液中高速原子間力顕微鏡による分子シャペロンの1分子反応機構解析
液中高速原子間力顕微鏡による分子シャペロンの1分子反応機構解析
批准号:
17028031
负责人:
吉村 成弘
金额:
$2.56万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2006
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英文摘要
シャペロニンは、タンパク質のフォールティングを介助する分子シャペロンの一群であり、全ての生物において必須の役割を担っている。シャペロニンは、ATP加水分解を介したダイナミックな構造変化により、変性状態の基質タンパク質を自身の内部空洞に取り込み、そのフォールディングを介助することが知られている。しかし、このフォールディング反応の詳細な過程(ATPの結合・加水分解・解離にともなう構造変化等)に関しては、未解明の部分が多い。本研究課題では、新規に開発された高速走査型原子問力顕微鏡(高速AFM)を用いて、大腸菌のシャペロニンGroELのヌクレオチド依存的構造変化を一分子レベルでリアルタイムに可視化・解析する技術を確立し、以下の成果を得た。1.高速AFMを用いて、5フレーム毎秒の速度で溶液中のGroEL一分子を観察する系を確立した。2.ヌクレオチドの結合によるGroELの構造変化(open型とclosed型)、および、GroESのGroELへの結合解離反応を観察することに成功し、それらの反応速度定数等を得た。3.GroELはヌクレオチド(ATP, ADP, ATP-γ-S, AMP-PNP, ADP+AlFxなど)存在下でopen型とclosed型の間で構造変化を繰り返していること、この構造変化はミリ秒以下の速度で起こること、ATP加水分解のエネルギーを直接必要としないことを明らかにした。4.ヌクレオチドが結合したopen型GroELの構造安定性を調べると、ADP結合型の方がATP結合型よりも不安定であること、ATPの加水分解により構造が不安定化することがわかった。こうした結論は、以前に提唱された"2 timer mechanism"におけるタイマーの一つが、GroEL cis-ring内におけるATPの加水分解である可能性を強く示唆するものと考えられる。5.同様の手法を用いて、グループII型シャペロニン(細胞質シャペロニンCCT、超好熱性古細菌(Thermococcus sp.KS-D由来シャペロニン)の観察を行い、その構造変化を示す初期データを得た。
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DOI:
10.1016/j.febslet.2006.06.032
发表时间:
2006-07-10
期刊:
FEBS LETTERS
影响因子:
3.5
作者:
[Yoshimura, Shige H., Takahashi, Hirohide, Takeyasu, Kunio]
通讯作者:
Takeyasu, Kunio
Topoisomerase II, scaffold component, promotes chromati compaction in vitro in a linker-histone H1-dependent manner.
拓扑异构酶 II(支架成分)以连接组蛋白 H1 依赖性方式促进体外染色质压缩。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Nucleic Acid Res. 35・8
影响因子:
--
作者:
[監修:石原得博, 編集:池田修一, 著者:樋口京一, S.H.Yoshimura 他, K.Hizume 他]
通讯作者:
K.Hizume 他
Comparative structural biology of the genome : Nano-scale imaging of single nucleus from different kingdoms reveals the chromatin built up
基因组的比较结构生物学:来自不同界的单核的纳米级成像揭示了染色质的形成
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
J.Electr.Microsc. 55・1
影响因子:
--
作者:
[監修:石原得博, 編集:池田修一, 著者:樋口京一, S.H.Yoshimura 他, K.Hizume 他, S.H.Yoshimura 他, S.H.Yoshimura 他, S.H.Yoshimura 他, S.H.Yoshimura 他]
通讯作者:
S.H.Yoshimura 他
Fast-scanning atomic force microscopy revealed the molecular mechanism of DNA cleavage by Anal endonuclease.
快速扫描原子力显微镜揭示了 Anal 核酸内切酶切割 DNA 的分子机制。
DOI:
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发表时间:
2006
期刊:
IEE Proc.Nonobiotech. 153・4
影响因子:
--
作者:
[監修:石原得博, 編集:池田修一, 著者:樋口京一, S.H.Yoshimura 他, K.Hizume 他, S.H.Yoshimura 他, S.H.Yoshimura 他, S.H.Yoshimura 他]
通讯作者:
S.H.Yoshimura 他
Comparative structural biology of the genome : Nano-scale imaging of single nucleus from different kingdoms reveals the chromatin built up on a 40 nm
基因组的比较结构生物学:来自不同界的单核的纳米级成像揭示了建立在 40 nm 上的染色质
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Journal of Electron Microscopy (印刷中)
影响因子:
--
作者:
[監修:石原得博, 編集:池田修一, 著者:樋口京一, S.H.Yoshimura 他, K.Hizume 他, S.H.Yoshimura 他, S.H.Yoshimura 他, S.H.Yoshimura 他, S.H.Yoshimura 他, S.H.Yoshimura 他, S.H.Yoshimura 他, S.H.Yoshimura 他]
通讯作者:
S.H.Yoshimura 他
共 13 条
Structural and functional regulation of intracellular membrane-less organelles by post-translational modifications.
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批准号:23H00369
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$29.95万
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财政年份:2023
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负责人:吉村 成弘
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依托单位:
局所蛍光計測プローブによる核膜孔複合体を介した物質輸送・選別機構の1分子解析
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批准号:21370054
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.24万
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财政年份:2009
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负责人:吉村 成弘
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依托单位:
Flashコンテンツを用いた現代生命科学教育用システムの開発と実用
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批准号:17011044
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.29万
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财政年份:2005
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负责人:吉村 成弘
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依托单位:
染色体の再構成とナノ構造解析による染色体折りたたみ分子機構の解明
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批准号:15770066
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2003
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负责人:吉村 成弘
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依托单位:
原子間力顕微鏡を用いたクロマチン高次構造・機能協関の解析
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批准号:99J04781
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.73万
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财政年份:1999
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负责人:吉村 成弘
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依托单位:
海外基金