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環境DNA技術に基づく魚類の年級群および体サイズ推定手法の確立

基于环境DNA技术的鱼类年龄组和体型估算方法的建立

基本信息

批准号：
22KJ3043
负责人：
相馬寿明 (2023)
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Ryukoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ3043/
关键词：
環境DNA 環境RNA ゼブラフィッシュアユ水産資源生物多様性

项目摘要

１．ゼブラフィッシュ (Danio rerio) とアユ (Plecoglossus altivelis) の核rRNA遺伝子領域を対象としたマーカーを新たに開発した。２．ゼブラフィッシュを用いた水槽実験を行い、環境RNAの回収・保存・抽出方法の改良を行った。３．環境DNA濃度と生物量の相関性を核およびミトコンドリア遺伝子マーカー間で比較するために、過去のデータセットの再解析に加え、ゼブラフィッシュを用いた水槽実験を行った。サンプルサイズの少なさ故に遺伝子マーカー間での相関性の違いは統計的有意でなかったもの、核DNAを対象にすることで相関性が向上する例がしばしば見られた。４．環境DNA濃度と生物量の相関性に対する環境DNAの分析方法 (サイズ画分、PCR増幅長) の影響を調べるために、過去のデータセットの再解析に加え、ゼブラフィッシュを用いた水槽実験を行った。分析される環境DNAのサイズ画分によって相関性は著しく変動した一方、この相関性とPCR増幅長は負に相関した。５．環境DNA濃度と生物量の相関性に対する水温の影響を調べるために、数値シミュレーションを行った。水温の上昇に伴い環境DNAの分解速度が高くなるにつれ、相関性は向上する傾向にあった。並行してメタ解析を行い、この相関性は採水時の水温と有意な正の相関を示した。

1. The development of nuclear rRNA gene domain is related to the development of new genes. 2. The improvement of environmental RNA recovery, preservation and extraction methods 3. The correlation between environmental DNA concentration and biomass was studied. The correlation between DNA and DNA was statistically significant. 4. Environmental DNA concentration and biomass correlation analysis method (PCR amplification, PCR amplification) impact of the adjustment, the past and the reanalysis of the addition, the use of water tank The correlation between environmental DNA and PCR was negative. 5. The correlation between environmental DNA concentration and biomass is affected by water temperature. The increase in water temperature is accompanied by a high rate of DNA decomposition, and the correlation is upward. The correlation between water temperature and water temperature during water extraction is shown.