Regulatory modules for sperm cell differentiation and functioning in basal land plants and their evolution
Regulatory modules for sperm cell differentiation and functioning in basal land plants and their evolution
批准号:
22H02646
负责人:
荒木 崇
金额:
$11.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31
中文摘要
研究項目1 DUO1およびRWP1のCitrine knock-in株から Citrine蛍光ポジティブの造精器を摘出し、ChIPseq解析をおこない、両転写因子が精細胞分化過程で結合しているゲノム上の領域に関する良質の知見を得た。変異体における発現解析の結果と合わせて、DUO1によるRWP1遺伝子の、RWP1による3つの精細胞特異的H1バリアント遺伝子の直接的な制御が強く支持された。DUO1とRWP1の一過発現アッセイ実験については、系そのものは機能しているが、ポジティブな結果を得ることができなかった。DUO1あるいはRWP1の他にも必要な因子があると考えられる。被子植物ではこれまで全く見落とされていたRWP1および精細胞特異的と考えられるH1バリアント遺伝子を見出し、変異体の作出に着手した。DN4MT1A,B遺伝子の完全欠失変異体の精細胞の透過型電子顕微鏡観察からは、同遺伝子の精子核凝縮における役割を支持する結果は得られなかった。精細胞特異的な small RNA経路に関しては、隣接して存在するMpPIWIA, MpPIWIB遺伝子、第6染色体に座乗するPHAS遺伝子座のそれぞれの完全欠失変異体の作出に着手した。研究項目2 KNOX1遺伝子座の逆鎖からの lnc RNA転写(SUK1)を介した発現抑制に関しては、SUK1プロモータ上のRWP1結合モチーフを欠失させた変異体を2株取得した。その後得られたRWP1のChIPseqデータから欠失領域が不十分であることが考えられたため、新たな欠失変異体の作出を進めている。関連して、DUO1依存の精細胞特異的な選択的スプライシングの制御に関して、RNAseqデータの検証、MBNL遺伝子の変異体作出、RWP1-Citrine knock-in株用いた精細胞分化期の造精器の Iso-seq解析のためのサンプリングなどをおこなった。
英文摘要
研究項目1 DUO1およびRWP1のCitrine knock-in株から Citrine蛍光ポジティブの造精器を摘出し、ChIPseq解析をおこない、両転写因子が精細胞分化過程で結合しているゲノム上の領域に関する良質の知見を得た。変異体における発現解析の結果と合わせて、DUO1によるRWP1遺伝子の、RWP1による3つの精細胞特異的H1バリアント遺伝子の直接的な制御が強く支持された。DUO1とRWP1の一過発現アッセイ実験については、系そのものは機能しているが、ポジティブな結果を得ることができなかった。DUO1あるいはRWP1の他にも必要な因子があると考えられる。被子植物ではこれまで全く見落とされていたRWP1および精細胞特異的と考えられるH1バリアント遺伝子を見出し、変異体の作出に着手した。DN4MT1A,B遺伝子の完全欠失変異体の精細胞の透過型電子顕微鏡観察からは、同遺伝子の精子核凝縮における役割を支持する結果は得られなかった。精細胞特異的な small RNA経路に関しては、隣接して存在するMpPIWIA, MpPIWIB遺伝子、第6染色体に座乗するPHAS遺伝子座のそれぞれの完全欠失変異体の作出に着手した。研究項目2 KNOX1遺伝子座の逆鎖からの lnc RNA転写(SUK1)を介した発現抑制に関しては、SUK1プロモータ上のRWP1結合モチーフを欠失させた変異体を2株取得した。その後得られたRWP1のChIPseqデータから欠失領域が不十分であることが考えられたため、新たな欠失変異体の作出を進めている。関連して、DUO1依存の精細胞特異的な選択的スプライシングの制御に関して、RNAseqデータの検証、MBNL遺伝子の変異体作出、RWP1-Citrine knock-in株用いた精細胞分化期の造精器の Iso-seq解析のためのサンプリングなどをおこなった。
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ゼニゴケ配偶子器の発生におけるMpBZR3の役割
MpBZR3 在苔类配子发生中的作用
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[古谷 朋之, 三枝 菜摘, 山岡 尚平, 島津 舜治, 山本 千愛, 石崎 公庸, 西浜 竜一, 河内 孝之, 福田 裕穂, 笠原 賢洋, 荒木 崇, 近藤 侑貴]
通讯作者:
近藤 侑貴
ゼニゴケの生活環におけるMpMS1の機能解析
MpMS1在地钱生命周期中的功能分析
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[三枝 菜摘, 國本 完, 肥後 あすか, 神原 泉, 冨田 由妃, 井上 佳祐, 山岡 尚平, 荒木 崇]
通讯作者:
荒木 崇
DOI:
10.1016/j.celrep.2022.111059
发表时间:
2022-07-12
期刊:
CELL REPORTS
影响因子:
8.8
作者:
[Torii, Kotaro, Inoue, Keisuke, Endo, Motomu]
通讯作者:
Endo, Motomu
ゼニゴケの生活環において多面的に機能する転写因子MpLRLの発現解析
MpLRL(一种在苔草生命周期中发挥多效性作用的转录因子)的表达分析
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[樅木 亮介, 齊藤 美咲, 吉竹 良洋, 井上 佳祐, 河内 孝之, 荒木 崇, 山岡 尚平]
通讯作者:
山岡 尚平
コケ配偶体と花粉における生殖細胞分化の理解と制御に向けて
理解和控制苔藓配子体和花粉的生殖细胞分化
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山岡尚平, 海老根一生, 齊藤美咲, 樅木亮介, 吉竹良洋, 上田貴志, 光田展隆, 西浜竜一, 荒木崇, 河内孝之]
通讯作者:
河内孝之
共 11 条
基部陸上植物を用いた精細胞分化を担う制御モジュールとその進化の研究
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批准号:23K23909
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2024
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负责人:荒木 崇
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依托单位:
メリステムの維持と相転換の機構の解析
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批准号:14036219
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$45.57万
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财政年份:2002
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负责人:荒木 崇
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依托单位:
シロイヌナズナAGL6遺伝子の胚珠の形態形成における役割の遺伝解剖学的研究
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批准号:10158207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1998
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负责人:荒木 崇
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依托单位:
シロイヌナズナAGL6遺伝子の胚珠の形態形成における役割の遺伝解剖学的研究
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批准号:09262208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1997
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负责人:荒木 崇
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依托单位:
シロイヌナズナAGL6遺伝子の胚株の形態形成における役割の遺伝解剖学的研究
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批准号:08273210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:荒木 崇
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依托单位:
シロイヌナズナの花成誘導に関与する遺伝子の分子遺伝学的研究
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批准号:08740616
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1996
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负责人:荒木 崇
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依托单位:
高等植物の生殖成長過程の遺伝的制御機構の研究
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批准号:02954002
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (Research Fellowship)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1990
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负责人:荒木 崇
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依托单位: