島嶼部東南アジア人の集団形成に関するDNA指標による解析
島嶼部東南アジア人の集団形成に関するDNA指標による解析
批准号:
15570192
负责人:
数藤 由美子
金额:
$2.05万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004
中文摘要
本年度においては、島嶼部東南アジア地域の特殊な自然条件への適応にともなう遺伝的小進化について、DNA指標を用いた解析をおこなうこととした。脂質代謝に関わるDNA指標として、文献上既に制限酵素断片長の多型性(RFLP)が示唆されているアドレナリン受容体β3(ADRB3)遺伝子に着目し、インドネシアのセラム島、小スンダ列島(フローレス島)、スラウェシ島の3集団、フィリピン先住民のネグリトの複数の部族(ミンダナオ島のママヌワ、ルソン島のアエタなど7集団)、およびそれらの周辺集団から採取した血液試料より得たDNAサンプル(1集団当たり約100人)を対象に、エクソン1内にみられる1塩基置換によるRFLPを電気泳動法によって調べた。ところが文献にみられないサイズのDNA断片が多数見出されたため、全固体について対象のゲノム領域の塩基配列を決定するとともに、代表的なタイプの固体についてはエクソン1全長(5'-UTRからイントロン1まで)の塩基配列を決定した。さらにヒトと最も近縁なチンパンジーのDNAサンプル(20固体)についてもエクソン1の塩基配列決定をおこない、比較ゲノム解析をおこなった。その結果、まだ知られていない1塩基多型が少なくとも4種類見出され、既知の1塩基多型を含め、チンパンジーではホモ接合の固体が存在することが明らかとなった。環境への適応に有利であった可能性があり、また地理的に隔離された集団で偶然生じ広まったとも考えられる。
英文摘要
本年度においては、島嶼部東南アジア地域の特殊な自然条件への適応にともなう遺伝的小進化について、DNA指標を用いた解析をおこなうこととした。脂質代謝に関わるDNA指標として、文献上既に制限酵素断片長の多型性(RFLP)が示唆されているアドレナリン受容体β3(ADRB3)遺伝子に着目し、インドネシアのセラム島、小スンダ列島(フローレス島)、スラウェシ島の3集団、フィリピン先住民のネグリトの複数の部族(ミンダナオ島のママヌワ、ルソン島のアエタなど7集団)、およびそれらの周辺集団から採取した血液試料より得たDNAサンプル(1集団当たり約100人)を対象に、エクソン1内にみられる1塩基置換によるRFLPを電気泳動法によって調べた。ところが文献にみられないサイズのDNA断片が多数見出されたため、全固体について対象のゲノム領域の塩基配列を決定するとともに、代表的なタイプの固体についてはエクソン1全長(5'-UTRからイントロン1まで)の塩基配列を決定した。さらにヒトと最も近縁なチンパンジーのDNAサンプル(20固体)についてもエクソン1の塩基配列決定をおこない、比較ゲノム解析をおこなった。その結果、まだ知られていない1塩基多型が少なくとも4種類見出され、既知の1塩基多型を含め、チンパンジーではホモ接合の固体が存在することが明らかとなった。環境への適応に有利であった可能性があり、また地理的に隔離された集団で偶然生じ広まったとも考えられる。
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Sakate R, Suto Y, Hirai M他: "Analysis of 5'-end sequences of chimpanzee cDNAs."Genome Research. 13. 1022-1026 (2003)
Sakate R、Suto Y、Hirai M 等人:“黑猩猩 cDNA 5 端序列的分析”。基因组研究 13. 1022-1026 (2003)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
坂手龍一, 数藤由美子, 平井百樹: "ヒトとチンパンジーの遺伝子構成の異同を探る"バイオサイエンスとインダストリー. 61. 11-16 (2003)
Ryuichi Sakate、Yumiko Kazuto、Momiki Hirai:“探索人类和黑猩猩基因构成的差异”《生物科学与工业》61. 11-16 (2003)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
DOI:
10.1016/j.biopsych.2004.11.022
发表时间:
2005-02-15
期刊:
BIOLOGICAL PSYCHIATRY
影响因子:
10.6
作者:
[Aoki-Suzuki, M, Yamada, K, Yoshikawa, T]
通讯作者:
Yoshikawa, T
Suto Y, Ishikawa Y, Hirai M他: "Gene arrangement at the Rhesus blood group locus of chimpanzees detected by fiber-FISH."Cytogenetics and Genome Research. 101. 161-165 (2003)
Suto Y、Ishikawa Y、Hirai M 等人:“通过纤维 FISH 检测黑猩猩恒河猴血型基因座的基因排列”。细胞遗传学和基因组研究 101. 161-165 (2003)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Suto Y, Ishida T, Hirai M: "Multicolor karyotyping of six Old World monkey species."CYTOLOGIA. 68. 431-436 (2003)
Suto Y、Ishida T、Hirai M:“六种旧世界猴种的多色核型分析。”细胞学。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
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