开发以分子进化为中心的遗传信息分析人工智能系统-猫眼课题宝

开发以分子进化为中心的遗传信息分析人工智能系统

批准号：

05254202

负责人：

安川民男

金额：

$1.28万

依托单位：

Tokyo University of Agriculture and Technology

依托单位国家：

日本

项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

财政年份：

1993

资助国家：

日本

项目状态：

已结题

起止时间：

1993 至 --

来源：

https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-05254202/

关键词：

蛋白質の立体構造予測分子進化蛋白質分解酵素パールネックレス・モデルスピングラス・モデル蛋白質の折りたたみ蛋白質の分子動力学殘基間相互作用

项目摘要

项目成果

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中文摘要

翻译

蛋白質の分子進化過程を直接追跡するための資料は存在しないことから,現存する各種生物中に存在する遺伝子や蛋白質の相同関係をそれぞれの生物の分類・系統学上の近縁関係との関連で議論することを基本としている。対象として生命維持上最も基本的な酵素の一つである蛋白質分解酵素をとりあげ,金属プロテアーゼ,システィンプロテアーゼ,セリンプロテアーゼの相互関係を中心に検討をすすめてきた。一般に蛋白質中のアミノ酸殘基の変異が著しく起っても基本的機能が保たれている限りその3次元構造がよく保存されることから,各殘基の変異速度を立体構造や機能との関連で検討している.しかし3次元構造が明らかになっている蛋白質分解酵素の数は十分ではないことから,アミノ酸の配列情報からその3次元構造を予測するシステムの開発を平行して進めている。このための種々の方法がすでに多くの研究者により提案されているが,我々は蛋白質の折りたたみ過程をシミュレートする方法を採用し,このためのシミュレーション・モデルとしてパールネックレス・モデルを提案した.これは各殘基を球状要素で代表させそれらの間に疎水性相互作用とソフト反撥力が作用するとする簡略モデルであるが,低分子蛋白質ではかなりよい結果が得られている.しかし2次構造の予測はできないことから殘基間相互作用を各殘基対ごとに分子動力学計算によりパラメータ化して用いるスピングラス・モデルの開発が進行中である

英文摘要

期刊论文(4)

专著(0)

科研奖励(0)

会议论文

Junji IZUMISAWA: "Prediction of Protein Structure by Hopfield Algorithm II" Repts Progr.polymer phys.Japan. 36. 621-624 (1993)

Junji IZUMISAWA：“通过 Hopfield 算法 II 预测蛋白质结构”Repts Progr.polymer phys.Japan。

DOI： --

发表时间：

期刊：

影响因子： --

作者：

[]

通讯作者：

Takusato KARASAWA: "Development of simulation models for protein folding in a thermal annealing process I" Comput.Appl.Biosci.9. 243-251 (1993)

Takusato KARASAWA：“热退火过程中蛋白质折叠模拟模型的开发 I”Comput.Appl.Biosci.9。