Technology for analyzing biological functions from phenome
Technology for analyzing biological functions from phenome
从现象组分析生物功能的技术
批准号：
17017007
负责人：
MORISHITA Shinichi
金额：
$60.67万
依托单位：
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2005 至 2009
中文摘要
翻译
本研究的目的是了解DNA的功能。为此，我们开发了处理果蝇突变翅膀照片的软件，以加快参与细胞生长的基因的功能分析。我们还使用下一代测序仪解决了这个问题，揭示了DNA的染色质结构对进化的影响很大，这是第一次发现这一特性的研究。
英文摘要
The goal of this research is understanding functions of DNA. Towards this end, we developed software for processing fruitfly mutant wing photographs to accelerate functional analysis of genes involved in cell growth. We also approached the problem using next-generation sequencers to reveal that the chromatin structure of DNA affects evolution considerably, which is the first study to uncover the property.
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MachiBase: a Drosophila melanogaster 5'-end mRNA transcription database. ショウジョウバエの7つの組織(胚、幼虫、老/若x雄/雌, S2)から収集した各々3-400万個の転写開始点タグ情報の公開データベース
MachiBase：果蝇 5 端 mRNA 转录数据库，公开了从七个果蝇组织（胚胎、幼虫、老/幼 x 雄性/雌性、S2）数据库中收集的 3-400 万个转录起始点标签的信息。
MachiBase：果蝇 5 端 mRNA 转录数据库，公开了从七个果蝇组织（胚胎、幼虫、老/幼 x 雄性/雌性、S2）数据库中收集的 3-400 万个转录起始点标签的信息。
DOI：
--
发表时间：
期刊：
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
DOI：
10.1371/journal.pone.0004108
发表时间：
2009-01-01
期刊：
PLOS ONE
影响因子：
3.7
作者：
[Hashimoto, Shin-ichi, Qu, Wei, Matsushima, Kouji]
通讯作者：
Matsushima, Kouji
UTGB toolkit for personalized genome browsers. 各研究室レベルで容易にゲノム解析ができるように、Personalized Genome Browserを構築するツールキットを研究開発し、無料で公開した。実際数分でゲノムブラウザーを立ち上げ、データをsecureな環境で分析することも、一般に公開することも可能である
个性化基因组浏览器的UTGB工具包我们研发了构建个性化基因组浏览器的工具包，并免费发布，以便各个实验室可以轻松地进行基因组分析。
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DOI：
--
发表时间：
期刊：
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
SCMD (Saccharomyces Cerevisiae Morphological Database)出芽酵母の遺伝子破壊株(EUROSCARF)の顕微鏡画像をイメージ処理し、形態に関する様々な定量的パラメータを抽出。2001年末よりデータ収集を開始し、2004年8月に約5000個の非必須遺伝子破壊株、約180万細胞の形態パラメータの計測を完了
SCMD（酿酒酵母形态数据库）对基因破坏的酿酒酵母菌株 (EUROSCARF) 的显微图像进行图像处理，以提取有关形态的各种定量参数。
SCMD（酿酒酵母形态数据库）对基因破坏的酿酒酵母菌株 (EUROSCARF) 的显微图像进行图像处理，以提取有关形态的各种定量参数。
DOI：
--
发表时间：
期刊：
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
dsCheck線虫、ショウジョウバエ等のモデル生物においてRNA干渉を行う配列を設計するwebサイト。cross reactionを防止できるように配慮してある
dsCheck 一个网站，用于设计在模型生物（例如线虫和果蝇）中进行 RNA 干扰的序列。
dsCheck 一个网站，用于设计在模型生物（例如线虫和果蝇）中进行 RNA 干扰的序列。
DOI：
--
发表时间：
期刊：
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
共 46 条
Genome evolution induced by chromatin structure and DNA methylation
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批准号：23241058
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项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额：$24.46万
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财政年份：2011
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负责人：MORISHITA Shinichi
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依托单位：
Knowledge Discovery from Genome Databases
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批准号：12208003
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项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额：$68.54万
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财政年份：2000
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负责人：MORISHITA Shinichi
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依托单位：
QUERY OPTIMIZATION TECHNIQUE FOR DATA MINING
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批准号：10480066
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项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (B).
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资助金额：$6.66万
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财政年份：1998
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负责人：MORISHITA Shinichi
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依托单位：
海外基金