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脳卒中の遺伝素因解明に向けた網羅的アプローチ

阐明中风遗传易感性的综合方法

基本信息

批准号：
17019068
负责人：
加藤規弘
金额：
$ 3.2万
依托单位：
Research Institute, International Medical Center of Japan
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17019068/
关键词：
遺伝子脳卒中疾患感受性 SNP 関連研究高血圧環境因子多因子疾患

项目摘要

研究計画として、脳卒中という成因的に"ヘテロ"な疾病カテゴリーを対象として感受性遺伝子を探索するために、(1)臨床病型間比較に基づく関連解析と、(2)多角的かつゲノムワイドな標的遺伝子の選出とを進める。本年度当初計画の概要は、以下の通りである。(1)臨床病型間比較に基づく関連解析のデザイン本研究では脳ドック受診者中のMRI所見正常者を「対照群」と位置付ける。一方、「罹患群」としては、脳卒中を大きく7つのサブタイプ-無症候性脳硬塞および6種類の有症候性脳血管障害-に分類し、互いに比較しながら疾患感受性遺伝子の関与を各々明らかにする。さらに高齢(≧70才)になってもMRI所見の全く正常なものを「super-normal群」として収集し(目標200名)、これを外部対照として用いる予定である。(2)多角的な標的遺伝子の選出アプローチ標的となる遺伝子の選出に際しては、主に3つの研究アプローチ-(1)機能的候補リストの選出と候補遺伝子アプローチ、(2)モデル動物での知見の活用、そして(3)芽球化リンパ球を用いた網羅的発現解析-を並行して推進する。従来の研究状況を踏まえて今年度に行った、本研究課題に関連した研究成果としては、(1)高血圧関連疾患に関する151候補遺伝子のSNP探索を独自に行い、1955 SNPを同定・登録した(うち887個、45%が新規SNP);(2)tag-SNP選出のための新規アルゴリズムを開発した;(3)疾病ゲノム解析として高血圧(1222名、150候補遺伝子638tag-SNPs、平均4.6SNPs/遺伝子)および脳梗塞(1001名、130候補遺伝子598tag-SNPs)の大規模候補遺伝子スクリーニングを行い、疾患感受性候補遺伝子を各々9個ずつ同定した、ことなどが挙げられる。

The research plan is to explore the causes of stroke,(1) basic correlation analysis for comparison between clinical types,(2) selection of target genes for multi-angle stroke. This year's original plan is outlined below. (1)In this study, the patients with normal MRI findings were compared with those with normal MRI findings. One side,"disease group" and "stroke" are large, 7 types of disease-asymptomatic vascular obstruction and 6 types of symptomatic vascular disorders-classified, compared and related to disease susceptibility. All normal MRI findings were "super-normal"(target 200) and "external"(target 200). (2)The selection of multi-angle target vectors and the selection of multi-angle target vectors-(1) the selection of functional candidate vectors and the selection of candidate vectors;(2) the use of knowledge of multi-angle animals;(3) the analysis of the occurrence of bud spheronization; and (4) the parallel advancement of multi-angle target vectors. The results of this research project are as follows: (1) SNP exploration of 151 candidate genes related to hypertension related diseases is carried out independently, and 1955 SNP is identified simultaneously.(2)tag-SNP selection and development;(3) Disease analysis and high blood pressure (1222, 150 candidate genes 638tag-SNPs, average 4.6 SNPs/gene) and infarction (1001, 130 candidate genes 598tag-SNPs).