環境DNA技術に基づく魚類の年級群および体サイズ推定手法の確立

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１．ゼブラフィッシュ (<i>Danio rerio<i>) とアユ (<i>Plecoglossus altivelis<i>) の核rRNA遺伝子領域を対象としたマーカーを新たに開発した。２．ゼブラフィッシュを用いた水槽実験を行い、環境RNAの回収・保存・抽出方法の改良を行った。３．環境DNA濃度と生物量の相関性を核およびミトコンドリア遺伝子マーカー間で比較するために、過去のデータセットの再解析に加え、ゼブラフィッシュを用いた水槽実験を行った。サンプルサイズの少なさ故に遺伝子マーカー間での相関性の違いは統計的有意でなかったもの、核DNAを対象にすることで相関性が向上する例がしばしば見られた。４．環境DNA濃度と生物量の相関性に対する環境DNAの分析方法 (サイズ画分、PCR増幅長) の影響を調べるために、過去のデータセットの再解析に加え、ゼブラフィッシュを用いた水槽実験を行った。分析される環境DNAのサイズ画分によって相関性は著しく変動した一方、この相関性とPCR増幅長は負に相関した。５．環境DNA濃度と生物量の相関性に対する水温の影響を調べるために、数値シミュレーションを行った。水温の上昇に伴い環境DNAの分解速度が高くなるにつれ、相関性は向上する傾向にあった。並行してメタ解析を行い、この相関性は採水時の水温と有意な正の相関を示した。