Development of comparative metagenomics for soil microbiome analysis

土壤微生物组分析比较宏基因组学的发展

• 批准号: 22248038
• 负责人: SENOO Keishi
• 金额: $ 29.87万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22248038/
• 关键词: 生物環境; 土壌メタゲノミクス; 土壌環境再生; 窒素循環; 水田土壌; メタトランスクリプトーム解析; 畑土壌; 三宅島森林土壌; 細菌群集構造; 糸状菌群集構造; 一酸化二窒素; RNAクローンライブラリー解析; 定量PCR解析; Rice cluster VI; 初成土壌; Leptosprillum属細菌; Acidithiobacillus属細菌; RubisCO

We tried to uncover the structure and function of microbial communities in soil ecosystem through soil metagenomics using the new DNA-sequencing technology. Novel microbial communities responsible for reduction reaction and nitrogen transformation in rice paddy soil were revealed. The resilience of soil microbial community to the volcanic eruption impact was revealed and the detailed picture of soil microbial genetic response to the long-term application of livestock liquid manure was obtained.

本研究利用DNA测序技术，通过土壤宏基因组学研究土壤微生物群落的结构和功能。揭示了水稻土中负责还原反应和氮转化的新微生物群落。揭示了土壤微生物群落对火山爆发影响的恢复力，获得了长期施用畜禽粪水的土壤微生物遗传响应的详细图像。

项目成果

Characterization of soil microbial community in the early soil ecosystem in Miyake Island, Japan

日本三宅岛早期土壤生态系统土壤微生物群落特征

• 发表时间: 2010
• 作者: Yong Guo;Reiko Fujimura;Ken Hosokawa;Yoshinori Sato;Tomoyasu Nishizawa;Takashi Kamijo;and Hiroyuki Ohta
• 通讯作者: and Hiroyuki Ohta

微生物多様性研究の現状と可能性：土壌微生物研究からの考察

微生物多样性研究现状与潜力：土壤微生物研究的思考

• 作者: 安高 慎也,高梨 翼;小林 幹佳;足立 泰久;小林勇喜;太田寛行，藤村玲子
• 通讯作者: 太田寛行，藤村玲子

三宅島 2000 年噴火堆積物から分離された鉄 酸化細菌 Leptospirillum ferrooxidans C2-3 株の ゲノム解析

从 2000 年三宅岛火山喷发的沉积物中分离出的铁氧化细菌氧化亚铁钩端螺旋菌 C2-3 的基因组分析

• 发表时间: 2011
• 作者: 藤村玲子,佐藤嘉則,細川研,西澤智康;大島健志朗,服部正平,上條隆志,太田寛行
• 通讯作者: 大島健志朗,服部正平,上條隆志,太田寛行

不耕起畑地土壌より分離した糸状菌株の亜酸化窒素生成活性

免耕田土壤丝状真菌菌株一氧化二氮的产生活性

• 发表时间: 2011
• 作者: Kimikazu Sasa;et al.;加藤内藏進;赤池恵・鶴田和人・佐藤嘉則・西村歩・小松崎将一・太田寛行
• 通讯作者: 赤池恵・鶴田和人・佐藤嘉則・西村歩・小松崎将一・太田寛行

III-1. Metagenomics in agriculture: Metagenomic analysis of rice paddy field soil

III-1.

• DOI: 10.2331/suisan.77.254
• 发表时间: 2011
• 期刊: NIPPON SUISAN GAKKAISHI
• 影响因子: 0.4
• 作者: 伊藤英臣;石井聡;妹尾啓史
• 通讯作者: 妹尾啓史