权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

Verification of the hydrophobic interaction hypothesis in protein structural stability and theoretical/experimental study on cosolvent effects

蛋白质结构稳定性中疏水相互作用假说的验证及共溶剂效应的理论/实验研究

基本信息

批准号：
20K05431
负责人：
墨智成
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Okayama University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

(1)アルコールの中でも2,2,2-トリフルオロエタノール（TFE）は顕著なHelix誘導能を示すことが知られており，TFE水溶液の大きな濃度揺らぎがその主要な要因であると考えられてきた．一昨年度，小角X線散乱測定によって決定されたTFE水溶液のKirkwood-Buff(KB)積分に基づく解析から，TFE分子の凝集はヘリックス誘導に必ずしも必要ではなく，HelixとTFEとの直接分子間相互作用に起因する選択的溶媒和が，Helix誘導能に関与している事を示した．この熱力学的解析に基づき，TFEの選択的溶媒和の微視的メカニズムを明らかにすべく，コイルドコイルHelix GCN4-p1をモデルタンパク質として採用し，TFE水溶液中でのMD計算を行った．解析の結果，Helix側鎖とTFE分子のOH基との間の静電相互作用により，TFE分子は逆ミセル配向を取りながら，Helixへのより顕著な溶媒和殻が形成され，Helix誘導能を実現することが明らかとなった．(2)尿素は古くからタンパク質の変性剤として使われており，天然構造を不規則なコイル構造へと導くことが知られている。その分子メカニズムは尿素がタンパク質に強く相互作用することに起因した直接メカニズムと水の構造を乱し疎水性相互作用を変調すること起因した間接メカニズムが提案せれており，議論が続いている．一般に変性効果が強い高濃度尿素水溶液が使われることが多いが，同様のKB積分に基づく解析により，低濃度域での解析から変性メカニズムを議論できる事が示された．この知見に基づき，同様の尿素2 MのMD計算を行った結果，尿素とタンパク質主鎖との静電相互作用およびロンドン分散力により，尿素はHelixよりCoilに強く溶媒和し，変性状態を安定化する事が明らかとなった．

(1)The main reason for the high concentration of TFE in aqueous solution is that it can induce the energy of Helix. Last year, the Kirkwood-Buff(KB) integral of TFE aqueous solution was determined by small-angle X-ray scattering measurement. The aggregation of TFE molecules was induced by the reaction of TFE molecules. The results showed that the direct intermolecular interaction of TFE with Helix was caused by the selected solvent and Helix induced energy. The thermodynamic analysis of this is based on the calculation of MD in TFE aqueous solution using the selected solvent and Weishi app. As a result of the analysis, the electrostatic interaction between the OH group of the Helix side lock and the TFE molecule results in the reverse alignment of the TFE molecule, the formation of the solvent and the shell of the Helix side lock, and the formation of the Helix induced energy. (2)The natural structure is irregular, the structure is irregular, and the natural structure is irregular. The molecular structure of the urea is related to the structure of the water and the interaction of the water. In general, the properties of urea in aqueous solutions of high concentration and high concentration are different, and the KB integral of the same type is different from that in aqueous solutions of high concentration and high concentration. The results of MD calculation of urea 2M show that the electrostatic interaction and dispersion force of urea Helix Coil are strong solvent and stable state.