RNA合成酵素複合体の機能構造解析

RNA合酶复合物的功能结构分析

基本信息

项目摘要

本研究では鋳型非依存的RNA合成酵素群と翻訳因子と複合体を形成して機能する鋳型依存的RNA合成酵素群の構造一機能解析を行い、これらの酵素のRNA合成における基質特異性の分子基盤や翻訳因子のRNA合成の役割を明らかにすることを目的としている。本年度は、真正細菌由来のポリA付加酵素単体およびATPとの複合体のX線結晶構造解析を行った。ポリA付加酵素の活性触媒ドメイン、ヌクレオチド結合部位の構造はCCA付加酵素のそれと非常に似通っていたが、ヌクレオチド結合部位内のヌクレオチド認識に関わるアミノ酸の構造が異なっていた。ポリA付加酵素ではこれらのアミノ酸が、活性部位の他のアミノ酸と分子内水素結合を形成し、ヌクレオチド結合部位が固い構造をとっており、その結果、ヌクレオチド結合ポケットの形と大きさがATPのみに適したものになっており、保存されたふたつのアミノ酸のうちひとつのアミノ酸のみがヌクレオチドの塩基認識に用いられていた。ポリA付加酵素の、固いヌクレオチド結合ポケット構造の維持は、ヌクレオチド結合ドメインとRNA結合ドメインとの相互作用によることが示唆された。また、Qβレプリケースのコア複合体の複合体形成分子機構を解明するために、コア複合体のX線結晶構造解析を行い、構造を決定した。EF-Tu、EF-Tsはβサブユニットと疎水的相互作用し、コア複合体の中のβサブユニットの活性触媒コアの構造が維持されていた。生化学的解析から、EF-Tu、Tsとβサブユニットの相互作用は、コア複合体形成に必要であり、EF-Tu、Tsがシャペロン機能を有していることを明らかにした。鋳型RNA、合成されたRNA、付加されるヌクレオチドのコア複合体活性部位へのモデルから、コア複合体内のEF-Tuが、RNA合成のプロセッシブなRNA伸長反応を促進する"Modulator"としての、翻訳過程での役割を越えた、新たな機能を有する可能性を提示した。
In this study, an independent RNA synthesis enzyme group, a reversal factor, a complex to form a mechanism-dependent RNA synthesis enzyme group, a machine can be used to analyze the performance and specificity of enzyme RNA synthesis, molecular gene reversal factor, RNA synthesis, and RNA synthesis. This year, the real origin of bacteria is due to the analysis of the X-ray crystal analysis of the complex X-ray of the enzyme-linked ATP complex. In the combination part of the enzyme active catalyst and the combination of the enzyme and the enzyme, the formation of the CCA is very similar to the combination of the enzyme and the enzyme. In addition to the addition of enzymes, the formation of intramolecular water in the active part, the combination of intramolecular water and water in the active part, the formation of the intramolecular water in the active part, the formation of the intramolecular water in the active part, the formation of the intramolecular water in the active part, the combination of the active part, the active part, the active part Save your knowledge so that you can learn how to use it. The combination of enzyme and immobilization was used to maintain the system, and the combination of enzyme and RNA was used to demonstrate the interaction between each other. The molecular mechanism for the formation of the complex, the molecular mechanism for the formation of the complex, the analysis of the X-ray crystal structure of the complex, and the determination of the structure of the complex. EF-Tu, EF-Ts β-cyclodextrin, water interaction, β-cyclodextrin, β-cyclodextrin, active catalyst, β-cyclodextrin, β-cyclodextrin, β- Biochemical analysis, EF-Tu, Ts β-phase interaction, complex formation of essential compounds, EF-Tu, Ts and other mechanisms are available. The RNA type, the synthetic RNA, the active part of the complex, the active part of the complex, the EF-Tu gene, the RNA synthetic antisense RNA, the reverse transcriptional promoter, the reverse transcriptase, the reverse transcriptase, the reversing process, the active part, the active part, the active part,

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Assembly of Qa viral RNA polymerase with host translational elongation factors EF-Tu and-Ts
Qa病毒RNA聚合酶与宿主翻译延伸因子EF-Tu和-Ts的组装
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Takeshita;D.;Tomito;K.
  • 通讯作者:
    K.
Mechanism for the alteration of the substrate specificities of template-independent RNA polymerases.
  • DOI:
    10.1016/j.str.2010.12.006
  • 发表时间:
    2011-02
  • 期刊:
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Y. Toh;D. Takeshita;Takashi Nagaike;T. Numata;K. Tomita
  • 通讯作者:
    Y. Toh;D. Takeshita;Takashi Nagaike;T. Numata;K. Tomita
鋳型非依存的RNA合成酵素の性質と、そのRNAサーベイランス機構における役割
非模板依赖性RNA合成酶的特性及其在RNA监视机制中的作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yamada S;Marutsuka M;Inoue M;Zhang JD;Abe S;Ishibashi K,Yamaguchi N;Eto K;小林宏充,奥野喜裕;松永 幸子;富田耕造
  • 通讯作者:
    富田耕造
「入門構造生物学」-放射光X線と中性子で最新の生命現象を読み解く-生命現象の理解に迫る構造生物学研究4.3翻訳
《结构生物学导论》 - 用同步辐射X射线和中子解释最新的生命现象 - 接近理解生命现象的结构生物学研究 4.3 翻译
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    富田耕造;沼田倫征
  • 通讯作者:
    沼田倫征
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

