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計算物理学分野のGRIDアプリケーションと並列プログラミングシステムの研究

计算物理领域的GRID应用和并行编程系统研究

基本信息

批准号：
15017210
负责人：
佐藤三久
金额：
$ 1.79万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究の目的は、計算物理学分野のアプリケーションに焦点を当て、Grid技術による広域並列分散コンピューティングにより新たな展開が可能になる応用の探索的技術開発と、それを支援する並列プログラミングシステムを構築することである。当該年度においては、これまで開発してきた、Grid上の並列プログラミングのための遠隔呼び出しを行うミドルウエアOmniRPCの詳細な性能評価、OmniRPCを用いたアプリケーションでの実証実験を行った。性能評価では,筑波大学,豊橋技術科学,徳島大学,産業技術総合研究所の5つのサイトにあるクラスターからなるグリッド環境を構築し,ワーカーの実行時間と通信データ量を変化させ,どのようなワークロードの特性を持つアプリケーションにおいて有効なのかを明らかにした。その結果、ジョブの実行時間が2秒でも,ネットワークの性能が高い場合,性能が得られることがあり、16秒の場合ではほとんどの場合において台数効果を期待することができるものの,ネットワークの性能が低い場合において1MB以上の転送を行なうと性能が得られない、などの目安が得られた。また,アプリケーションとして,分子配座探索プログラムをグリッド環境で並列化し実証実験を行った。このプログラムは、対象とする化合物が取り得るすべての立体配座を自動的に発生させ,化学的に重要な配座異性体の最適化構造をもれなくみつけ出すプログラムである。グリッド環境において大規模な問題について実行し、その有効性を確認した。また、計算物理学分野のグリッドアプリケーションとしてこれまで開発してきた、重力専用計算機GRAPE6をグリッド環境にて共有利用するためのシステムHMGS-Gについてはサーバプログラムを見直し,複数サイトからの利用を円滑に行えるように改善した.なお、開発したソフトウエアOmniRPCについてはhttp://www.omni.hpcc.jp/OmniRPCで公開している。

本研究目的之一，是计算物理学分支机构间的相互关系，并将其作为一个整体考虑，网格技术应用于过渡区域的分散排列，并将其作为一个整体考虑。当出现年度不确定性约束条件、不确定性约束条件、网格上的队列不确定性约束条件、网格间隔不确定性约束条件时，OmniRPC不确定性性能约束条件、OmniRPC使用不确定性约束条件、网格间隔不确定性约束条件。性能测试仪，波波大学，激素技术科学，寒潭大学，激素技术前列腺联合研究所，5个实验室，实验室，环境实验购买水果，不动产抵押执行额超过2秒，抵押贷款担保性能超高的复合，性能获得抵押贷款担保申请，16秒抵押贷款担保申请复合抵押贷款担保数量，抵押贷款担保性能低的抵押贷款担保1MB以上的抵押贷款担保性能获得抵押贷款担保，抵押贷款担保项目安获得抵押贷款担保。租赁、租赁合同的转让和租赁形式，分子分配探索租赁合同的订立和转让环境的排列化，产权负担的负担进行评估。化学物质的提取申请，化学物质的提取申请获得许可证，化学物质的提取申请获得许可证，化学物质的提取申请获得许可证。グリッド環境において大規模な問題について実行し、その有効性を確認した。また,計算物理学分野のグリッドアプリケーションとしてこれまで開発してきた,重力専用計算機GRAPE6をグリッド環境にて共有利用するためのシステムHMGS-Gについてはサーバプログラムを見直し,複数サイトからの利用を円滑に行えるように改善した.なお,開発したソフトウエアOmniRPCについてはhttp://www.omni.hpcc.jp/OmniRPCで公開している.