細菌べん毛モーターの回転子複合体と固定子複合体の結晶化

细菌鞭毛马达转子和定子复合物的结晶

基本信息

  • 批准号:
    18054010
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 4.16万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2006
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2006 至 2007
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

1)海洋性ビブリオ菌極べん毛モーター固定子複合体PomA/PomBの結晶化へ向けた大量発現と精製細菌べん毛モーターのエネルギー変換機構を理解するためには、共役イオンの流入に共役したトルク発生を担う、固定子複合体の立体構造を解明することが必須である。我々はNa^+駆動型のビブリオ菌を材料に用い、PomA/PomB固定子複合体の結晶化に向けて、ヒスチジンタグを融合した複合体の大腸菌での大量発現系を構築した。現在、膜画分からの抽出に最適な界面活性剤のスクリーニングを行っている。2)サルモネラ菌固定子蛋白質MotBのペリプラズム断片の結晶化我々は固定子複合体だけでなく、可溶性断片による部分構造の結晶化も進めてきた。特に固定子蛋白質MotBは、そのC末端側に固定に関わるペプチドグリカン結合モチーフを持ち、部分構造としても興味深い。サルモネラ菌を材料に、このモチーフを含む可溶性のMotB断片(MotB_c)を作成し解析した。MotB_cは野生株の運動能を低下させることから、野生型MotBとヘテロダイマーを形成し固定子複合体の集合を阻害するか、モーター中の固定子結合部位に作用していると予想され、またペリプラズムにおいて安定な二量体を形成していた(文献1)。MotB_cの精製は容易で、1リットル培養あたり25mg程度の精製標品が得られる。結晶化が難航したため、MotB_cのNMRスペクトル解析を行ったところ、N末端側とC末端側の構造が不安定であることが予想された。そこで、これら両末端を削った複数種のMotB_c断片を作成し結晶化条件を探索したところ、N末端を10残基、C末端を18残基欠失させた断片MotB_<c6>において、実験室でのX線回折実験で高い分解能の回折像を得ることができた。現在Spring-8での回折実験を目標とし、MotB_<c6>のセレノメチオニン置換体結晶を準備している。
1) Marine antifungal agents are extremely sensitive to the crystallization of PomA/PomB fixtures. To detect a large number of fine bacteria, it is necessary to understand that co-workers and co-workers are involved in the production of health care, and that the three-dimensional construction of fixture complexes is necessary to understand that it is necessary to realize that it is necessary. We use Na ^ + kinematic material, PomA/PomB fixator fusion material and PomA/PomB fixator to crystallize the fusion compound, which contains a lot of bacteria. Now, the film painting is divided into several parts to extract the most active interface. 2) the protein of the immobilized protein of Fusarium spp. was crystallized and the soluble fragments were partially crystallized. 2) the protein MotB fragments were crystallized and the soluble fragments were partially crystallized. The protein MotB was specially immobilized, the C-terminal protein was immobilized, and the protein was immobilized at the C-terminal. The soluble MotB fragments (MotB_c) were made into analytical materials. The kinetic energy of MotB_c wild strain was low, and that of wild type MotB was low, and that of wild type MotBs was to form a set of fixed daughter to prevent damage. The role of the binding part of the fixator in the fish was not to be determined, and the two-dose system was formed (literature 1). MotB_c quality is easy, 1 is good, and the 25mg level is good. Results the results showed that there was no significant difference between the two groups in terms of MotB_c, MotB_c, C-terminal, and N-terminal. The crystallization conditions of the complex MotB _ c fragments were obtained by exploring the crystallization conditions, the N-terminal 10 residues, the C-terminal 18 residues, the MotB_<c6> fragments, the X-ray analysis and the high-resolution analysis. At present, the Spring-8 system is ready to improve the performance of the system, and the MotB_<c6> system is ready to improve the performance.

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The Vibrio motor proteins, MotX and MotY, are associated with the basal body of Na+-driven flagella and required for stator formation
  • DOI:
    10.1111/j.1365-2958.2006.05435.x
  • 发表时间:
    2006-11-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.6
  • 作者:
    Terashima, Hiroyuki;Fukuoka, Hajime;Homma, Michio
  • 通讯作者:
    Homma, Michio
Crystallization and preliminary X-ray analysis of MotY,a stator component of the Vibrio alginolyticus polar flagellar motor
溶藻弧菌极鞭毛电机定子组件MotY的结晶和初步X射线分析
Systematic Cys mutagenesis of FlgI, the flagellar P-ring component of Escherichia coli.
  • DOI:
    10.1099/mic.0.2007/013854-0
  • 发表时间:
    2008-03
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hizukuri Y;Kojima S;Yakushi T;Kawagishi I;Homma M
  • 通讯作者:
    Homma M
細菌べん毛モーター固定子タンパク質MotBのペリプラズム側断片の精製と結晶化
细菌鞭毛运动定子蛋白MotB周质片段的纯化和结晶
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Terashima H;Fukuoka H;Yakushi;T;Kojima S;Homma M;小嶋誠司
  • 通讯作者:
    小嶋誠司
Characterization of the periplasmic domain of MotB and implications for its role in the stator assembly of the bacterial flagellar motor
  • DOI:
    10.1128/jb.01710-07
  • 发表时间:
    2008-05-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.2
  • 作者:
    Kojima, Seiji;Furukawa, Yukio;Narnba, Kelichi
  • 通讯作者:
    Narnba, Kelichi
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

