腸内細菌叢と宿主DNAマーカーによる新規ブタ育種基盤の構築

利用肠道菌群和宿主DNA标记构建新型生猪育种平台

• 批准号: 22H02492
• 负责人: 上本 吉伸
• 金额: $ 11.4万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02492/
• 关键词: 腸内細菌叢; SNP; ブタ育種; 予測モデル; 遺伝率; ホストジェネティクス; ブタ

本研究では、ブタにおける産肉形質の改良速度を高めるため、宿主のゲノム情報と腸内細菌叢の情報を組み込んだ新たな育種価予測モデルを開発し、腸内細菌叢と家畜育種学を融合した新規ブタ育種基盤を構築することを目的としている。本研究では、三元交雑豚の止め雄として利用されるデュロック純粋種を対象に、最終的に約1000頭のサンプルを用いた解析を目標としている。2022年度では、解析に必要なサンプル収集を図ることが主な課題であり、産肉形質の記録、SNP遺伝子型判定用のDNAサンプルの収集、菌叢解析用の糞便サンプルの収集を行った。糞便サンプルは、直接能力検定修了時にサンプリングを行い、2021年度までのサンプルと合わせて900頭以上のサンプルが得られた。このうち800頭について、得られた糞便サンプルから細菌DNAを抽出し、16S rRNA遺伝子可変領域の遺伝子配列を次世代シークエンサーによって解読した。得られた800頭の菌叢データを用いて、環境要因が菌叢組成に与える影響について調査した。その結果、本集団では、性、年次、季節、飼料区などの環境要因が菌叢組成に与える影響は少ないことが明らかとなり、個体間で見られる菌叢の違いが遺伝的な要因であることが期待された。2023年度では、引き続きサンプリングを行い、合計1000頭以上の糞便サンプルを確保するとともに、必要サンプルが得られ次第、遺伝解析を実施し、ホストジェネティクス、産肉形質、腸内細菌叢間の関係を明らかにする。

In this study, the speed of improvement of meat shape is very high, and that of host bacteria is very high. In this study, there is a high rate of improvement of meat shape in this study. In this study, the speed of meat shape improvement is very high in this study. In this study, the speed of improvement of meat shape is very high, and the new breed of bacteria in the host is not suitable for the purpose of animal breeding. In this study, three-way cross dolphin was used to analyze the target population by using several kinds of elephants, and the most important one was about 1000 yuan. In the year 2022, the main topic of the project, the meat shape record, the SNP sub-type was used to determine the DNA data set, and the bacterial analysis was used to analyze the bacteria. In the year of 2021, we have paid more than 900 years of service, and have made regular repairs in the year of 2021. The bacteria DNA was extracted from the bacteria, and the 16s rRNA was able to line up the next generation of bacteria. As a result, 800 percent of the bacteria must be used, and the environment should be affected by the composition of bacteria. The results of this series, sex, year, season, season and material area should be affected by the composition of bacteria and the effect that there is a significant difference between the results and the results, the results of this collection, sex, year, season, season and material area should be affected by the composition of bacteria. In the year 2023, there are more than 1000 consumer goods in total to make sure that the goods are in good condition, that the necessary products are in the first place, and that they are used in the market.

项目成果

デュロック純粋種における産肉形質に関するMicrobiabilityの推定

杜洛克纯种肉生产性状微生物的估计

• 发表时间: 2022
• 作者: Eun H;Yamazaki E;Pan Y;Taniyasu S;Noborio K;Yamashita N;Inui H;Nakano T;上本吉伸・本間智尋・廣瀬健右・伊藤哲也・上川舞・東間千芽・古川了一・北澤春樹・佐藤正寛
• 通讯作者: 上本吉伸・本間智尋・廣瀬健右・伊藤哲也・上川舞・東間千芽・古川了一・北澤春樹・佐藤正寛