Sparse MAP inference of cell shapes and spike trains from calcium imaging data

根据钙成像数据对细胞形状和尖峰序列进行稀疏 MAP 推断

• 批准号: 26870577
• 负责人: Takekawa Takashi
• 金额: $ 2万
• 依托单位: Kogakuin University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2014-04-01 至 2016-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-26870577/
• 关键词: カルシウムイメージング; 信号検出; 信号源検出; スパイク時系列; モデル推定; 大規模最適化問題; セルソーティング; スパース性; MAP推定; 最適化; 逐次二次計画法; 内点法; 共役勾配法

项目成果

Automatic inference system of spike trains and cell shapes from large-scale calcium imaging data using non-negative sparse model

使用非负稀疏模型从大规模钙成像数据中自动推断尖峰序列和细胞形状

• 发表时间: 2015
• 作者: Takashi Takekawa;Masaaki Sato;Noriaki Ohkawa;Kaoru Inokuchi;Yasunori Hayashi;Tomoki Fukai
• 通讯作者: Tomoki Fukai

Sparse MAP inference of cell shapes and spike trains from calcium imaging data with non-negative constraints

根据具有非负约束的钙成像数据对细胞形状和尖峰序列进行稀疏 MAP 推断

• 发表时间: 2015
• 作者: Takashi Takekawa;Masaaki Sato;Noriaki Ohkawa;Kaoru Inokuchi;Yasunori Hayashi;Tomoki Fukai
• 通讯作者: Tomoki Fukai

最新の実験技術による大規模データを活かすソーティング技術

利用最新实验技术的大规模数据的分选技术

• 发表时间: 2014
• 作者: Takashi Takekawa;Masaaki Sato;Noriaki Ohkawa;Kaoru Inokuchi;Yasunori Hayashi;Tomoki Fukai;竹川高志
• 通讯作者: 竹川高志

Spike detection from noisy neural data in linear-probe recordings

• DOI: 10.1111/ejn.12614
• 发表时间: 2014-06-01
• 期刊: EUROPEAN JOURNAL OF NEUROSCIENCE
• 影响因子: 3.4
• 作者: Takekawa, Takashi;Ota, Keisuke;Fukai, Tomoki
• 通讯作者: Fukai, Tomoki

Automatic detection system of cell shape and spike timing for calcium imaging data using iterative sequential quadratic programing．

使用迭代顺序二次编程自动检测细胞形状和钙成像数据尖峰时间的系统。

• 发表时间: 2015
• 作者: Takekawa T.;Sato M.;Ohkawa N.;Inokuchi K.;Hayashi Y.;Fukai T.
• 通讯作者: Fukai T.