Understanding of biochemistry of chlorophyll c to shed light on evolution of marine primary production over the Phanerozoic Eon

了解叶绿素 c 的生物化学有助于揭示显生宙海洋初级生产力的演化

基本信息

  • 批准号:
    18H03743
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 28.2万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 财政年份:
    2018
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2018-04-01 至 2023-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究では,①クロロフィルcの生合成関連遺伝子・タンパク質の探索,②クロロフィル類の分解代謝経路に関わる遺伝子・タンパク質の探索,③クロロフィルcを有する藻類およびその起源に関わる系統の真核生物の地質情報の研究の3つのアプローチを同時進行させてきた。②に関して,最古の真核藻類の出現時期の再検証の必要のため,カナダおよびアメリカの研究者とカナダの北極圏サマセット島への2年度にわたる共同調査の実施が計画されていたがCovid-19パンデミックの影響により中止を余儀なくされ,今後についても確実な実施の目処が立たないのが現実である。この状況を受けて,研究の方向性を転換して,少なくとも今年度と来年度について,①と③の項目に集中することとした。すなわち,まず①に関しては,同様に未同定である二次植物のクロロフィルa合成遺伝子の一部についても視野に入れて,網羅的に機能遺伝子の探索を進めた。ここでは,クロロフィルc合成系が二次植物にのみ見出される事実を重要視し,葉緑体獲得進化に伴う遺伝子重複により生じたクロロフィル合成関連遺伝子のパラログ候補を,全遺伝子情報が既に明らかとなっている有色および無職の珪藻類とクリプト藻類のデータベースから探索した。そして,有機合成した基質クロロフィル中間代謝産物を用いて in vitroでの酵素実験を実施し,いくつかの遺伝子について機能を特定した。これらについては,光合成バクテリアのクロロフィル合成関連遺伝子を欠損させた変異体群を作成したin vivo実験も展開している。③に関しては,分解代謝の研究のためのモデル生物として,これまでのPeranema trichophorumに加えて,珪藻捕食性の鞭毛虫Amastigomonada sp.についても,クロロフィル消化の有無でのトランスクリプトーム変化の解析を進めており,今度候補となる代謝遺伝子を探索していく。
This study で は, (1) ク ロ ロ フ ィ ル c の biosynthesis masato even heritage 伝 child · タ ン パ ク の exploration, (2) ク ロ ロ フ ィ ル class の catabolism 経 road に masato わ る heritage 伝 child · タ ン パ ク の exploration, (3) ク ロ ロ フ ィ を ル c has す る algae お よ び そ の origin に masato わ る の eukaryotes の geological information system の research の 3 つ の ア プ ロ ー チ を simultaneously さ せ て き た. (2) に masato し て, the most ancient の eukaryotic algae の periods の 検 card again の necessary の た め, カ ナ ダ お よ び ア メ リ カ の researchers と カ ナ ダ の arctic sha-lu サ マ セ ッ ト island へ の 2 year に わ た る to investigate の be applied が plan さ れ て い た が Covid - 19 パ ン デ ミ ッ ク の influence に よ り suspended を Yu Yi な く さ れ, In the future, に, に, て, て, <s:1>, な, <s:1>, が, たな, が, が, である. こ の condition を by け て, research の directional を planning in し て, less な く と も our と to annual に つ い て, (1) と 3. の project に concentrated す る こ と と し た. す な わ ち, ま ず (1) に masato し て は, with others in に failed with で あ る secondary plant の ク ロ ロ フ ィ ル traces of a synthetic 伝 son の a に つ い て も に view into れ て, に function of net 伝 son の explore を into め た. こ こ で は, ク ロ ロ フ ィ ル c GeChengXi が secondary plant に の み shows さ れ る matter be important visual し を, chloroplast に get evolution with う heritage 伝 son repeat に よ り raw じ た ク ロ ロ フ ィ ル synthetic masato even heritage 伝 son の パ ラ ロ グ alternate を, All legacy 伝 child intelligence が に Ming both ら か と な っ て い る non-ferrous お よ び and holds no post の stating algae と ク リ プ ト algae の デ ー タ ベ ー ス か ら explore し た. そ し て, organic synthesis し た matrix ク ロ ロ フ ィ ル を intermediate metabolites with い て in vitro で の enzyme be 験 を be し, い く つ か の heritage 伝 son に つ い て function を specific し た. こ れ ら に つ い て は, photosynthetic バ ク テ リ ア の ク ロ ロ フ ィ ル synthetic masato even heritage 伝 を son owe loss さ せ た - variant group を made し た in vivo be 験 も expand し て い る. (3) に masato し て は, catabolism の research の た め の モ デ ル biological と し て, こ れ ま で の Peranema trichophorum に plus え て, stating algal predatory の giardia Amastigomonada sp. に つ い て も, ク ロ ロ フ ィ ル digestion の presence of で の ト ラ ン ス ク リ プ ト ー ム variations change の parsing を into め て お り, this degree of alternate と な る metabolic heritage 伝 son を explore し て い く.

