糖代謝関連酵素遺伝子配列に着目した木材腐朽菌の新規分類手法の開発とその利用

以糖代谢相关酶基因序列为重点的木材腐烂真菌新分类方法的开发与利用

• 批准号: 26850114
• 负责人: 和田 朋子
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: The University of Tokyo (2015)Independent Administrative Institution National Institutes for Cultural Heritage Tokyo National Research Institute for Cultural Properties (2014)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2014 至 2015
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-26850114/
• 关键词: 木材腐朽菌; 糖代謝関連酵素遺伝子; 分子時計解析; 微生物叢; 次世代シーケンス; 微生物業

申請者は最近、糖代謝関連酵素遺伝子配列を用いることで、従来目視で大別されてきた褐色腐朽菌、白色腐朽菌などを各菌の特徴に基づいて系統分類ができる可能性を見出した。そこでこの新規分類法を確立するため本研究では下記項目を研究目的とした。(1)ゲノムデータベース上に登録されている各木材腐朽菌の糖代謝関連酵素遺伝子配列の詳細な解析を行うことで、各木材腐朽菌の特徴に基づいた新規分類手法の開発を行い、その結果から木材腐朽菌の多様性や進化について考察する。(2)国内外の歴史的建造物、木造住宅等から得た実際の試料に、これらの遺伝子配列を用いた木材腐朽菌の分類手法を適用する。1. 木材腐朽菌の分類手法の開発米国エネルギー省ジョイントゲノム研究所、米国・クラーク大学、東京大学などの担子菌ゲノム解析コンソーシアムが現在推進しているゲノムプロジェクトからのゲノムデータベース情報を利用し、種々の木材腐朽菌の菌類の糖代謝経路で反応を触媒する糖代謝関連酵素遺伝子配列を探索した。また、これらの配列を比較することで、各木材腐朽菌の特徴に基づいた系統分類が可能な遺伝子群を探索した。現在論文投稿に向けてこれらの解析結果について取りまとめている。2. 実際の試料を用いた木材腐朽菌の分類手法の適用菌類の上記糖代謝関連酵素遺伝子配列を取得するための条件検討を行った後、京都大学、トルコ・イスタンブル大学との共同研究でご恵与頂いた実際の試料からゲノムDNAを抽出し次世代シーケンス技術を用いて上記糖代謝関連酵素遺伝子配列を取得し系統解析を行った。得られた結果から菌類の分布や動態、検出された菌の起源等について考察した。以上で得られた結果を基に現在投稿論文を執筆中である。

The applicant has recently identified the possibility of using the sequence of enzymes related to sugar metabolism to identify brown rot fungi and white rot fungi based on their characteristics. The purpose of this study is to establish a new classification method for the study of the following items (1)Detailed analysis of the gene sequences of enzymes related to sugar metabolism of wood decay fungi in the database, development of new classification methods based on the characteristics of wood decay fungi, and investigation of diversity and evolution of wood decay fungi. (2)The classification method of wood decay fungi is applicable to the construction of domestic and foreign historical buildings, wooden houses, etc. 1. The development of classification methods for wood-decaying fungi by the National Research Institute of Wood Decay Fungi, the University of Tokyo, and the University of Tokyo has been promoted to explore the gene sequence of enzymes related to sugar metabolism by utilizing information on the classification methods of wood-decaying fungi. The characteristics of wood decay fungi and their phylogenetic classification are discussed. Now the paper submitted to the analysis results of 2. After the study of the conditions for obtaining the gene sequence of enzymes related to sugar metabolism in wood decay fungi, Kyoto University and Kyoto University conducted joint research on the application of the method of classification of wood decay fungi, the systematic analysis of the gene sequence of enzymes related to sugar metabolism was carried out. The results show that the distribution and dynamics of fungi and the origin of fungi are investigated. The above results are based on the submission of papers.

项目成果

Identification of soft-rot fungi existed in the samples from the galley excavated at Yenikapi

耶尼卡皮厨房出土样品中存在软腐真菌的鉴定

• 发表时间: 2014
• 期刊: Proceedings of The 45th Annual Meeting of International Research Group on Wood Protection
• 作者: Tomoko Wada;Coskun Köse;Kiyohiko Igarashi
• 通讯作者: Kiyohiko Igarashi

Microbial flora analysis of Neolithic tree remains from the Yenikapi excavation site in Istanbul, Turkey, using denaturing gradient gel electrophoresis

使用变性梯度凝胶电泳对土耳其伊斯坦布尔耶尼卡皮发掘现场的新石器时代树木遗骸进行微生物菌群分析

• 发表时间: 2015
• 期刊: 保存科学
• 作者: Tomoko Wada;Yuji Nakada;Dilek Dogu;Coskun Kose;Nural Yilgor;Kamile Tirak Hizal;Makoto Yoshida;Kiyohiko Igarashi;S. Nami Kartal;Ken Okada
• 通讯作者: Ken Okada

A survey of microbial deterioration in archaeological wood excavated from Yenikapi, Istanbul, Turkey

对土耳其伊斯坦布尔耶尼卡皮出土考古木材微生物恶化的调查

• 发表时间: 2015
• 作者: Tomoko Wada;Rie Endo;Coskun Kose;Dilek Dogu;Kamile Tirak Hizal;Nural Yilgor;Junji Sugiyama;Kiyohiko Igarashi;S. Nami Kartal
• 通讯作者: S. Nami Kartal

Microflora analysis on the galley excavated at Yenikapi

对耶尼卡皮出土厨房的微生物区系分析

• 发表时间: 2014
• 作者: Tomoko Wada;Coskun Köse;Kiyohiko Igarashi
• 通讯作者: Kiyohiko Igarashi