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対立遺伝子間の優劣に関わるDNAメチル化機構の解析

等位基因之间优劣相关的DNA甲基化机制分析

基本信息

批准号：
19043011
负责人：
柴博史
金额：
$ 3.39万
依托单位：
Nara Institute of Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至 2008
项目状态：
已结题

项目摘要

対立遺伝子間の優劣性の原因として、一方の遺伝子の変異による機能欠損あるいは低下によるものが挙げられるが、それだけでは説明できない事象が多数存在する。本研究応募課題では、これまでアブラナ科植物の自家不和合研究で明らかにした対立遺伝子間の優劣性に関わるde novo DNAメチル化が植物の種々の現象か広く関与している可能性を考え、シロイヌナズナ種内雑種を例にして、優劣性現象の探索およびゲノムワイドなDNAメチル化、遺伝子発現パターンの解析を行う。平成20年度は、対立遺伝子特異的な発現調節の実態を網羅的に解析するための準備段階として、種々のシロイヌナズナの種内雑種を調製した。Arabidopsis thaliana Col-0株の雄性不稔系統(fkp-3、名古屋大学大学院生命農学研究科石黒澄衛准教授より供与)を雌ずい側にして5つの異なる系統(C24,Cvi,Kas,Van,Sha)の花粉を受粉させて種々のF1雑種種子を作出した。また、予備的段階であるが、Col-0株およびC24株の実生からpolyA RNAを抽出し、シロイヌナズナゲノムタイリングアレイを用いたトランスクリプトーム解析に供した。同様に、Col-0株およびC24株の実生からDNAを抽出し、超音波で剪断したDNA断片を作成して抗メチルシトシン抗体で免疫沈降させた。これをシロイヌナズナゲノムタイリングアレイに供し、両株におけるメチル化パターンを解析した。次に植物でも器官特異的なDNAメチル化の変動が見られるかどうかを明らかにすることを目的にCol-0株の花序、成葉、根について、メチローム・トランスクリプトーム解析を行った。また組織・細胞レベルにおける遺伝子発現様態、DNAメチル化パターンの解析を目的として、本年度購入したLaserマイクロダイセクション装置を用いたシロイヌナズナ柱頭乳頭細胞および葯タペート組織の回収およびRNAの抽出を行った.

The reasons for the superiority and inferiority of the two genes, the differences between the two genes, the lack of function, the low level of the two genes, and the existence of the majority of the two genes This study aims to investigate the possibility of the phenomenon of interspecific DNA transformation in plant species, explore the phenomenon of interspecific DNA transformation, and analyze the phenomenon of interspecific DNA transformation. In the 20th year of the year, the analysis of the preparation stage and the regulation of the specific development of the corresponding genes were carried out. Arabidopsis thaliana Col-0 strain male sterile system (fkp-3, Professor Etsuki Ishiguro, Graduate School of Life Agronomy, Nagoya University), female sterile system (C24,Cvi,Kas,Van,Sha) pollen sterile system, F1 sterile seed system. In addition, the sequence of Col-0 strain and C24 strain was extracted and analyzed. The DNA fragments of Col-0 and C24 strains were isolated and isolated by ultrasound. Anti-Col-0 antibodies were prepared. This is the first time I've ever seen a woman who's been in a relationship with a woman. The organ-specific DNA changes of secondary plants were analyzed for inflorescence, leaf formation, root formation, and root formation of Col-0 plants. For the purpose of tissue, cell and DNA analysis, Laser was purchased this year for the purpose of tissue development, DNA analysis and RNA extraction.