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RNA-chromatin interaction prediction and application

RNA-chromatin interaction prediction and application
RNA-染色质相互作用预测及应用
批准号：
17K20032
负责人：
Hamada Michiaki
金额：
$4.08万
依托单位：
Waseda University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2017
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2017-06-30 至 2023-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17K20032/
关键词：
ノンコーディングRNAlncRNAR-loop分子間相互作用リピート要素RNA-DNA相互作用オミクスデータクロマチン長鎖ノンコーディングRNAトランスポゾン相互作用ランダムフォレストRNAクロマチン相互作用RNA

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The analysis of mutational signatures for understanding carcinogenesis considering temporal heterogeneity
考虑时间异质性，分析突变特征以了解致癌作用
DOI： --
发表时间： 2022
期刊：
影响因子： --
作者： [塚原 美緒, 中西 基文, 和泉 慎太郎, 中井 陽三郎, 川口 博, 吉本 雅彦, Kanami Yagimoto(早大)，Shion HOSODA(早大/CBBD-OIL)，Michiaki HAMADA(早大/CBBD-OIL), Shiina NAITO(早大)， Taro Matsutani(早大/CBBD-OIL)， Michiaki HAMADA(早大/CBBD-OIL)]
通讯作者： Shiina NAITO(早大)， Taro Matsutani(早大/CBBD-OIL)， Michiaki HAMADA(早大/CBBD-OIL)
Relationship between abnormal retrotransposition and development of schizophrenia in neurons
神经元逆转座异常与精神分裂症发生的关系
DOI： --
发表时间： 2021
期刊：
影响因子： --
作者： [Miyako Ishihara(早大), Kotaro Sekine(早大), Masahiro Onoguchi(早大/CBBD-OIL), Michiaki Hamada(早大/CBBD-OIL)]
通讯作者： Michiaki Hamada(早大/CBBD-OIL)
A novel fast pipeline for RNA homology search considering secondary structure with E-value calculation
考虑二级结构和E值计算的RNA同源性搜索的新型快速管道
DOI： --
发表时间： 2021
期刊：
影响因子： --
作者： [Kento Kubo(早大), Tsukasa Fukunaga(早大), Michiaki Hamada(早大/CBBD-OIL)]
通讯作者： Michiaki Hamada(早大/CBBD-OIL)
深層学習を用いたRNAアクセシビリティ予測の高速化
使用深度学习加速 RNA 可及性预测
DOI： --
发表时间： 2021
期刊：
影响因子： --
作者： [Kaisei Hara(早大), Natsuki Iwano(早大), Tsukasa Fukunaga(早大/東大), Michiaki Hamada(早大/CBBD-OIL)]
通讯作者： Michiaki Hamada(早大/CBBD-OIL)
共 40 条
    Functional classification of long noncoding RNAs based on functional elements and deep learning
    • 批准号：
      16H05879
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
    • 资助金额：
      $14.98万
    • 财政年份：
      2016
    • 负责人：
      Hamada Michiaki
    • 依托单位：
      Waseda University
    Development of basic technology for privacy-preserving bioinformatics and its application
    Research on structure predictions of RNA with modified nucleotieds
    国内基金
    海外基金
    LncRNA HNRNPA1P21通过诱导M2极化和PD-L1表达促进肺癌进展的机制研究
    • 批准号：
      JCZRLH202601430
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
    • 依托单位：
      荆楚理工学院
    基于KLF4/lncRNA-ZFAS1/Drp1介导的小胶质细胞线粒体动力学稳态失衡机制研究薯蓣健脾益智合剂改善血管性痴呆的作用
    基于 LnCRNA TUG1/KLF2 途径探讨小胶质细胞在 AD 中的炎性活化机制及阿司匹林姜黄素酯抗炎机制研究
    • 批准号：
      2026JJ70134
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      贺春香
    • 依托单位：
      湖南省中医药研究院
    外泌体lncRNA TUG1通过miR-204-5p/FOXC1信号通路靶向调控HUVECs促进肝母细胞瘤血管生成的机制研究
    • 批准号：
      2026JJ81317
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      袁妙贤
    • 依托单位：
      湖南省儿童医院