ビローム解析による野生イノシシの腸内ウイルスコミュニティの解明と豚との比較

通过病毒组分析并与猪比较阐明野猪肠道病毒群落

• 批准号: 21K05947
• 负责人: 長井 誠
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Azabu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K05947/
• 关键词: イノシシ; 豚; 糞便ウイルス; 新規ウイルス; ウイルス分離; メタゲノム解析; ビローム解析; 腸管ウイルスコミュニティ; ウイルス遺伝子多様性

本研究では、イノシシと豚における腸内ウイルスコミュニティの比較解析を行い、新規ウイルスの発見や家畜及びヒトにおけるウイルスの種間伝播を予測することを目的としている。2022年度はイノシシの糞便67検体及び豚の糞便141検体を採材してウイルス分離及び次世代シークエンスを実施し、前年度以前に検出されたウイルスを含めて解析を実施した。2018年にイノシシからオルソレオウイルスを分離し、このウイルス株が我が国のヒト及び動物園のライオンから分離されたオルソレオウイルスと遺伝子再集合を起こしていることを報告した（Zhang et al. 2021）。今回、豚から5株のオルソレオウイルスを分離し、その全ゲノムを前述のイノシシ、ヒト及びライオン、さらに我が国の下水から検出されたオルソレオウイルスのそれと比較したところ、豚からのオルソレオウイルスは世界各地の豚から分離されたオルソレオウイルスと同様な遺伝子配列を基本として保有するが、S1及びL1遺伝子にイノシシ及び下水由来オルソレオウイルスとの遺伝子再集合、さらにはM1遺伝子にイノシシと豚、S1遺伝子に豚、ヒト及びコウモリ由来オルソレオウイルスとの遺伝子組換えが認められることを見出した（Fukase et al. 2022）。オルソレオウイルスは宿主域が広く、家畜では経済損失を伴う疾病の発生は少ないものの、ヒトで呼吸器、消化管及び中枢神経感染症が報告されていることから、今後もイノシシ及び豚における本ウイルスの動向を監視する必要があると思われる。その他、前年度解析を実施した、イノシシから初めて分離された豚ウイルスアデノウイルス5型について論文発表を行った（Oba et al. 2022）。さらに昨年度報告した世界で初めて分離された牛パレコウイルスについて、我が国における浸潤状況を調査し、イノシシや豚での浸潤は確認されなかったが、我が国の牛に浸潤していることを報告した（Oba et al. 2023）。

The purpose of this study is to predict the interspecific propagation of the species in the intestine, and to determine the occurrence of the species in the intestine. In 2022, 67 samples of feces and 141 samples of feces were collected, separated and analyzed for the next generation. In 2018, Zhang et al.(2021) Now, the five strains are isolated from each other, and all of them are used to isolate the above-mentioned strains, strains, and strains. Now, our country's water supply system is used to isolate the strains from all over the world. S1 and L1 genes are reassembled from their original sources, and now M1 genes are reassembled from their original sources, and S1 genes are reassembled from their original sources (Falkase et al. 2022). It is necessary to monitor the development of respiratory, digestive, and central nervous system infections in the host domain, livestock, and livestock. The previous year's analysis was carried out, and the results were analyzed in detail (Oba et al. 2022). In the last annual report, we investigated and confirmed the infiltration status of China's cattle (Oba et al. 2023).

项目成果

First isolation and genomic characterization of bovine parechovirus from faecal samples of cattle in Japan

日本首次从牛粪便样本中分离出牛副肠孤病毒并进行基因组表征

• DOI: 10.1099/jgv.0.001718
• 发表时间: 2022
• 期刊: Journal of General Virology
• 影响因子: 3.8
• 作者: Oba Mami;Sakaguchi Shoichi;Wu Hong;Fujioka Yoshihiko;Takemae Hitoshi;Oki Hisako;Kawai Megumi;Shiokawa Mai;Aoki Hiroshi;Fukase Yuka;Madarame Hiroo;Nakano Takashi;Mizutani Tetsuya;Nagai Makoto
• 通讯作者: Nagai Makoto

Prevalence and genetic diversity in bovine parechovirus infecting Japanese cattle

感染日本牛的牛副肠孤病毒的流行率和遗传多样性

• DOI: 10.1007/s00705-023-05712-x
• 发表时间: 2023
• 期刊: Archives of Virology
• 影响因子: 2.7
• 作者: Oba Mami;Obinata Shiho;Takemae Hitoshi;Kazama Kei;Oguro Masashi;Ito Kazuki;Kakinuma Seiichi;Ishida Hiroho;Murakami Hironobu;Sakaguchi Shoichi;Mizutani Tetsuya;Nagai Makoto
• 通讯作者: Nagai Makoto

Genomic diversity and intragenic recombination of species C rotaviruses

• DOI: 10.1099/jgv.0.001703
• 发表时间: 2022-01-01
• 期刊: JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY
• 影响因子: 3.8
• 作者: Oki, Hisako;Masuda, Tsuneyuki;Nagai, Makoto
• 通讯作者: Nagai, Makoto

Genetic diversity, reassortment, and recombination of mammalian orthoreoviruses from Japanese porcine fecal samples

• DOI: 10.1007/s00705-022-05602-8
• 发表时间: 2022-09-16
• 期刊: ARCHIVES OF VIROLOGY
• 影响因子: 2.7
• 作者: Fukase, Yuka;Minami, Fujiko;Nagai, Makoto
• 通讯作者: Nagai, Makoto