Large-scale screening of specific promoters for target neuronal cells and its application to high-order functional analysis in brain

靶神经细胞特异性启动子的大规模筛选及其在脑高阶功能分析中的应用

• 批准号: 22241048
• 负责人: SUZUKI Harukazu
• 金额: $ 24.63万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22241048/
• 关键词: トランスクリプトーム; プロモーター; 視床; トランスジェニックマウス; 回路遺伝学; 睡眠; 脳幹

We have succeeded to develop a technology pipeline to specifically knockdown neuronal cells in any desirable brain regions, which are constructed by integration of the quantitative deepCAGE, the revolutionary technology to identify specific promoters with high accuracy, and the circuit genomics technologies using transgenic mice. Cre transgenic mice, using specific promoters identified by the pipeline, already showed specific recombination in the target regions, indicating usefulness of the mice for the functional analysis of the target brain regions.

我们已经成功地开发了一种技术管道，专门击倒任何理想脑区的神经细胞，这些脑区是通过整合定量深度CAGE和使用转基因小鼠的电路基因组学技术构建的，定量深度CAGE是高精度识别特定启动子的革命性技术。使用管道确定的特定启动子的Cre转基因小鼠，已经在目标区域显示了特定的重组，这表明小鼠在目标大脑区域的功能分析中是有用的。

项目成果

Evolutionary changes of cis-regulatory elements for Ntng1 and Ntng2 genes in the elaboration of neuronal circuits and higher brain functions in vertebrates

Ntng1 和 Ntng2 基因顺式调控元件在脊椎动物神经元回路和高级脑功能中的进化变化

• 发表时间: 2011
• 作者: 矢口邦雄;西村幸子;糸原重美
• 通讯作者: 糸原重美

FANTOM5 phase 1: ヒト及びマウスの網羅的プロモーター解析

FANTOM5 第一阶段：人类和小鼠的全面启动子分析

• 发表时间: 2012
• 作者: T.Nakagawa;S.Seino;S.Kageyama;H.Nitani;T.A.Yamamoto;鈴木治和
• 通讯作者: 鈴木治和

Ntng1とNtng2遺伝子のシス調節エレメントの進化的変化は脊椎動物における高次脳機能と神経回路の精緻化に重要である

Ntng1和Ntng2基因顺式调控元件的进化变化对于脊椎动物的高级大脑功能和神经回路的精细化非常重要

• 发表时间: 2010
• 作者: 矢口邦雄;西村幸子;糸原重美
• 通讯作者: 糸原重美

Identification of transcriptional regulatory elements for Ntng1 and Ntng2 genes in mice.

• DOI: 10.1186/1756-6606-7-19
• 发表时间: 2014-03-19
• 期刊: Molecular brain
• 影响因子: 3.6
• 作者: Yaguchi K;Nishimura-Akiyoshi S;Kuroki S;Onodera T;Itohara S
• 通讯作者: Itohara S

レム睡眠中枢回路とその発生学的起源に関する遺伝学的解析

快速眼动睡眠中枢回路的遗传分析及其胚胎学起源

• 发表时间: 2013
• 作者: 林悠、酒井一弥、安田光佑、Julia Nguyen;安藤れい子、糸原重美
• 通讯作者: 安藤れい子、糸原重美