全ゲノム塩基配列情報に基づく根粒菌の共生機構の解明

基于全基因组序列信息阐明根瘤菌共生机制

• 批准号: 15638002
• 负责人: 南澤 究
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15638002/
• 关键词: 根粒菌; 共生; ゲノム; マメ科植物; ライブラリー; 環境保全; データベース

本調査の目的は、根粒菌とマメ科植物の共生機構および生態を根粒菌ポストゲノム解析により明らかにする総合的な戦略を練り、食糧生産および環境保全に資する共生科学を創成することにある。8月12-13日に仙台において、ワークショップ「根粒菌のポストゲノム研究の展開」を開催し、数回の打合せ行い、以下のような項目について調査を行った。1)モデルマメ科植物分子遺伝解析に対応したミヤコグサ根粒菌の戦略の検討:根粒菌の遺伝子が宿主植物側の共生受容系や防御応答系とどのような相互作用を通じて共生成立に至るのかという点を、モデルマメ科植物ミヤコグサの分子遺伝解析タイアップしながら進行させる必要がある。既に共同研究として論文発表した網羅的な遺伝子発現解析・破壊株の共生特性の解析以外に、CalcofluorやTn-phoA変異などの根粒菌の細胞膜構造、分泌タンパク、多糖生産の変異株が、相互作用機構解明に適したアプローチ方法であると結論された。2)ダイズ根粒菌のアレイ解析・ライブラリー構築利用の基本戦略の策定:ミヤコグサ根粒菌と同様に整列化コスミッドライブラリーが、品種特異的共生因子の同定に有効であると判断された。また、ミヤコグサ根粒菌で使用したマクロアレイ系のダイズ根粒菌への適用は、クローンの選択・RNA抽出方法などの改善が必要であると考えられた。3)食糧生産および環境保全への応用:根粒菌ゲノム情報から難分解物質分解系遺伝子、脱窒遺伝子群は、根粒菌接種に環境保全への付加価値をつけ、また機能性遺伝子導入根粒菌による共生環境修復への発展性が期待された。また、グリシンベタインによる浸透圧(塩)耐性、乾燥耐性は、応用研究に有効であると考えられた。野外利用はセルフクローニング系が有望であった。4)クローン管理およびデータベース構築:データベース構築・公開は大阪大学で、クローン管理は東北大学と東京農工大学で共同で行うこととした。

这项研究的目的是制定一项综合策略，以通过根瘤菌后的根瘤菌分析来阐明根茎和豆类的共生机制和生态，并创建一种共生科学，以有助于粮食生产和环境保护。 8月12日至13日在仙台举行了一个名为“根本基因组研究的研究”研讨会，并举行了一些讨论，以调查以下项目。 1）研究根瘤菌对模型豆类的分子遗传分析的策略：有必要通过绑定模型豆类的分子遗传分析来进行，以查看根瘤基因如何与宿主植物植物群共生式响应系统和防御系统进行融合，同时还可以链接到Motal note note Legers legeles legeles legmumy legemem legeles legeles legmumys note legeles legmumys note legmumys。除了已经作为联合研究发表的破坏菌株的全面基因表达分析和共生特性外，还得出结论，在细胞膜结构，分泌蛋白和细胞膜结构中的钙氟和TN-PHOA突变之类的突变体，类分泌蛋白，以及根瘤菌产生的根瘤菌的生产是适当的方法。 2）建立用于使用大豆根瘤菌阵列分析和图书馆构建的基本策略：确定对齐的宇宙库有效地鉴定出类似于多根的综合因素，类似于根瘤菌。此外，人们认为，根瘤菌中使用的宏观阵列类型的应用在大豆根瘤菌中需要改善克隆和RNA提取方法的选择。 3）适用于食品生产和环境保护：从根瘤菌基因组信息中，难以分解的基因和反硝化基因的基因有望在根瘤菌接种中为环境保护增加价值，预计可以通过传输基因来改善共生环境修复的发展。此外，被甘氨酸甜菜碱引起的渗透压（盐）耐药性和抗旱性被认为在应用研究中有效。自我克服系统对于户外使用是有希望的。 4）克隆管理和数据库构建：数据库的构建和出版物将由大阪大学进行，克隆人管理将由东北大学和东京农业大学共同进行。