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Formulation of management units in areas of black bear extermination and evaluation of harmful genes in endangered populations

黑熊灭绝地区管理单元的制定及濒危种群有害基因评价

基本信息

批准号：
22H02370
负责人：
大西尚樹
金额：
$ 11.07万
依托单位：
Forest Research and Management Organization
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02370/
关键词：
ツキノワグマ景観遺伝学保全遺伝学

项目摘要

本州におけるツキノワグマの遺伝構造を明らかにした。マイクロサテライトDNA16遺伝子座を用いて各地で捕獲された個体の遺伝子型を決定し、STRUCTURE解析を行ったところ16程度の地域集団が推定された。特に日本アルプスによる東西の分岐と、岩手県における北上山地の遺伝的な独自性が明らかになった。また、日本アルプス周辺では日本海側から南方方面へ、岩手県では北上山地から奥羽山系への東方面へ同種が進出していった経緯が推定された。集団の遺伝構造に与えるオスの影響を明らかにするために、Y染色体上のマイクロサテライトマーカーの開発に着手した。すでに公開されている韓国および四国のオスのツキノワグマの全ゲノム配列から、Y染色体上の変異を特定した。そして、Y染色体上の230のマイクロサテライト領域を選抜し、そのうちの108遺伝子座においてプライマーを作成した。また、他種での変異を調べるために国内の動物園からホッキョクグマ、マレーグマの血液サンプル、および北海道の野生のヒグマの組織サンプルを入手した。絶滅が危惧されている四国のツキノワグマ個体群の有害変異蓄積量を推定するために、四国で捕獲された4頭（雌雄2頭ずつ）の全ゲノム解析を行った。比較対象として、本州の8個体（雌雄4頭ずつ）の全ゲノム解析も同時に行った。さらに、すでに公開されている四国の1個体と中国大陸由来の3個体の全ゲノム配列データを用いて予備解析を行ったところ、四国の個体は大陸由来の個体に比べて個体内のヘテロ接合度が極めて低いことが明らかになった。

This is the first time The DNA16 gene loci were used to determine the gene types of individuals captured in different regions, and the structure analysis was carried out to determine the gene types of individuals in different regions. In particular, Japan's East and West Divisions, Iwate Divisions, and Kitami Mountains are independent. Japan's sea side, south side, Iwate's mountain system, east side, and east side are presumed to be the same. The development of the gene structure of the cluster and the effect of the gene on the Y chromosome The four countries have different chromosome types. The 230th chromosome of the Y chromosome was selected and the 108th chromosome was created. The zoo in China started with a variety of animal species, such as Extinction of four species (male and female) was estimated and analyzed. 8 individuals in Honshu (4 males and 4 females) were analyzed simultaneously. 1 individual of the four countries and Chinese mainland origin 3 individual of the four countries and mainland origin 1 individual of the four countries and mainland origin 3 individual of the four countries and mainland origin 3 individual of the four countries and mainland origin 3 individual of the four countries