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大きな揺らぎの存在する媒体中での高分子挙動に関する理論的解析手法の開発とその応用

大きな揺らぎの存在する媒体中での高分子挙動に関する理論的解析手法の開発とその応用
大波动介质中聚合物行为理论分析方法的发展及其应用
批准号:
19031013
负责人:
墨 智成
金额:
$3.01万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008

项目摘要

项目成果

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本研究の目的は大きな揺らぎが存在する媒体中での高分子挙動を理論的に調べる事であるが, 昨年度に行った, 一成分溶媒の気-液臨界点近傍および二成分混合溶媒の液-液相分離臨界点近傍での高分子鎖の解析に引き続き, 今年度は, 電解質水溶液中でのDNA鎖の自己凝縮転移に関する研究を行った.DNA鎖は電解質水溶液中において, 負に帯電した荷電高分子鎖となり, 鎖内のクーロン反発によって, ランダムコイルを形状する. この状態に, 三価ポリアミンであるスペルミジン(SPD^<3+>)を数から数十mM程度添加すると, 環状コイル形状へ自己凝縮転移する現象が観測されている.また, 温度変化に関しては, 低温でランダムコイル形成をとるDNA鎖は, 温度上昇に伴い環状コイルへ自己凝縮転移する観測結果が報告されている.一般に電解質水溶液中での荷電高分子鎖(DNAの粗視化モデル)のブラウニアン動力学法では, 水は連続誘電体とし, イオンは荷電粒子としてモデル化する.このモデルにおける自己凝縮転移のメカニズムとしては, 多価イオンのイオン強結合による電荷秩序状態の形成が考えられるが, 水を露に考慮しないこのモデル化では, 自己凝縮転移を再現する事は出来なかった. また, 温度変化に関しては, 温度の上昇により慣性半径が増加する(実験とは逆の)結果が得られた. そこで我々は, タンパク質の天然構造の安定性において重要となる疎水性相互作用に着目し, 水の凝集性液体としての性質(強い界面張力)を考慮した電解質水溶液モデルを構築した. この粗視化モデルに対して, 密度汎関数理論(DFT)に基づく液体論的手法を用いたマルチスケールシミュレーション法を適用し, 荷電高分子鎖(DNA鎖)の自己凝縮現象について解析を行った.その結果, SPD^<3+>の添加および温度上昇に伴う自己凝縮転移を定性的に再現出来る事が示された.また, 溶媒和自由エネルギーの解析から, SPD^<3+>の添加および温度上昇により, 溶媒和自由エネルギーが大きく上昇する事が分かった.これらの結果から, (a)SPD^<3+>の添加に伴う疎水性相互作用の強化, (b)温度上昇に伴う水和エントロピーの増加に起因した疎水性相互作用の強化, が電解質水溶液の貧溶媒化を導き, これが自己凝縮転移の駆動力となる事が示された.本研究で考慮した電解質水溶液における水の寄与は, タンパク質やコロイドの塩析に関する現象を記述するのに必要不可欠であり, ソフトマター物理においても重要な要素の一つであると考えられる.
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会议论文
Metal-nonmetal transition in dense fluid hydrogen
稠密液态氢中的金属-非金属转变
DOI: --
发表时间: 2008
期刊: Journal of Chemical Physics 128
影响因子: --
作者: [Takaku, T., Ohyashiki, JH., Zhang, Y., Ohyashiki, K, Tomonari Sumi and Hideo Sekino, Takaku T. et al., Tomonari Sumi and Hideo Sekino]
通讯作者: Tomonari Sumi and Hideo Sekino
超臨界溶媒の気-液臨界点近傍での高分子鎖の普遍的および特異的挙動
超临界溶剂气液临界点附近聚合物链的普遍和特定行为
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [墨智成, 今崎伸幸, 関野秀男]
通讯作者: 関野秀男
DNAの自己凝縮転移 : 高分子電解質系における疎水性相互作用の重要性
DNA 的自缩合转变:聚电解质系统中疏水相互作用的重要性
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [墨智成, 鈴木千秋, 関野秀男]
通讯作者: 関野秀男
超臨界流体の気-液臨界点近傍での高分子鎖の振る舞い
超临界流体气液临界点附近聚合物链的行为
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [墨智成, 今崎伸幸, 関野秀男]
通讯作者: 関野秀男
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    Verification of the hydrophobic interaction hypothesis in protein structural stability and theoretical/experimental study on cosolvent effects
    • 批准号:
      20K05431
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.83万
    • 财政年份:
      2020
    • 负责人:
      墨 智成
    • 依托单位:
    高圧下および気一液共存曲線近傍におけるセシウムの分子動力学計算
    • 批准号:
      99J00280
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $2.3万
    • 财政年份:
      1999
    • 负责人:
      墨 智成
    • 依托单位: