Developing analysis tools of massively parallel cancer evolution simulation to understand intratumor heterogeneity

开发大规模并行癌症进化模拟的分析工具以了解肿瘤内异质性

• 批准号: 17K12773
• 负责人: Niida Atsushi
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2017
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2017-04-01 至 2019-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17K12773/
• 关键词: シミュレーション; がん; 進化; スーパーコンピュータ; 可視化; 癌

项目成果

大腸がんの進化と腫瘍内不均一性

结直肠癌的进化和瘤内异质性

• 发表时间: 2017
• 作者: Takahashi Y;Sugimachi K;Yamamoto K;Niida A;Shimamura T;Sato T;Watanabe M;Tanaka J;Kudo S;Sugihara K;Hase K;Kusunoki M;Yamada K;Shimada Y;Moriya Y;Suzuki Y;Miyano S;Mori M;Mimori K;Atsuahi Niida;新井田厚司;新井田厚司
• 通讯作者: 新井田厚司

Impediment of Replication Forks by Long Non-coding RNA Provokes Chromosomal Rearrangements by Error-Prone Restart.

• DOI: 10.1016/j.celrep.2017.10.103
• 发表时间: 2017-11-21
• 期刊: Cell reports
• 影响因子: 8.8
• 作者: Watanabe T;Marotta M;Suzuki R;Diede SJ;Tapscott SJ;Niida A;Chen X;Mouakkad L;Kondratova A;Giuliano AE;Orsulic S;Tanaka H
• 通讯作者: Tanaka H

Japanese genome-wide association study identifies a significant colorectal cancer susceptibility locus at chromosome 10p14.

• DOI: 10.1111/cas.13391
• 发表时间: 2017-11
• 期刊: Cancer science
• 影响因子: 5.7
• 作者: Takahashi Y;Sugimachi K;Yamamoto K;Niida A;Shimamura T;Sato T;Watanabe M;Tanaka J;Kudo S;Sugihara K;Hase K;Kusunoki M;Yamada K;Shimada Y;Moriya Y;Suzuki Y;Miyano S;Mori M;Mimori K
• 通讯作者: Mimori K

Sensitivity analysis of agent-based simulation utilizing massively parallel computation and interactive data visualization

利用大规模并行计算和交互式数据可视化的基于代理的模拟的敏感性分析

• DOI: 10.1371/journal.pone.0210678
• 发表时间: 2019
• 期刊: PLoS One
• 影响因子: 3.7
• 作者: Niida A;Hasegawa T;Miyano S
• 通讯作者: Miyano S

がんの進化シミュレーション

癌症进化模拟

• 发表时间: 2017
• 作者: Takahashi Y;Sugimachi K;Yamamoto K;Niida A;Shimamura T;Sato T;Watanabe M;Tanaka J;Kudo S;Sugihara K;Hase K;Kusunoki M;Yamada K;Shimada Y;Moriya Y;Suzuki Y;Miyano S;Mori M;Mimori K;Atsuahi Niida;新井田厚司
• 通讯作者: 新井田厚司