蛋白質のアミロイド線維形成反応に関する構造・熱力学的研究
蛋白质淀粉样原纤维形成反应的结构和热力学研究
基本信息
- 批准号:18031046
- 负责人:
- 金额:$ 3.2万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2006
- 资助国家:日本
- 起止时间:2006 至 2007
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
生体内で合成される蛋白質は、そのアミノ酸配列に特有の折れたたみ構造(天然構造)を形成することにより、その機能を発揮することができるようになる。一方、蛋白質アミロイド線維のような天然構造とは異なる規則正しい構造を持つ凝集体を形成することが、種々の疾患に関連することが、近年、明らかになってきた。本研究では、アミロイド線維形成に関する構造生物学的・熱力的研究のための、基礎となる方法論、及び解析理論を確立し、その分子機構を解明することを目的として、以下の3件について、研究を行った。1,βラクドグロブリン、αシヌクレイン、アルツハイマーA βペプチドを用いて、アミロイド伸長反応の臨界濃度測定とその尿素濃度依存性による熱力学的解析法を実施し、それぞれの反応の熱力学的パラメータの算出した。その結果、アミロイド伸長反応に関する自由エネルギー変化量と露出表面積の変化量は、比較的相関することが示唆された。2,α A-クリスタリンのシャペロン活性を持つ機能ペプチドが、予想に反し、高いアミロイド線維形る成能を有することを示した。また、同様な性質が他のシャペロ活性を持つ蛋白質でも保存されていることが、理論的な蛋白質凝集形成能予測から示唆された。3,黄色蛍光蛋白質融合体を用いた、特定のアミノ酸配列に対する凝集形成のアッセイ法とその信頼性に関する研究を行った。本系では、黄色蛍光蛋白質のN末端に対象となる蛋白質の配列をつないだ融合蛋白質において、上流配列の凝集形成能が形成能が高い場合、黄色蛋白質もミスフォールドするという経験則に基づいている。本研究により、多くの場合、このアツセイ法の信憑性は高いが、ある種の配列に対しては、凝集が形成されても黄色蛍光蛋白質の活性が低下しないことが、明らかになった。
In vivo, synthetic proteins are formed with unique folding structures (natural structures), and their functions are developed. In recent years, protein production has become increasingly difficult due to the existence of natural structures and structural differences. This study aims to establish basic methodology and analytical theory of structural biology and thermodynamics related to the formation of linear dimension, and to clarify molecular mechanism. The following three aspects are discussed and studied. 1. The thermodynamic analysis method for determining the critical concentration of β-cyclodextrin, α-cyclodextrin, α-cyclodextrin and β-cyclodextrin and the urea concentration dependence of β-cyclodextrin was carried out and calculated. The results show that there is a correlation between the amount of free growth and the amount of change in the exposed surface area. 2,α A-free selection activity, function selection, anticipation, high resolution, linear dimension generation, etc. The protein aggregation can be predicted by the theory of protein aggregation. 3. The study of aggregation formation and information related to the use of yellow fluorescent protein fusion and specific acid alignment In this system, the protein alignment of the yellow fluorescent protein at the N-terminal end is divided into fusion protein alignment, upstream alignment aggregation formation energy, formation energy, and yellow protein alignment. In this study, the reliability of this method was high, and the activity of yellow fluorescent protein was low.
项目成果
期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Effect of amyloidogenic sequence attached to yellow fluorescent protein
黄色荧光蛋白上淀粉样蛋白生成序列的影响
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hamada D;Tsumoto K;Sawara M;Tanaka N;Nakahira K;Shiraki K;Yangaihara I
- 通讯作者:Yangaihara I
Amyloid fibril formation and chaperone-like activity of peptides from αA-Crystallin
- DOI:10.1021/bi701823g
- 发表时间:2008-03-04
- 期刊:
- 影响因子:2.9
- 作者:Tanaka, Naoki;Tanaka, Ryoji;Hamada, Daizo
- 通讯作者:Hamada, Daizo
アミロイド線維から機能性タンパク質ナノ繊維へ
从淀粉样原纤维到功能性蛋白质纳米纤维
- DOI:
- 发表时间:2006
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hamada D;Tsumoto K;Sawara M;Tanaka N;Nakahira K;Shiraki K;Yangaihara I;浜田 大三
- 通讯作者:浜田 大三
蛋白質のフォールディング,複合体化,アミロイド線維形成反応の関係
蛋白质折叠、络合和淀粉样原纤维形成反应之间的关系
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hamada D;Tsumoto K;Sawara M;Tanaka N;Nakahira K;Shiraki K;Yangaihara I;浜田 大三;浜田 大三;浜田 大三
- 通讯作者:浜田 大三
蛋白質のアミロイド線維形成の熱力学解析
蛋白质淀粉样原纤维形成的热力学分析
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hamada D;Tsumoto K;Sawara M;Tanaka N;Nakahira K;Shiraki K;Yangaihara I;浜田 大三;浜田 大三
- 通讯作者:浜田 大三
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浜田 大三其他文献
連続的Povarov-酸化反応を用いたcryptolepine類の合成研究
连续波瓦洛夫氧化反应合成隐磷脂的研究
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Hamada D;Tsumoto K;Sawara M;Tanaka N;Nakahira K;Shiraki K;Yangaihara I;浜田 大三;浜田 大三;浜田 大三;浜田 大三;高須清誠;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;Kenji Sugimoto;Kenji Sugimoto;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;Pudhom Khanitha;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;高須清誠;高須清誠;高須清誠;高須清誠;高須清誠;高須清誠;高須清誠 - 通讯作者:
高須清誠
触媒的多成分反応によるプロトイルダン類の迅速合成
通过催化多组分反应快速合成原酰丹
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Hamada D;Tsumoto K;Sawara M;Tanaka N;Nakahira K;Shiraki K;Yangaihara I;浜田 大三;浜田 大三;浜田 大三;浜田 大三;高須清誠;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;Kenji Sugimoto;Kenji Sugimoto;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;Pudhom Khanitha;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;高須清誠;高須清誠;高須清誠;高須清誠;高須清誠;高須清誠;高須清誠;高須清誠 - 通讯作者:
高須清誠
Protoilluden-6-olの合成研究
Protoilluden-6-ol的合成研究
- DOI:
- 发表时间:
2008 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Hamada D;Tsumoto K;Sawara M;Tanaka N;Nakahira K;Shiraki K;Yangaihara I;浜田 大三;浜田 大三;浜田 大三;浜田 大三;高須清誠;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;Kenji Sugimoto;Kenji Sugimoto;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;Pudhom Khanitha;Kiyosei Takasu;Kiyosei Takasu;高須清誠;高須清誠;高須清誠;高須清誠;高須清誠 - 通讯作者:
高須清誠
受精膜融合もαヘリックスを使うのかIzumoフラグメントの構造機能解析
α-螺旋用于受精膜融合吗 Izumo 片段的结构和功能分析
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
萩原 義久;井上 直和;平田 邦生;浜田 大三;上久保 裕生;片岡 幹雄;山本 雅貴;岡部 勝 - 通讯作者:
岡部 勝
低分解能解析により明らかとなった SBD の複数の変性状態
低分辨率分析揭示了 SBD 的多种退化状态
- DOI:
- 发表时间:
2015 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
太田 千晶;池口 雅道;浜田 大三;田中晶善 - 通讯作者:
田中晶善
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蛋白質アミロイド凝集形成配列とその構造・物理化学的性質に関する研究
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16041249 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
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$ 3.2万 - 项目类别:
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- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
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