Systems biology of AKT signaling

AKT 信号传导的系统生物学

• 批准号: 21240025
• 负责人: KURODA Shinya
• 金额: $ 20.72万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21240025/
• 关键词: Akt; シグナル伝達; システム生物学; 周波数応答; ローパスフィルタ; ローバスフィルタ

In cellular signal transduction, information in an external stimulus is coded as temporal patterns of signaling activities; however, the temporal coding mechanism has been poorly investigated. In this study, we modeled the epidermal growth factor (EGF)-dependent Akt pathway in PC12 cells based on experimental results, and found how the Akt pathway, which is involved in cell growth, specifically transfers temporal information of upstream signals to downstream. In addition, we theoretically analyzed a simple biochemical reaction and found that signal transfer efficiency of transient peak amplitude attenuates depending on the strength of negative regulation, and found that cells can control downstream sensitivity through attenuation of signal transfer efficiency by changing the expression level of negative regulators.

在细胞信号转导中，外部刺激的信息被编码为信号活动的时间模式，然而，时间编码机制的研究很少。在这项研究中，我们模拟了表皮生长因子（EGF）依赖的Akt通路在PC12细胞的基础上的实验结果，并发现Akt通路，这是参与细胞生长，具体地转移上游信号的时间信息到下游。此外，我们对一个简单的生化反应进行了理论分析，发现瞬时峰值幅度的信号传递效率随负调控强度的减弱而减弱，并发现细胞可以通过改变负调控因子的表达水平，通过信号传递效率的减弱来控制下游的敏感性。

项目成果

Latent process genes for cell differentiation are common decoders of neurite extension length

• DOI: 10.1242/jcs.097709
• 发表时间: 2012-05-01
• 期刊: JOURNAL OF CELL SCIENCE
• 影响因子: 4
• 作者: Watanabe, Kanako;Akimoto, Yuki;Kuroda, Shinya
• 通讯作者: Kuroda, Shinya

ERK経路の情報コード

ERK路线信息代码

• 作者: 古賀洋平;et al;黒田真也
• 通讯作者: 黒田真也

Temporal Cording of Insulin Action through Multiplexing of the AKT Pathway

通过 AKT 通路的多重作用实现胰岛素作用的时间编码

• 发表时间: 2012
• 作者: 久保田浩行;野口怜;豊島有;尾崎裕一; 宇田新介;渡邊可奈子;小川渉; 黒田真也
• 通讯作者: 黒田真也

Temporal coding of ERK and AKT signaling networks

ERK 和 AKT 信号网络的时间编码

• 发表时间: 2010
• 作者: K.Kageura;M.Utiyama;T.Abekawa;E.Sumita;黒田真也
• 通讯作者: 黒田真也

AKT経路の情報多重化によるインスリン作用の時間情報コード

AKT 通路信息复用的胰岛素作用时间信息代码

• 发表时间: 2011
• 作者: Araki;Y.;久保田浩行
• 通讯作者: 久保田浩行