固体高分解能NMRによる原子間距離の精密測定に基づく高次構造解析
固体高分解能NMRによる原子間距離の精密測定に基づく高次構造解析
批准号:
07268218
负责人:
斉藤 肇
金额:
$1.34万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1995
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1995 至 --
中文摘要
情報伝達物質としての生理活性ペプチドおよび受容体モデルとしてのバクテリオロドプシンの3次元構造の解明の両面からの研究をすすめた。生理活性ペプチド 受容体分子に結合した状態における分子の3次元構造の構築がどの程度距離情報の測定のみで可能かの検討を、3種類の異なる位置に^<13>C,^<15>N標識を行ったN-Ac-Pro-Gly-Pheをモデル系として実験条件の詳細な検討を行った。同位体標識を行った標識原子核との相互作用を3スピン系として解析するか、あるいは希釈にともなう分子間相互作用の除去、高周波磁場の不均一性など、詳細な条件検討を行った。この場合、分子動力学計算の意義についても検討を行った。また、結晶化条件の違いによる多種の多形構造をとるエンケファリンについて、それぞれについて4種類の2重標識ペプチドを合成し、その間の原子間距離測定を行い、これらの3次元構造構築にむけての検討を行った。受容体モデル [3-^<13>C]Ala標識バクテリオロドプシン(bR)の^<13>C固体高分解能NMR測定をマイナス110°までの低温で行い、Naイオンを含む場合は低温で著しい線幅の増大が見られたが、イオン強度ゼロの場合は全くの温度変化が見られなかった。これは、膜表面の電荷をカチオンが遮蔽することによる、膜のパッキングの違いとその結果起こる蛋白側のコンホメーション変化として説明できることがわかった。さらに、レチナ-ルを除去したバクテリオオプシンへの変換に基づくスペクトル変化、ならびにレチナ-ルあるいはそのアナログの付加にともなうアポ蛋白質のコンホメーション変化に関する知見も得ることができた。
英文摘要
情報伝達物質としての生理活性ペプチドおよび受容体モデルとしてのバクテリオロドプシンの3次元構造の解明の両面からの研究をすすめた。生理活性ペプチド 受容体分子に結合した状態における分子の3次元構造の構築がどの程度距離情報の測定のみで可能かの検討を、3種類の異なる位置に^<13>C,^<15>N標識を行ったN-Ac-Pro-Gly-Pheをモデル系として実験条件の詳細な検討を行った。同位体標識を行った標識原子核との相互作用を3スピン系として解析するか、あるいは希釈にともなう分子間相互作用の除去、高周波磁場の不均一性など、詳細な条件検討を行った。この場合、分子動力学計算の意義についても検討を行った。また、結晶化条件の違いによる多種の多形構造をとるエンケファリンについて、それぞれについて4種類の2重標識ペプチドを合成し、その間の原子間距離測定を行い、これらの3次元構造構築にむけての検討を行った。受容体モデル [3-^<13>C]Ala標識バクテリオロドプシン(bR)の^<13>C固体高分解能NMR測定をマイナス110°までの低温で行い、Naイオンを含む場合は低温で著しい線幅の増大が見られたが、イオン強度ゼロの場合は全くの温度変化が見られなかった。これは、膜表面の電荷をカチオンが遮蔽することによる、膜のパッキングの違いとその結果起こる蛋白側のコンホメーション変化として説明できることがわかった。さらに、レチナ-ルを除去したバクテリオオプシンへの変換に基づくスペクトル変化、ならびにレチナ-ルあるいはそのアナログの付加にともなうアポ蛋白質のコンホメーション変化に関する知見も得ることができた。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
M.Aida,A.Naito and H.Saito,: "Molecular Dynamics Simulation of a Simple Tripeptide,N-acetyl-Pro-Gly-Phe in the Crystalline States:Distinction of the b-turn Tvpe I from the Type II Form" J.Mol.Struct.(Theochem.). (印刷中).
