ミトコンドリアDNAゲノムの構造変化を指標とした軟体動物門腹足綱の系統解析

以线粒体 DNA 基因组的结构变化为指标对软体动物腹足动物门进行系统发育分析

• 批准号: 07640923
• 负责人: 上島 励
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
• 财政年份: 1995
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1995 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-07640923/
• 关键词: ミトコンドリアDNA; 遺伝子配置; ゲノム構造; 分子進化; 系統解析; 軟体動物; 腹足綱

有肺亜綱柄眼目に属するシクシマイマイと、後鰓亜綱としては最も原始的な上科に属するコシイノミガイについて、ミトコンドリアDNA(mtDNA)の全塩基配列を決定し、そのゲノムにコードされている全遺伝子を同定した。本研究によって明らかになった2亜綱のゲノム構造を前鰓亜綱のメガイアワビと比較したところ、有肺亜綱と後鰓亜綱は非常によく似た特徴を示すのに対し、前鰓亜綱と他の2亜綱はゲノムサイズ、領域の特徴、遺伝子の配置などが著しく異なっていることが分かった。そこで、腹足類のmtDNAの遺伝子配置について、分岐分類学的解析を行ったところ、前鰓亜綱が他の動物門と共通する原始的な配置を示すのに対し、有肺亜綱と後鰓亜綱は特殊化した派生的な遺伝子配置を多数共有していることが明らかになった。この結果は、有肺亜綱と後鰓亜綱が系統学的に近縁であることを明確に示している。また、mtDNAにコードされている全蛋白質遺伝子の塩基配列を用いて、3亜綱の系統関係を解析したところ、やはり有肺亜綱と後鰓亜綱が単系統群をなすことが示され、両者が前鰓亜綱よりも近い関係にあることが確認される。なお、3亜綱の主な上位分類群について、特徴的な遺伝子の境界領域をPCR法により増幅し、各亜綱内における遺伝子配置の変異を調べたところ、基本的な遺伝子配置には変化がなく、我々が全塩基配列を決定した材料は各亜綱の典型的な遺伝子配置を反映していることが確認された。また、系統学的位置に問題の多い異旋類のクチキレガイについては、ゲノム構造の一部を決定したところ、有肺亜綱や後鰓亜綱と共通する派生的な配置が認められたが、一方で、前鰓類に似た原始的な配置も見られた。この結果は、異旋類が有肺亜綱と後鰓亜綱の祖先に当たる原子的な分類群であり、異旋類が有肺亜綱と後鰓亜綱と共に単系統群をなすというHaszuprunarの分類体系を支持する。

Eyes have lung 亜 steel handle に genus す る シ ク シ マ イ マ イ と, after the gill 亜 outline と し て は most も original な に genera す る コ シ イ ノ ミ ガ イ に つ い て, ミ ト コ ン ド リ ア DNA (mtDNA) の salt base full を decided し, そ の ゲ ノ ム に コ ー ド さ れ て い る totally survived 伝 を be し た. This study に よ っ て Ming ら か に な っ た 2 亜 outline の ゲ ノ ム gills 亜 outline before tectonic を の メ ガ イ ア ワ ビ と compare し た と こ ろ, lung 亜 classes after と gill 亜 は very に よ く like た, 徴 を shown す の に し seaborne, former gill 亜 classes と he の 2 亜 は ゲ ノ ム サ イ ズ, domain の 徴, heritage 伝 son の configuration な ど が the し く different な っ て い る こ と が points か っ た . そ こ で, snails の mtDNA の posthumous son 伝 configuration に つ い analytical line を っ て, branching taxonomic た と こ ろ, gill 亜 outline before him が の animal door と す る original な configuration を shown す の に し seaborne, lung 亜 classes after と gill 亜 は specialization し た な of derived 伝 child configuration を most common し て い る こ と が Ming ら か に な っ た. こ の results は, lung 亜 classes after と gill 亜 が systematics に nearly try で あ る こ と を に clearly shown し て い る. ま た, mtDNA に コ ー ド さ れ て い る all survived 伝 protein sequence の salt base matched with column を い て, 3 亜 classes の system masato を parsing し た と こ ろ, や は り have lung 亜 classes after と gill 亜 が 単 system group を な す こ と が shown さ れ, struck before が gill 亜 outline よ り も nearly い masato is に あ る こ と が confirm さ れ る. な お, 3 亜 outline の main な upper taxa に つ い て, な of 徴 伝 son の border areas を PCR method に よ り raised し, within each 亜 outline に お け る posthumous son 伝 configuration の - different を adjustable べ た と こ ろ な of, basic 伝 child configuration に は variations change が な く, I 々 が salt base full column を decided し た material は 亜 outline each の な of typical 伝 child configuration を reflect し て い る Youdaoplaceholder0 とが confirm された. Location に ま た, systematics の い more different spin class の ク チ キ レ ガ イ に つ い て は, ゲ ノ ム tectonic の a を decided し た と こ ろ, lung 亜 classes after や gill 亜 と common す る derived な configuration が recognize め ら れ た が, one party で, gill class before に like た original な configuration も see ら れ た. は こ の results, different spin が have lung 亜 classes after と gill 亜 の ancestors に when た る atom な taxa で あ り, different spin class が have lung 亜 classes after と gill 亜 と altogether に 単 system group を な す と い う Haszuprunar の classification system を support す る.

项目成果

K.Saitoh: "Preliminary data on restriction mapping and detection of length variation in Japanese flounder mitochondrial DNA" Aquaculture. 136. 109-116 (1995)

K.Saitoh：“日本比目鱼线粒体 DNA 限制性图谱和长度变异检测的初步数据”水产养殖。

馬渡 峻輔: "動物の自然史" 北海道大学図書刊行会, 274 (1995)

马渡俊辅：《动物的自然史》北海道大学图书出版协会，274（1995）

R.Ueshima: "Taxonomic position of Trochochlamys praealta(Pilsbry, 1902)" Venvs. 54. 113-122 (1995)

R.Ueshima：“Trochochlamys praealta 的分类位置（Pilsbry，1902）”Venvs。

R.Ueshima: "Rediscovery of Neosuccinea kofui Patterson, 1971 with notes on the taxonomic position of Svccinea lyrata Glould, 1859 and S. horticola, 1877" Venvs. 54. 161-173 (1995)

R.Ueshima：“重新发现 Neosuccinea kofui Patterson，1971 年，并附有 Svccinea lyrata Glould 分类位置的注释，1859 年和 S. horticola，1877 年”Venvs。

R.Arai: "Biodiversity and evolution" National Science Museum Foundation, 336 (1995)

R.Arai：“生物多样性和进化”国家科学博物馆基金会，336（1995）