Health checkup of wild orangutans by fecal metagenomics and metaproteomics

通过粪便宏基因组学和宏蛋白质组学对野生猩猩进行健康检查

• 批准号: 22KK0170
• 负责人: 澤藤 匠
• 金额: $ 12.9万
• 依托单位: The Graduate University for Advanced Studies
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-10-07 至 2027-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KK0170/
• 关键词: オランウータン; 糞; メタゲノム; メタプロテオーム; 感染症; 健康

本研究は、野外調査で採取できる糞をメタゲノム・メタプロテオ ーム分析することで、野生動物における疾病の罹患状態、健康負荷、防御反応を総合的に 評価できる新たな「健康診断」の枠組みを確立することを目的としている。動物の糞中に含まれる病原体、ストレ ス応答、生体防御関連のDNAやタンパク質を、最新のメタオミクス技術によって同定し比較することで、野生動物の健康状態やレジリエンスを評価できる。ヒトにもっとも近縁な大 型類人猿の中で唯一アジアに生息し大きな保全価値を持つ野生オランウータンを対象とし、 生態学調査とプロテオミクスに秀でた日本とゲノミクスに秀でたマレーシアの研究者が協働 する。2022年度は内定のあった12月より研究を開始した。研究期間が1年に満たないため、実績はそれほど多くはない。2022年度は、研究代表者や研究協力者が複数回サバ州に渡航し、現地の共同研究者と研究に関する打ち合わせを実施し、ダナムバレイ保護区にて調査地の維持管理の作業を実施し、既存の糞試料を輸出した。輸出の際には、現地政府が定める正式な申請手続きを経て承認された試料のみを輸出した。また、既存の行動・生態データのデジタル化・表計算ソフトへの入力を進め、今後得られるメタゲノム・メタプロテオームのデータとの照合や比較がすぐ行なえるように基盤を整備した。

This study aims to establish a new set of criteria for "health diagnosis" based on a comprehensive evaluation of disease status, health burden, and defense responses in wildlife through field surveys. Animal faeces contain pathogens, pathogens, DNA components associated with biological defense, the latest technologies for identification, comparison, and evaluation of wildlife health. The only way to survive in the wild is to cooperate with researchers in ecological research and development. 2022 Year 2022 Year 2020 Year 2022 Year 2020 Year 202022 Year 2020 Year 202022 Year 202020 Year 2020 Year 202020 Year 20202020 Year The duration of the study was 1 year. In 2022, a number of research representatives and collaborators returned to the state to conduct research, local co-investigators and research cooperation, and maintenance and management of survey sites in protected areas were implemented, and existing fecal samples were exported. When exporting, the local government decides to officially apply for the manual approval of the test sample. For example, the existing mobile, ecological, and table computing software entry force, the future of the mobile, ecological, and table computing software entry force, the future of the mobile, ecological, and table computing software entry force, and the future of the mobile, ecological, and table computing software entry force, the future of the mobile, ecological, and table computing software entry force, and the future of the mobile, ecological, and table computing software entry force.

项目成果

マレーシアサバ―大学(マレーシア)

马来西亚沙巴大学（马来西亚）