PCR法を応用したHSV-1の感染源の特定に関する分子疫学的研究

PCR法鉴定HSV-1感染源的分子流行病学研究

• 批准号: 07672228
• 负责人: 藤田 浄秀
• 金额: $ 1.34万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 1994
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1994 至 1996
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-07672228/
• 关键词: HSV; PCR; 分子疫学; 反復配列; PCR法; 反復配列部; ウイルス感染症; 株同定

PCR法の臨床検体への応用.平成8年度研究では,平成7年度に保存ウイルス株にて確立した反復配列部のPCR法の系を臨床検体である唾液およびスワブ検体に応用する為の条件を検討した.これらの検体は組織培養系にて増殖したウイルス株のDNAとは異なりPCRの阻害物質,赤血球,他のウイルス等の混入等が考えられるため,検体の前処理の方法,HSV-1に対する感度および特異性の検討が必要となる.前処理は,Proteinase KおよびDetergentを使用して行い,感度および特異性の検討は,ウイルス分離の結果が判明している臨床検体を用いて,PCRの結果とウイルス分離の結果を比較して行った.今回確立した前処理の系をを用いたPCRの結果は,感度に関してはウイルス分離より高い結果が得られた.特異性に関しては,血清抗体の継続的確認によって,HSV-1に感染していないことが確認できている患者よりの臨床検体を用いて現在検討中である.PCR法によって得られた疫学的関係の結果の検討.また平成7年度で,サザンハイブリダイゼーションにより疫学的関係を判定し得るかの検討の際に使用した臨床分離株42株については,ウイルス分離に使用した臨床検体が全て保存してある.現在,この臨床検体を材料とし,PCR法を用いて反復配列部の株間の差異を検討した疫学的関係の結果と,サザンハイブリダイゼーションおよびフィンガープリント法の結果とを比較して,このPCR法の系の特異性および忠実度を確認している.

Application of PCR in clinical diagnosis. In 2008, we conducted a study to examine the conditions for the use of PCR in clinical specimens and for the establishment of repeat alignment sites for the preservation of these strains in 2007 The DNA of HSV-1 strain, PCR inhibitor, erythrocytes, and the like are examined. The method of pretreatment of HSV-1 strain is necessary. Before treatment,Proteinase K and Detergent were used, sensitivity and specificity were discussed, and the results of their isolation were identified. The results of PCR were determined by the previous processing system. Specificity is concerned with the identification of serum antibodies,HSV-1 infection, identification of HSV-1 infection, use of HSV-1 in clinical specimens, and evaluation of the results of PCR analysis of the epidemiological relationship. In 2007, 42 clinical isolates were used in the study to determine the relationship between the two diseases. Now, this clinical sample material,PCR method was used to study the relationship between the repeated alignment of the strains, and the results of the PCR method were compared to confirm the specificity and fidelity of the PCR method.