富田 耕造其他文献

ADPリボシル化によるポリU付加酵素の制御機構
ADP-核糖基化控制多聚尿苷酶的机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    永池崇;富田 耕造
  • 通讯作者:
    富田 耕造
新生ポリペプチド鎖の品質管理におけるVms1 の機能解析
Vms1 在新生多肽链质量控制中的功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    青山智彦;山下征輔;富田 耕造;鈴木 輝彦
  • 通讯作者:
    鈴木 輝彦
鋳型を用いないRNA合成の動的反応分子基盤
无模板RNA合成的动态反应分子基础
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Suto K;Shimizu Y;Watanabe K;Ueda T;Fukai S;Nureki O;Tomita K.;富田 耕造;富田 耕造
  • 通讯作者:
    富田 耕造
Aquifex aeolicus CC酵素によるCC付加反応の分子基盤
Aquifex aeolicus CC 酶进行 CC 加成反应的分子基础
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山下征輔;富田 耕造
  • 通讯作者:
    富田 耕造
Higher extracellular pH suppresses tracheary element differentiation by affecting auxin uptake.
较高的细胞外 pH 值通过影响生长素的摄取来抑制气管元件的分化。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2006
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Tomita K;Ishitani R;Fukai S;Nureki O;富田 耕造;Munetaka Sugiyama;Mineko Konishi;Akitoshi Iwamoto;Yasushi Sato;Naoki Shinohara
  • 通讯作者:
    Naoki Shinohara

富田 耕造的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('富田 耕造', 18)}}的其他基金

高次生命現象を支配するRNA生合成因子の機能発現分子基盤
控制高等生命现象的RNA生物合成因子功能表达的分子基础
  • 批准号:
    23H00368
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
RNA合成における翻訳因子の役割の解明
阐明翻译因子在 RNA 合成中的作用
  • 批准号:
    20051030
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
鋳型非依存性RNA合成酵素の分子機構、進化の分子的基盤研究
非模板依赖性RNA合成酶分子机制及进化研究
  • 批准号:
    17687010
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
RNAと蛋白質の複合体によるヌクレオチド選択の分子進化基礎研究
RNA-蛋白质复合物核苷酸选择的分子进化基础研究
  • 批准号:
    17026043
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
鋳型非依存性RNAポリメラーゼCCA付加酵素によるCCA付加の動画の作製
使用不依赖模板的 RNA 聚合酶 CCA 添加酶创建 CCA 添加视频
  • 批准号:
    15770064
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

相似海外基金

植物由来新規ディールス・アルドラーゼの構造機能解析と非天然型パンデュラチンの創製
新型植物源 Diels 醛缩酶的结构和功能分析以及非天然 panduratin 的创建
  • 批准号:
    24K09877
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
「めげない心」の脳構造・機能、エピゲノム脆弱性の解明
阐明“永不放弃心”的大脑结构和功能以及表观基因组脆弱性
  • 批准号:
    24K05814
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
病原性細菌における哺乳類細胞外多糖の輸送系ABCトランスポーターの構造機能相関
病原菌中哺乳动物胞外多糖转运系统ABC转运蛋白的结构与功能关系
  • 批准号:
    24K17816
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
タンパク質複合体の1分子観察による構造機能の多様性に関する研究
通过蛋白质复合物的单分子观察研究结构和功能多样性
  • 批准号:
    24K01431
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
電気けいれん療法後の脳構造・機能変化は何と相関するのか-脳微小構造を含めた検討-
电休克治疗后大脑结构和功能的变化与什么相关? -一项包括大脑微观结构的研究-
  • 批准号:
    24K10678
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ネフロン癆発症を制御するBicc1-ANKS3-ANKS6複合体の構造・機能解析
控制肾结核发作的 Bicc1-ANKS3-ANKS6 复合物的结构和功能分析
  • 批准号:
    24K11415
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
細菌べん毛モーター固定子構造機能解析から新規回転仮説に基づく力発生機構の解明
基于细菌鞭毛电机定子结构和功能分析的新旋转假设阐明力产生机制
  • 批准号:
    24K09393
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
緑色植物の出現を可能とした葉緑体蛋白質輸送装置の構造機能ダイナミクス
促进绿色植物出现的叶绿体蛋白质运输系统的结构和功能动力学
  • 批准号:
    23K27129
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
非標準型核酸の構造・機能及び蛋白質との相互作用の解明を目指したケミカルバイオロジー
化学生物学旨在阐明非标准核酸的结构和功能及其与蛋白质的相互作用
  • 批准号:
    24K01648
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
物質不均衡分布形成原理の理解を目指した能動輸送体P型ATPaseの構造機能生理学
主动转运蛋白P型ATP酶的结构和功能生理学,旨在了解物质不平衡分布的形成原理
  • 批准号:
    24K01975
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 13.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了