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植物に特微的な倍数性ゲノム間相互作用に関する研究

植物特有的倍性基因组相互作用研究

基本信息

批准号：
17018028
负责人：
村井耕二
金额：
$ 3.78万
依托单位：
Fukui Prefectural University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

コムギは倍数化により進化してきたことを特徴とする。パンコムギは倍数化する際、異種間の異なるゲノムを組み合わせた(異質倍数性:ゲノム式AABBDD)。これらのゲノムが内包する遺伝子セットは基本的に同じであると考えられるが、互いに分化している。倍数種のゲノム構成および遺伝子発現調節はそれぞれのゲノムの単なる足し算ではなく、高次な制御機構による相互作用が働いているに違いない。本研究は、パンコムギをモデルとして、倍数種が成立した結果生じたジェネティックおよびエピジェネティックな変化をゲノム科学的に解析することを目的とする。本年度の成果は以下のとおり。1.コムギESTの大量解析:ストレスで誘導される遺伝子発現パターンを体系的に解析するために、ESTの大量解析を行った。データをバイオインフォマティクス的に解析し、in silicoでストレス応答遺伝子をスクリーニングするシステムを確立した。2.花成関連遺伝子のクローニングと発現解析:花成関連遺伝子であるWFL遺伝子およびWLSH1遺伝子の構造と発現パターンを解析した。3種ゲノム間で遺伝子の機能分化がみられた。3.貯蔵タンパク質遺伝子の発現プロファイル:コムギ種子貯蔵タンパク質遺伝子は多重遺伝子族を形成する。これらのうち、発現しているα/β-グリアジン、LMW-グルテニン遺伝子を網羅した。これらの遺伝子の構造と発現パターンを詳細に解析し、あらたな貯蔵タンパク質転写調節機構を示した。4.オリゴDNAマイクロアレイを用いた塩処理に応答する遺伝子の体系的解析:22Kアジレント社コムギオリゴDNAマイクロアレイを作成した。塩処理をしたコムギ実生からRNAを抽出し、マイクロアレイでゲノムワイドで塩応答遺伝子の発現プロファイルを求めた。これらの遺伝子には、塩に応答する既知の遺伝子群も含まれていたが、コムギ独自の応答遺伝子も数多く含まれていた。これらの遺伝子の機能解析が求められる。

コムギは multiplexed によりevolution してきたことを特徴とする.パンコムギはmultipleization するinter, heterogeneous のなるゲノムをgroup み合せた (heterogeneous ploidy: ゲノム formula AABBDD).これらのゲノムが内包する伝子セットは Basic に同じであると卡えられるが、mutual いにdifferentiation している. Multiple kinds of のゲノム constitute および缝子発 appear to adjust はそれぞれのゲノムの単なる足It's a high-level control mechanism, and it's a high-level control system. The results of this study are as follows:クおよびエピジェネティックな変化をゲノムSCIENTIFIC にANALYSIS することをpurposeとする. The results of this year are as follows. 1. A large number of analysis of コムギESTの: ストレスでinducing される伝子発existing パターンを system's にanalytics するために, ESTの massive analysis を行った.データをバイオインフォマティクス's analysisし, in silicoでストレス応 Answer伝子をスクリーニングするシステムをEstablishmentした. 2. The present analysis of the legacy of the relationship between flowers and flowers: the legacy of the relationship between flowers and flowers WFL 伝子およびWLSH1 伝子のstructuralと発成パターンをanalyticsした. 3 kinds of functional differentiation of ゲノム间で伝子のがみられた. 3. 电タンパク电缝子の発成プロファイル: コムギ seed storage 蔵タンパク电缝子は多缝子 Clansをformationする.これらのうち, 発appears しているα/β-グリアジン, LMW-グルテニン伝子を灗た. The detailed analysis of the structure of the これらの缝子の発appears パターンを, and the あらたなstore蔵タンパクquality転writes the adjustment mechanism をshows した. 4. The system of using the いた塩 treatment of オリゴDNAマイクロアレイをAnalysis: 22K アジレント社コムギオリゴDNAマイクロアレイを成した.婩treatmentをしたコムギ実生からRNAを出し、マイクロアレイでゲノムワイドで塩応Answer the remaining 伝子の発 appear プロファイルをquest めた.これらの缝子には、塩に応达する知の缝子群も与まれていたが、コムギの応愿伝子も多多く有まれていた.これらの缝子の Functional Analysis がめられる.