小嶋 誠司其他文献

多重配列アライメントとスクリーニング法による新規モータータンパク質の創生
使用多重序列比对和筛选方法创建新型运动蛋白
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    大友 章裕;Song Chihong、Raymo;N. Burton-Smith;富井 健太郎;村田 和義;小嶋 誠司;飯野 亮太
  • 通讯作者:
    飯野 亮太
'Structural Constraints in Hox Clusters: Lessons from Sharks and Rays' in the book 'Hox Modules in Evolution and Development'
“Hox 集群中的结构约束:鲨鱼和鳐鱼的教训”,收录在《进化和发展中的 Hox 模块》一书中
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    竹川 宜宏;錦野 達郎;山下 俊貴;堀 清志郎;尾上 靖宏;井原 邦夫;小嶋 誠司;今田 勝巳;本間 道夫;石黒啓一郎 - 分担執筆;S. Kuraku (ed. David Ferrier)
  • 通讯作者:
    S. Kuraku (ed. David Ferrier)
Role of N-terminal region of FlhG in polar flagellar number regulation in Vibrio alginolyticus
FlhG N 末端区域在溶藻弧菌极鞭毛数量调节中的作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小嶋 誠司;水野 彬;本間 道夫
  • 通讯作者:
    本間 道夫
Phospholipid flippase acts as a molecular switch for ion channel activation.
磷脂翻转酶充当离子通道激活的分子开关。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    錦野 達郎;宮ノ入 洋平;小嶋 誠司;本間 道夫;Masato Umeda
  • 通讯作者:
    Masato Umeda
Structural and functional characterization of periplasmic loop regions of PomA, a stator protein of flagellar motor, in sodium ion flux.
钠离子通量中鞭毛运动定子蛋白 PomA 周质环区域的结构和功能特征。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    岩月 啓人;岩城 雅代;寺島 浩行;小嶋 誠司;神取 秀樹;本間 道夫
  • 通讯作者:
    本間 道夫

小嶋 誠司的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('小嶋 誠司', 18)}}的其他基金

活性化型固定子から迫る細菌べん毛モーターエネルギー変換装置の機能発現メカニズム
接近激活定子的细菌鞭毛运动能量转换装置的功能表达机制
  • 批准号:
    23K27140
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
活性化型固定子から迫る細菌べん毛モーターエネルギー変換装置の機能発現メカニズム
接近激活定子的细菌鞭毛运动能量转换装置的功能表达机制
  • 批准号:
    23H02447
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
自己集合する細菌べん毛モーター固定子の結晶化
自组装细菌鞭毛电机定子的结晶
  • 批准号:
    20051009
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ナトリウムイオン駆動型細菌べん毛モーターの回転機構
钠离子驱动细菌鞭毛马达的旋转机制
  • 批准号:
    97J01708
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似海外基金

DNAオリガミによる構造変化機構を導入した人工分子モーターの実現と運動解析
使用 DNA 折纸技术结合结构变化机制的人工分子马达的实现和运动分析
  • 批准号:
    24KJ0403
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
生体分子モーターF1への熱力学的不確定性関係の応用
热力学不确定性关系在生物分子马达F1中的应用
  • 批准号:
    24K06971
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
回転分子モーター蛋白質の機械的回転機構~駆動力伝達部位の弾性の役割~
旋转分子马达蛋白的机械旋转机制~驱动力传递部位的弹性作用~
  • 批准号:
    24K06981
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
両方向性の分子モーターを創って生物分子モーターの動作原理を理解する
创建双向分子马达并了解生物分子马达的工作原理
  • 批准号:
    23K27150
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
ナノスプリングと非平衡細胞内力測定法による分子モーター軸索輸送の物性研究
利用纳米弹簧和非平衡细胞内力测量方法研究分子运动轴突运输的物理性质
  • 批准号:
    23K27135
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
自律的再構築による力学的適応性をもつ生体分子モーター人工筋肉の開発
通过自主重建开发具有机械适应性的生物分子运动人造肌肉
  • 批准号:
    23K22714
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
力学的摂動応答からひもとく歩行型生体分子モーターの動作原理
基于机械扰动响应的行走生物分子马达的工作原理
  • 批准号:
    24K00600
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
制御可能な非平衡環境の構築と分子モーターの最適輸送原理の解明
可控非平衡环境的构建及分子马达最优输运原理的阐明
  • 批准号:
    24KJ1796
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
化学刺激を用いた自律的人工分子モーターの開発
利用化学刺激开发自主人工分子马达
  • 批准号:
    24K17666
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
生体分子モーターに匹敵する速度で駆動する二輪駆動型DNAモーターカーの開発
开发出两轮驱动DNA汽车,其行驶速度可与生物分子发动机相媲美
  • 批准号:
    23K13645
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了