Rice proteome analysis as a post-genome project research
Rice proteome analysis as a post-genome project research
批准号:
12460004
负责人:
HIRANO Hisashi
金额:
$9.34万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 2003
中文摘要
为了有效地分析水稻蛋白质组,本研究发展了多种分析技术。这些技术包括蛋白质凝胶内消化,肽图谱,质谱鉴定的蛋白质分离的二维电泳,鸟枪分析的蛋白质分离的SDS凝胶电泳,检测磷酸化蛋白质,电泳的高分子量蛋白质,蛋白质-蛋白质相互作用分析与一种新的蛋白质芯片。利用该技术对水稻种胚蛋白质组进行了全面的分析。在这项分析中,我们鉴定了许多功能未知的蛋白质。为了获得这些蛋白质的功能信息,我们对它们进行了表达谱分析,并鉴定了几种与发芽相关的蛋白质。另一方面,我们分析了大型蛋白质复合物26 S蛋白酶体,以确定蛋白质翻译后修饰的作用,以获得蛋白质组分析的基础信息。将双向电泳图谱和单个胚胎蛋白质的特征编入我们的蛋白质组数据库。
英文摘要
To analyze efficiently the rice proteome, we developed various analytical techniques in the present study. These include techniques for protein in-gel digestion, peptide mapping, mass spectrometry for identification of proteins separated by two-dimensional electrophoresis, shot-gun analysis of proteins separated by SDS gel electrophoresis, detection for phosphorylated proteins, electrophoresis for high molecular weight proteins, and protein-protein interaction analysis with a novel protein chip. Using the developed techniques, we analyzed comprehensively the rice seed embryo proteome. In this analysis, we identified many proteins without known functions. To obtain the information of functions of these proteins, we performed expression profiling of them, and we identified several proteins, which expressed in relation to germination. On the other hand, we analyzed a large protein complex, 26S proteasome to determine the roles of protein post-translational modifications to obtain fundamental information for proteome analysis. The two-dimensional electrophoresis pattern and the characteristics of individual embryo protein were compiled in our proteome database.
期刊论文(344)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Yoshida, Y.: "E3 ubiquitin-ligase that recognizes sugar chains."Nature. 418. 438-442 (2002)
Yoshida, Y.:“识别糖链的 E3 泛素连接酶。”《自然》。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
A novel PVDF membrane for on-membrane identification of gel-resolved proteins by mass spectrometry
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批准号:20310121
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$12.48万
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财政年份:2008
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负责人:HIRANO Hisashi
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依托单位:
Comprehensive analysis of protein interactions for determination of protein function in rice
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批准号:16380010
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$10.18万
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财政年份:2004
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负责人:HIRANO Hisashi
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依托单位:
Simulation of re-differentiation of plants by transformation using a hormone-like peptide gene
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批准号:09460005
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$6.91万
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财政年份:1997
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负责人:HIRANO Hisashi
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依托单位:
国内基金
海外基金
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子宫内膜间质与巨噬细胞之间通过Protein S-MerTK-Apelin信号对
话促进子宫腺肌病蜕膜化缺陷的机制研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2024
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负责人:吕海宁
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批准号:32372636
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负责人:
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负责人:董春海
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批准号:32101754
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批准年份:2021
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帽结合蛋白(cap binding protein)调控乙烯信号转导的分子机制
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负责人:董春海
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资助金额:58.0万元
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批准年份:2020
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负责人:李祥敏
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依托单位:
锌指蛋白33B(Zinc finger protein 33B, ZNF33B)抑制乙型脑炎病毒复制的功能与分子机制研究
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批准号:--
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项目类别:--
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资助金额:58万元
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批准年份:2020
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负责人:李祥敏
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