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
柏山祐一郎,丸山萌,柴田栞里,粟井光一郎,中澤昌美,石川孝博
柏山雄一郎、丸山萌、柴田诗织、阿井浩一郎、中泽雅美、石川贵宏
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    ユーグレナの二次葉緑体におけるCAO遺伝のノックダウン
  • 通讯作者:
    ユーグレナの二次葉緑体におけるCAO遺伝のノックダウン
研究ブログ:真核生物に普遍的なクロロフィルの無毒化代謝
研究博客:叶绿素的解毒代谢,在真核生物中普遍存在
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
University of Saskatchewan(カナダ)
萨斯喀彻温大学(加拿大)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Engineered chlorophyll catabolism conferring predator resistance for microalgal biomass production
工程叶绿素分解代谢赋予微藻生物质生产抗捕食者能力
  • DOI:
    10.1016/j.ymben.2021.03.018
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    8.4
  • 作者:
    Kashiyama Yuichiro;Ishizuka Yuki;Terauchi Issei;Matsuda Toshiki;Maeda Yoshiaki;Yoshino Tomoko;Matsumoto Mitsufumi;Yabuki Akinori;Bowler Chris;Tanaka Tsuyoshi
  • 通讯作者:
    Tanaka Tsuyoshi
Taming Chlorophylls Allowed Eukaryotes to Prosper on the Oxygenated Earth
驯服叶绿素使真核生物在含氧地球上繁衍生息
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Takayuki Omori;Keitaro Yamada;Ikuko Kitaba;Takeshi Nakagawa;Yuichiro Kashiyama
  • 通讯作者:
    Yuichiro Kashiyama
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

柏山 祐一郎其他文献

プロティストによる捕食生物中のクロロフィル解毒代謝機構と光合成細胞内共生
原生生物捕食者叶绿素解毒代谢机制与光合内共生
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    横山 亜紀子;柏山 祐一郎;守屋 繁春;民秋 均;井上 勲;柏山 祐一郎,横山亜紀子,民秋均
  • 通讯作者:
    柏山 祐一郎,横山亜紀子,民秋均
Reconstitution of two DNA strand exchange reactions during homologous recombination
同源重组过程中两条 DNA 链交换反应的重建
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    横山 亜紀子;柏山 祐一郎;守屋 繁春;民秋 均;井上 勲;Iwasaki H.
  • 通讯作者:
    Iwasaki H.
緑藻類における光合成能喪失と葉緑体電子伝達系の 縮退進化
绿藻光合能力丧失与叶绿体电子传递链简并进化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    加山 基;陳 俊峰;仲田 崇志;西村 芳樹;鹿内 利治;宮下 英明;高市 真一;柏山 祐一郎;神川 龍馬
  • 通讯作者:
    神川 龍馬
Functional organization of bacterial Hfq-biading small RNA
细菌 Hfq 偏向小 RNA 的功能组织
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    柏山 祐一郎;横山 亜紀子;白鳥 峻志;川口 明 音;中沢 昌美;井上 勲 ;民秋 均;楠見明弘;饗場弘二
  • 通讯作者:
    饗場弘二
Reconstruction of biogeochemical environment of the past ocean based on compound-specific carbon and nitrogen isotopic compositions of sedimentary porphyrins
基于沉积卟啉化合物特异性碳氮同位素组成重建过去海洋生物地球化学环境
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    柏山 祐一郎
  • 通讯作者:
    柏山 祐一郎

柏山 祐一郎的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('柏山 祐一郎', 18)}}的其他基金

盗葉緑体現象におけるキメラ複合体形成の生化学的証明と機能検証
盗叶绿体现象中嵌合复合物形成的生化证明和功能验证
  • 批准号:
    24K02048
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 28.2万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Developing new model microorganisms with diverse nutritional strategies by enhancing growth efficiency through genetic manipulation
通过基因操作提高生长效率,开发具有多种营养策略的新模型微生物
  • 批准号:
    21K19240
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 28.2万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Verification of the geological age of LECA and the early radiation of eukaryotes
LECA地质年代验证及真核生物早期辐射
  • 批准号:
    21KK0061
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 28.2万
  • 项目类别:
    Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
光合成色素の窒素・炭素同位体組成による海洋光合成生物の生物地球化学サイクルの復元
基于光合色素氮碳同位素组成重建海洋光合生物的生物地球化学循环
  • 批准号:
    08J04848
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 28.2万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
光合成生物の分子化石を用いた白亜紀絶滅境界の有光層内無酸素環境形成機構の解明
利用光合生物分子化石阐明白垩纪灭绝边界光层缺氧环境的形成机制
  • 批准号:
    06J10779
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 28.2万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了