ミトコンドリアDNAゲノムの構造変化を指標とした軟体動物門腹足綱の系統解析

以线粒体 DNA 基因组的结构变化为指标对软体动物腹足动物门进行系统发育分析

基本信息

批准号：
07640923
负责人：
上島励
金额：
$ 1.47万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份：
1995
资助国家：
日本
起止时间：
1995 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

有肺亜綱柄眼目に属するシクシマイマイと、後鰓亜綱としては最も原始的な上科に属するコシイノミガイについて、ミトコンドリアDNA(mtDNA)の全塩基配列を決定し、そのゲノムにコードされている全遺伝子を同定した。本研究によって明らかになった2亜綱のゲノム構造を前鰓亜綱のメガイアワビと比較したところ、有肺亜綱と後鰓亜綱は非常によく似た特徴を示すのに対し、前鰓亜綱と他の2亜綱はゲノムサイズ、領域の特徴、遺伝子の配置などが著しく異なっていることが分かった。そこで、腹足類のmtDNAの遺伝子配置について、分岐分類学的解析を行ったところ、前鰓亜綱が他の動物門と共通する原始的な配置を示すのに対し、有肺亜綱と後鰓亜綱は特殊化した派生的な遺伝子配置を多数共有していることが明らかになった。この結果は、有肺亜綱と後鰓亜綱が系統学的に近縁であることを明確に示している。また、mtDNAにコードされている全蛋白質遺伝子の塩基配列を用いて、3亜綱の系統関係を解析したところ、やはり有肺亜綱と後鰓亜綱が単系統群をなすことが示され、両者が前鰓亜綱よりも近い関係にあることが確認される。なお、3亜綱の主な上位分類群について、特徴的な遺伝子の境界領域をPCR法により増幅し、各亜綱内における遺伝子配置の変異を調べたところ、基本的な遺伝子配置には変化がなく、我々が全塩基配列を決定した材料は各亜綱の典型的な遺伝子配置を反映していることが確認された。また、系統学的位置に問題の多い異旋類のクチキレガイについては、ゲノム構造の一部を決定したところ、有肺亜綱や後鰓亜綱と共通する派生的な配置が認められたが、一方で、前鰓類に似た原始的な配置も見られた。この結果は、異旋類が有肺亜綱と後鰓亜綱の祖先に当たる原子的な分類群であり、異旋類が有肺亜綱と後鰓亜綱と共に単系統群をなすというHaszuprunarの分類体系を支持する。

确定了属于肺部亚类亚类的Sycoeliaceae的线粒体DNA（mTDNA）的整个碱基序列，以及属于后g的最原始家族的Sycoeliaceae，以及整个基本dna（mtDNA）的基础序列（mTDNA）（mtDNA）的基因鉴定和所有基因均已鉴定出遗传。当比较该研究揭示的两个亚类的基因组结构与Progila中的Megai鲍鱼的基因组结构时，发现Progila和亚类的子类表现出非常相似的特征，但基因组大小，区域特征，其他亚类的基因位置显着不同。因此，我们对腹足动物mtDNA的遗传排列进行了分支分类分析，发现虽然Progilae Gilae表现出对其他动物门的原始排列，但亚pneumo和pneumogilae共享许多专业的衍生遗传遗传布置。该结果清楚地表明，肺炎和子部分在系统发育方面相关。此外，当使用mtDNA编码的整个蛋白质基因的基础序列分析三个亚类之间的系统发育关系时，表明肺炎和亚类的亚类形成单系列组，证实两者都靠近Progili的子类别。此外，对于三个亚类的主要上类群，通过PCR放大了独特基因的边界区域，以检查每个子类内遗传排列中的突变，并且可以证实，基本遗传排列没有变化，并且我们确定整个碱基序列的材料都反映了每个子分类的典型遗传布置。此外，当我们确定异晶的某些基因组结构（在系统发育位置存在许多问题）时，我们发现了一种与肺炎和后g的亚类共有的衍生布置，而同时也类似于摄影作品。该结果支持haszuprunar的分类系统，在该系统中，痔疮是代表亚par祖和亚群的祖先的原子类群，而痔疮构成了单属群体，以及亚par和pare和par。