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Development of comparative metagenomics for soil microbiome analysis

Development of comparative metagenomics for soil microbiome analysis
土壤微生物组分析比较宏基因组学的发展
批准号：
22248038
负责人：
SENOO Keishi
金额：
$29.87万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2010 至 2012
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22248038/
关键词：
生物環境土壌メタゲノミクス土壌環境再生窒素循環水田土壌メタトランスクリプトーム解析畑土壌三宅島森林土壌細菌群集構造糸状菌群集構造一酸化二窒素RNAクローンライブラリー解析定量PCR解析Rice cluster VI初成土壌Leptosprillum属細菌Acidithiobacillus属細菌RubisCO

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We tried to uncover the structure and function of microbial communities in soil ecosystem through soil metagenomics using the new DNA-sequencing technology. Novel microbial communities responsible for reduction reaction and nitrogen transformation in rice paddy soil were revealed. The resilience of soil microbial community to the volcanic eruption impact was revealed and the detailed picture of soil microbial genetic response to the long-term application of livestock liquid manure was obtained.
期刊论文(65)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Characterization of soil microbial community in the early soil ecosystem in Miyake Island, Japan
日本三宅岛早期土壤生态系统土壤微生物群落特征
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [Yong Guo, Reiko Fujimura, Ken Hosokawa, Yoshinori Sato, Tomoyasu Nishizawa, Takashi Kamijo, and Hiroyuki Ohta]
通讯作者： and Hiroyuki Ohta
微生物多様性研究の現状と可能性：土壌微生物研究からの考察
微生物多样性研究现状与潜力：土壤微生物研究的思考
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： [安高 慎也,高梨 翼, 小林 幹佳, 足立 泰久, 小林勇喜, 太田寛行，藤村玲子]
通讯作者： 太田寛行，藤村玲子
三宅島 2000 年噴火堆積物から分離された鉄 酸化細菌 Leptospirillum ferrooxidans C2-3 株の ゲノム解析
从 2000 年三宅岛火山喷发的沉积物中分离出的铁氧化细菌氧化亚铁钩端螺旋菌 C2-3 的基因组分析
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [藤村玲子,佐藤嘉則,細川研,西澤智康, 大島健志朗,服部正平,上條隆志,太田寛行]
通讯作者： 大島健志朗,服部正平,上條隆志,太田寛行
不耕起畑地土壌より分離した糸状菌株の亜酸化窒素生成活性
免耕田土壤丝状真菌菌株一氧化二氮的产生活性
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [Kimikazu Sasa, et al., 加藤内藏進, 赤池恵・鶴田和人・佐藤嘉則・西村歩・小松崎将一・太田寛行]
通讯作者： 赤池恵・鶴田和人・佐藤嘉則・西村歩・小松崎将一・太田寛行
共 45 条
    Elucidation of the processes of N retention and emission through nitrite and nitric oxide in forest soils
    • 批准号：
      25550009
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.5万
    • 财政年份：
      2013
    • 负责人：
      SENOO Keishi
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    Phylogenetic and functional analysis of key denitrifiers in rice paddy soil : towards community genomics of soil microorganisms
    • 批准号：
      19380041
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $12.65万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      SENOO Keishi
    • 依托单位：
      The University of Tokyo