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ミトコンドリアDNAゲノムの構造変化を指標とした後生動物の系統解析

以线粒体 DNA 基因组结构变化为指标的后生动物系统发育分析

基本信息

批准号：
07265203
负责人：
上島励
金额：
$ 1.15万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1995
资助国家：
日本
起止时间：
1995 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本年度は、ゲノム構造に著しい多様性の見られる軟体動物腹足綱に中心として研究を進め、腹足綱の上位分類群(亜綱)の系統解析を行った。有肺亜綱柄眼目に属するツクシマイマイと、後鰓亜綱としては最も原始的な上科に属するコシイノミガイについて、ミトコンドリアDNA(mtDNA)の全塩基配列を決定し、そのゲノムにコードされている全遺伝子を同定した。本研究によって明らかになった2亜綱のゲノム構造を前鰓亜綱のメガイアワビと比較し、腹足類のmtDNAの遺伝子配置について、分岐分類学的解析を行ったところ、前鰓亜綱が他の動物門と共通する原始的な配置を示すのに対し、有肺亜綱と後鰓亜綱は特殊化した派生的な遺伝子配置を多数共有していることが明らかになった。この結果は、有肺亜綱と後鰓亜綱が系統学的に近線であることを明確に示している。また、mtDNAにコードされている全蛋白質遺伝子の塩基配列を用いて、3亜綱の系統関係を解析したところ、やはり有肺亜綱と後鰓亜綱が単系統群をなすことが示され、遺伝子配置を指標とした系統解析の正当性が確認された。なお、3亜綱の主な上位分類群について、特徴的な遺伝子の境界領域をPCR法により増幅し、各亜綱内における遺伝子配置の変異を調べたところ、基本的な遺伝子配置には変化がなく、我々が全塩基配列を決定した材料は各亜綱の典型的な遺伝子配置を反映していることが確認された。また、系統学的位置に問題の多い異旋類のクチキレガイについては、ゲノム構造の一部を決定したところ、有肺亜綱や後鰓亜綱と共通する派生的な配置が認められたが、一方で、前鰓類に似た原始的な配置も見られた。この結果は、異旋類が有肺亜綱と後鰓亜綱の祖先に当たる原始的な分類群であり、異旋類が有肺亜綱や後鰓亜綱と共に単系統群をなすというHaszuprunarの分類体系を支持する。

This year, the study of gastropods in molluscs has been carried out, and the systematic analysis of gastropods has been carried out. The complete nucleotide sequence of DNA(mtDNA) is determined in the most primitive species of the genus, the genus, and the genus. In this study, the structure of the two classes is compared with that of the probranchia, the mtDNA genetic arrangement of the gastropods is analyzed, and the taxonomic analysis is carried out. The primitive genetic arrangement of the probranchia is shown to be common to other phyla. The genetic arrangement of the two classes is common to most of the other phyla. The result is that there are two classes of systematics: pulmonary and epibranchial, and the close line of systematics is clearly indicated. In addition, the sequence analysis of mtDNA sequences and the phylogenetic relationships between mtDNA sequences and mtDNA sequences were confirmed. The main taxa of the three classes are divided into three groups, and the boundary of the characteristic gene is determined by PCR method. The variation of the gene allocation within each class is adjusted. The basic gene allocation is changed. The total gene allocation is determined. The material is reflected in the typical gene allocation of each class. The position of systematics is determined by a part of the structure of the multi-species, which is similar to the original configuration of the lung and the posterior branch. These results support the classification system of Haszuprunar, which includes the primitive taxa of the ancestors of the classes Pulmonaria and Metaphania, and the common taxa of the classes Pulmonaria and Metaphania.