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Mechanisms to define the structure, properties, and function of RNP biomolecular condensates

Mechanisms to define the structure, properties, and function of RNP biomolecular condensates
定义 RNP 生物分子缩合物的结构、性质和功能的机制
批准号:
22H02545
负责人:
山崎 智弘
金额:
$11.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31

项目摘要

项目成果

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細胞内相分離は、細胞内の混雑した環境で、特定の分子を集約した区画を作り上げることで、細胞内の様々なプロセスを潤滑に進める重要な機構である。本研究では、RNAが相分離により誘導する非膜性構造体がどのように働くのかを明らかにすることを目的にしている。そのため、RNAによって誘導される代表的な非膜性構造体について、その形成機構を明らかにすることを計画している。本研究で目指す重要な目的の1つが、パラスペックルの形成原理であるミセル化の分子実体の解明である。パラスペックルはこのミセル化の機構を介してコアシェル構造を持つ形態を作ることができる。この解明のために重要なのが、シェルを構成するタンパク質が何かという点である。本年度の解析から、このシェルを構成するタンパク質の同定に成功した。もう1つの本研究の重要な課題は、細胞内相分離の誘導に関わるタンパク質の同定および解析である。ここで使用するのが、独自に確立した人工非膜性構造体実験系である。まず、この系を用いて、核内ストレス体(nSB)の形成に関わるタンパク質の同定を試みた。nSBの主要な構成タンパク質について、相分離誘導活性を調べ、その結果、複数の相分離誘導活性を有するnSB構成タンパク質を同定した。加えて、変異体を用いた解析により、形成に関わるメカニズムも明らかになった。さらに、こうして同定したタンパク質のnSBの形成に対する影響を解析するため、ノックアウト細胞株を樹立した。また、nSBに加えて、SARS-CoV-2 Nucleocapsid(N)タンパク質が形成するviral RNPの形成機構についても解析を進めており、Nタンパク質の必要なドメインの同定およびそのドメインに結合するタンパク質を同定した。
期刊论文(14)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Hirose Lab (RNA生体機能研究室)
广濑实验室(RNA生物功能实验室)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
DOI: 10.1007/978-1-0716-2380-0_22
发表时间: 2022
期刊: Methods Mol. Biol.
影响因子: --
作者: [R. Tripathi, D. T. Adroja, C. Ritter, S. Sharma, C. Yang, A. D. Hiller, M. M. Koza, F. Demmel, A. Sundaresan, S. Langridge, W. Higemoto, T. U. Ito, A. M. Strydom, G. B. G. Stenning, A. Battacharyya, D. Keen, H. C. Walker, R. S. Perry, R. Pratt, Q. Si, T. , Tokuro Shimokawa, Tomohiro Yamazaki]
通讯作者: Tomohiro Yamazaki
Biomolecular condensates scaffolded by RNAs: towards their theoretical and systematic understandings
RNA 支架的生物分子凝聚体:对其理论和系统的理解
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Tomohiro Yamazaki, Tetsuya Yamamoto, Hyura Yoshino, Hiro Takakuwa, Sylvie Souquere, Wakana Isshiki, Mizuki Iwata, Rie Doi, Shinichi Nakagawa, Gerard Pierron, Tetsuro Hirose]
通讯作者: Tetsuro Hirose
RNAを設計図とする非膜オルガネラの形成原理
以RNA为蓝本的非膜细胞器的形成原理
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [山崎 智弘, 山本 哲也, 吉野 彪羅, 高桑 央, Sylvie Souquere, 土井 理恵, 岩田 瑞季, 一色 和奏, 中川 真一, Gerard Pierron, 廣瀬 哲郎]
通讯作者: 廣瀬 哲郎
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    非膜性RNP構造体の構造・物性・機能を規定する基盤メカニズムの解明
    • 批准号:
      23K23809
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $3.58万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      山崎 智弘
    • 依托单位:
    Regulatory mechanism of gene expression by membraneless organelles formed through micellization
    • 批准号:
      23K18112
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额:
      $4.16万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      山崎 智弘
    • 依托单位:
    プリオン様ドメインとRNAを介した核内構造体構築機構の解明
    • 批准号:
      26891001
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
    • 资助金额:
      $0.92万
    • 财政年份:
      2014
    • 负责人:
      山崎 智弘
    • 依托单位:
    海外基金