M.Aida、A.Naito 和 H.Saito,:“晶体状态下简单三肽 N-乙酰基-Pro-Gly-Phe 的分子动力学模拟:b 转 Tvpe I 与 II 型形式的区别” J.Mol.Struct.(Theochem.)(正在出版)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
A.Naito,T.Iizuka,S.Tuzi,W.S.Price,K.Hayamizu,and H.Saito: "Phenyl Ring Dynamics of the Insulin Fragment Gly-Phe-Phe(B23-B25)by Solid-State Deuterium NMR" J.Mol.Struct.355. 55-60 (1995)
A.Naito、T.Iizuka、S.Tuzi、W.S.Price、K.Hayamizu 和 H.Saito:“通过固态氘 NMR 测定胰岛素片段 Gly-Phe-Phe(B23-B25) 的苯环动力学”J
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
H.Saito: "Encyclopedia of Nuclear Magnetic Resonance" John Wiley and Sons, 6 (1996)
H.Saito:“核磁共振百科全书”John Wiley and Sons,6 (1996)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
H.Saito,S.Tuzi,K.Hishimura,A.Fukutani,and A.Naito,: "Conformation and Dynamics of Fibrous and Membrane Proteins as Revealed by High-Resolution Solid-State NMR" Macromol.Symp.(印刷中).
H.Saito、S.Tuzi、K.Hishimura、A.Fukutani 和 A.Naito,:“高分辨率固态 NMR 揭示的纤维和膜蛋白的构象和动力学” Macromol.Symp.(出版中) 。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
H.Saito: "Conformational Characterization of Polysaccharides as Studied by High-resolution ^<13>C Solid -State NMR" Annu.Rep.NMR.Spectrosc.31. 157-171 (1995)
H.Saito:“通过高分辨率13 C固态NMR研究的多糖的构象表征”Annu.Rep.NMR.Spectrosc.31。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 9 条
バクテリオロドプシンの構造のゆらぎと機能
-
批准号:10157220
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
-
资助金额:$0.83万
-
财政年份:1998
-
负责人:斉藤 肇
-
依托单位:
バクテリオロドプシンにおけるタンパク骨格ダイナミックス
-
批准号:09261233
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$1.02万
-
财政年份:1997
-
负责人:斉藤 肇
-
依托单位:
固体高分解能NMRによる原子間距離の精密測定に基づく高次構造解析
-
批准号:06276215
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$1.47万
-
财政年份:1994
-
负责人:斉藤 肇
-
依托单位:
固体高分解能NMRによる原子間距離の精密測定と膜蛋白質の三次元構造の構築
-
批准号:04453168
-
项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
-
资助金额:$0.0万
-
财政年份:1992
-
负责人:斉藤 肇
-
依托单位:
悪性腫瘍の新しい診断技術の確立-In vivo NMR分光法の適用
-
批准号:60015108
-
项目类别:Grant-in-Aid for Cancer Research
-
资助金额:$2.75万
-
财政年份:1985
-
负责人:斉藤 肇
-
依托单位:
Tumor Promoterによる細胞膜変化, 重水素NMRによる分子機作の解析
-
批准号:57015106
-
项目类别:Grant-in-Aid for Cancer Research
-
资助金额:$3.01万
-
财政年份:1982
-
负责人:斉藤 肇
-
依托单位:
Tumor Promoter による細胞膜変化, 重水素NMRによる分子機作の解析
-
批准号:56015082
-
项目类别:Grant-in-Aid for Cancer Research
-
资助金额:$2.88万
-
财政年份:1981
-
负责人:斉藤 肇
-
依托单位:
低膨脹性焼結体の生成機構に関する研究
-
批准号:X00080----047057
-
项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
-
资助金额:$3.58万
-
财政年份:1975
-
负责人:斉藤 肇
-
依托单位:
海外基金