蛋白質アミロイド凝集形成配列とその構造・物理化学的性質に関する研究

蛋白质淀粉样蛋白聚集体形成序列及其结构和理化性质研究

• 批准号: 16041249
• 负责人: 浜田 大三
• 金额: $ 4.29万
• 依托单位: Research Institute, Osaka Medical Center for Maternal and Child Health
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16041249/
• 关键词: アミロイド線維; 蛍光修飾; 電子顕微鏡; 原子間力顕微鏡; 蛋白質; 自己組織化; 構造病; ミスフォールディング; 生物物理; 高分子構造・物性; ナノバイオ; 赤外分光; アミロイド; 全反射蛍光顕微鏡

本年度の研究では、非病原性アミロイド線維を形成するウシ・βラクトグロブリンとそのペプチド断片、また、新たにヒト・メディンペプチド(こちらも非病原性)を材料にし、それぞれのアミロイド線維の立体構造に関する情報とその構築原理について、以下の手法により研究を行った。また、ケンブリッジ大学、クリストファー・ドブリン教授、ミカエレ・ヴェンドロスコロ博士と共同し、アミロイド形成に直接関与するアミノ酸配列領域について、予測プログラムの構築に関する研究を進めることができた。1)リジン側鎖の露出度アミロイド線維状態におけるリジン側鎖の露出度について、βラクトグロブリンを用いて検討した。その結果、以外にも線維中ではリジン側鎖の露出は、多くなく、一方、均質な修飾物がえられなかった。この結果から、アミロイド線維構造の不均一性が存在するか、リジン側鎖が分子内部に比較的よく埋もれていることが示唆された。2)継代的微量シーディングによる線維の均一化この研究を行うため、材料としてヒト・メディインのペプチド断片を用いた。これは、本ペプチドが7残基と比較的短く。構造均一性を保持することが可能と考えられたからである。しかしながら、予想に反し、メディインのペプチドの線維形成速度には、非常にばらつきがあり、且つ、シーディング効果も制御しづらいことが分かった。つまり、本ペプチドのアミロイド線維形成において、構造不均一性は、そのエネルギー地形にとって、本質的な性質であることが示唆された。現在、この予想の信憑性について、X-線繊維回折などを利用し、解析することを計画している。

This year's research is focused on the following methods: the formation of non-pathogenic bacteria, the selection of fragments, new types of bacteria, the selection of materials (non-pathogenic), the information and construction principles related to the three-dimensional structure of non-pathogenic bacteria, and the following methods. The research on acid alignment, prediction and construction is directly related to the formation of acid alignment. 1) The exposure of the side lock is not detected in the linear dimensional state. The exposure of the side lock is detected in the middle of the detection. The result is that the outer dimension is not exposed, the side lock is exposed, and the square is homogeneous. The results show that the heterogeneity of linear structure exists in the molecular interior. 2) The research on the homogenization of linear dimension in the generation of trace elements, materials and materials, and the application of trace elements. This is a short comparison of 7 residues. Structural homogeneity is maintained. The speed of line formation is very high, and the results are controlled. The characteristics of the structure, the heterogeneity of the terrain, and the nature of the nature of the structure are discussed. Now, the reliability of this idea, X-ray dimensional regression, utilization, analysis, planning, etc.

项目成果

EspB from enterohaemorrhagic Escherichia coli is a natively partially folded protein

• DOI: 10.1111/j.1742-4658.2004.04513.x
• 发表时间: 2005-02-01
• 期刊: FEBS JOURNAL
• 影响因子: 5.4
• 作者: Hamada, D;Kato, T;Yanagihara, I
• 通讯作者: Yanagihara, I

Analysis of recombinant human saposin A expressed by Pichia pastoris.

毕赤酵母表达的重组人皂苷 A 的分析。

• 发表时间: 2004
• 期刊: Biochem.Biophys.Res.Commin. 318
• 作者: Yamada;T.;Inui;K.;Hamada;D.;Nakahira;K.;Yanagihara;K.;Sakai;N.;Nishigaki;T.;Ozono;K;Yanagihara;I.
• 通讯作者: I.

Thermostable direct hemolysin of Vibrio parahaemolyticus is a bacterial reversible amyloid toxin

• DOI: 10.1021/bi050311s
• 发表时间: 2005-07-26
• 期刊: BIOCHEMISTRY
• 影响因子: 2.9
• 作者: Fukui, T;Shiraki, K;Yanagihara, I
• 通讯作者: Yanagihara, I

Electron transfer reaction in a single protein molecule observed by total internal reflection fluorescence microscopy

全内反射荧光显微镜观察单个蛋白质分子中的电子转移反应

• 发表时间: 2005
• 期刊: J.Am.Chem.Soc. 127
• 作者: Furukawa;Y.;Ban;T.;Hamada;D.;Ishimori;K.;Goto;Y.;Morishima;I
• 通讯作者: I

A pH-dependent conformational change in BspA, which is a component of the E.Coli O157:H7 type III secretion system

BspA 中 pH 依赖性构象变化，BspA 是大肠杆菌 O157:H7 III 型分泌系统的组成部分

• 发表时间: 2005
• 期刊: FEBS Journal (in press)
• 作者: Kato;T.;Hamada;D.;Fukui;T.;Hayashi;M.;Honda;T.;Murooka;Y.;Yanagihara;I.
• 通讯作者: I.