲基化和异染色质相关沉默。
DOI:
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发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ikeda, Y., Becker, C., Lopez-Gonzalez, L., Pouch-Pelissier, M., Pogorelcnik, R., Weigel, D., Mathieu, O.]
通讯作者:
O.
KUMONOSU gene is involved in DNA methylation and heterochromatin-associated silencing
KUMONOSU 基因参与 DNA 甲基化和异染色质相关沉默
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ikeda, Y., Lopez-Gonzalez, L., Pouch-Pelissier, M., Bourguet, P., Thierry, P., Pogorelcnik, R., Mathieu, O.]
通讯作者:
O.
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ikeda, Y., Kato, M., Nishihama, R., Yamaoka, S., Kohchi, T., Hirayama T.]
通讯作者:
Hirayama T.
Investigation of genetic variants and clinical risk factors associated with the progression rate of visual field defect in glaucoma
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批准号:23K09030
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.08万
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财政年份:2023
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负责人:池田 陽子
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依托单位:
植物進化過程における転写サイレンシング機能獲得機構
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批准号:22K06266
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2022
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负责人:池田 陽子
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依托单位:
オプチニューリン遺伝子発現調節と緑内障発症における機能的役割の解析
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批准号:18890164
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
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资助金额:$1.66万
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财政年份:2006
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负责人:池田 陽子
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依托单位:
海外基金