病原体との共進化過程がもたらす群集の多様性と有性生殖の維持
病原体との共進化過程がもたらす群集の多様性と有性生殖の維持
批准号:
03269215
负责人:
佐々木 顕
金额:
$1.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1991
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1991 至 --
中文摘要
病原体が寄主の進化にどういう影響を与えるかという観点から、今年度は(1)寄主免疫系の遺伝子の進化速度や分岐時間について、(2)病原体との相互作用によって寄主遺伝子の地理的分布がどう影響されるか、さらに(3)空間構造をもつ集団における寄主・病原体の個体群動態などの理論的な研究を行った。(1)免疫系遺伝子の進化 病原体との相互作用によって平衡淘汰が働く寄主免疫系遺伝子(MHC抗原遺伝子など)の進化を調べるため、遺伝子頻度変化を記述する多次元拡散過程を飛躍型マルコフ過程で近似する手法を取り入れたモデルで解析した。これによって抗原決定座位の進化速度や対立遺伝子の分岐時間など検証可能で現在注目を集めている諸量につての解析的結果を得た。(2)上記研究の拡張として、地理的構造をもつ集団における病原体・寄主の遺伝子特異的な疫学的相互作用を取り入れた個体群動態モデルを解析した。2倍体の寄主の個々の対立遺伝子が病原体の特異的感染のタ-ゲットとなる場合、寄主遺伝子頻度の非一様な地理的分布が出現すること、逆に寄主の対立遺伝子群が個々の病原体に対する抵抗性をコ-ドする場合には、各地で地理的には一様な多型が生じることなどを明らかにした。(3)さらに病原体が空間構造をもつ寄主集団に侵入する過程を、格子モデルを用いた精密なモデルで解析した。修正デカップリング近似やモンテカルロ・シミュレ-ションによる解析によって、病原体の侵入が可能になる臨界伝染率の空間構造依存性を明らかにしたほか、病原体の蔓延によって(集団サイズが無限でも)寄主集団が絶滅するパラメ-タ領域が存在することを理論的に初めて示すことができた。
英文摘要
病原体が寄主の進化にどういう影響を与えるかという観点から、今年度は(1)寄主免疫系の遺伝子の進化速度や分岐時間について、(2)病原体との相互作用によって寄主遺伝子の地理的分布がどう影響されるか、さらに(3)空間構造をもつ集団における寄主・病原体の個体群動態などの理論的な研究を行った。(1)免疫系遺伝子の進化 病原体との相互作用によって平衡淘汰が働く寄主免疫系遺伝子(MHC抗原遺伝子など)の進化を調べるため、遺伝子頻度変化を記述する多次元拡散過程を飛躍型マルコフ過程で近似する手法を取り入れたモデルで解析した。これによって抗原決定座位の進化速度や対立遺伝子の分岐時間など検証可能で現在注目を集めている諸量につての解析的結果を得た。(2)上記研究の拡張として、地理的構造をもつ集団における病原体・寄主の遺伝子特異的な疫学的相互作用を取り入れた個体群動態モデルを解析した。2倍体の寄主の個々の対立遺伝子が病原体の特異的感染のタ-ゲットとなる場合、寄主遺伝子頻度の非一様な地理的分布が出現すること、逆に寄主の対立遺伝子群が個々の病原体に対する抵抗性をコ-ドする場合には、各地で地理的には一様な多型が生じることなどを明らかにした。(3)さらに病原体が空間構造をもつ寄主集団に侵入する過程を、格子モデルを用いた精密なモデルで解析した。修正デカップリング近似やモンテカルロ・シミュレ-ションによる解析によって、病原体の侵入が可能になる臨界伝染率の空間構造依存性を明らかにしたほか、病原体の蔓延によって(集団サイズが無限でも)寄主集団が絶滅するパラメ-タ領域が存在することを理論的に初めて示すことができた。
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Sasaki,A: "Pathogen Pressure on The Geographical Differentiation of Host Genes." manuscript. (1992)
Sasaki,A:“病原体压力对宿主基因地理分化的影响。”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Sasaki,A.and Iwasa,Y.: "Optimal Growth Schedule of Pathogens within A Host:Switching Between Lytic and Latent Cycles." Theor.Pop.Biol.39. 201-239 (1991)
Sasaki, A. 和 Iwasa, Y.:“宿主内病原体的最佳生长时间表:裂解周期和潜伏周期之间的切换。”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Inutsuka,H.,Matsuda,H.,and Sasaki,A.: "Evolutionary Mechanisms Acting on The Evolution of Major Histocompatibility Complex Multigene Family." manuscript. (1992)
Inutsuka, H.、Matsuda, H. 和 Sasaki, A.:“作用于主要组织相容性复杂多基因家族进化的进化机制”。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Sasaki,A.: "The Evolution of Host and Pathogen Genes under Epidemiological Interaction.In“Proceeding of the 17th Taniguchi international Symposium on Population PaleoーGenetics"" Springer,New York, (1992)
Sasaki, A.:“流行病学相互作用下宿主和病原体基因的进化。见“第 17 届谷口国际人口古遗传学研讨会论文集””Springer,纽约,(1992 年)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Matsuda,H.,Ogita,N.,Sasaki,A.and K.: "The Lattice LotkaーVolterra Model." Prog.Theor.Physics. (1992)
Matsuda, H.、Ogita, N.、Sasaki, A. 和 K.:“格子 Lotka-Volterra 理论”(1992 年)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 6 条
進化疫学の新概念「メタR0」を用いた病原体の免疫逃避プロセスの研究
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批准号:23K27218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$5.82万
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财政年份:2024
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负责人:佐々木 顕
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依托单位:
A new concept in evolutionary epidemiology, meta-R0, on immune escape of pathogens.
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批准号:23H02527
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$8.99万
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财政年份:2023
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负责人:佐々木 顕
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依托单位:
Prediction of viral evolution trajectories on antigenic space using a stochastic immune escape model
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批准号:23K18150
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2023
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负责人:佐々木 顕
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依托单位:
ヒト腸内共生微生物叢の進化生態に関する理論的研究
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批准号:15F15777
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.19万
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财政年份:2015
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负责人:佐々木 顕
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依托单位:
変動環境における適応と多様性進化の理論的研究
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批准号:07854049
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1995
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负责人:佐々木 顕
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依托单位:
変動環境における適応と多様性進化の理論的研究
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批准号:06740582
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1994
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负责人:佐々木 顕
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依托单位:
共進化過程の数理的研究
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批准号:04854069
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1992
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负责人:佐々木 顕
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依托单位:
共進化過程の理論的研究
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批准号:03854078
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1991
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负责人:佐々木 顕
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依托单位:
共進化過程の数理的研究
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批准号:02854082
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1990
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负责人:佐々木 顕
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依托单位:
共進化動態の数理的研究
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批准号:01790301
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1989
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负责人:佐々木 顕
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依托单位:
海外基金