Vergleichende Genomanalyse von pathogenen und apathogenen Neisserien des Nasenrachenraumes: Evolution der Pathogenität bei natürlich kompetenten Bakterien

鼻咽致病性和非致病性奈瑟菌的比较基因组分析：自然感受态细菌致病性的进化

• 批准号: 5111058
• 负责人: Professor Dr. Ulrich Vogel
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Hygiene und Mikrobiologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Priority Programmes
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 1997-12-31 至 2004-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5111058?language=en
• 关键词: Vergleichende; Genomanalyse; von; pathogenen; und

In der ersten Förderperiode des Schwerpunktprogramms wurden mittels repräsentativer Differenzanalyse (RDA) DNA-Fragmente von Neisseria meningitidis isoliert, die nicht bei der apathogenen Spezies Neisseria lactamica vorkommen. Unter den Fragmenten befanden sich drei Restriktions/Modifikationssysteme (RMS), die bei bedeutenden klonalen Linien der Meningokokken differentiell verteilt waren. Weitere Analysen ergaben, daß zwischen diesen klonalen Gruppierungen der DNA-Transfer durch natürliche Transformation im Modell der Ko-Kultur reduziert ist, und daß mindestens eines der drei RMS ursächlich an dieser Transformationsblockade beteiligt ist. Wir postulieren, daß durch differentiell verteilte RMS klonale Gruppierungen und somit die Populationsstruktur von Neisseria meningitidis stabilisiert werden (siehe beiliegendes Manuskript). In der zweiten Förderperiode sollen diese Ergebnisse vertieft und erweitert werden. Hierzu sollen durch verschiedene experimentelle und in silico- Ansätze weitere differentiell verteilte RMS bei Meningokokken identifiziert werden. Die RMS sollen molekularbiologisch und biochemisch charakterisiert werden. Die Einfluß der RMS auf die natürliche Transformation soll u.a. durch multiple "knock-out" Mutationen untersucht werden. Wir erwarten von diesen Arbeiten einen wichtigen Beitrag für das Verständnis der Populationsstruktur dieses bedeutenden humanen Pathogens. Zusätzlich zu diesen oben beschriebenen Arbeiten soll eine cDNA-RDA etabliert und durchgeführt werden, mit der differentiell exprimierte Gene bei nahe verwandten Meningokokkenlinien unterschiedlicher Virulenz untersucht werden sollen, die sich mit konventioneller RDA nicht erfassen lassen. In Kooperation mit der Arbeitsgruppe von Mark Achtman (Berlin) soll schließlich der sog. "Selective Sweep" anhand des Kapselsynthese-Genclusters von Neisseria meningitidis untersucht werden. Hier sollen bereits begonnene Arbeiten zum Thema "Evolution der Pathogenität" innerhalb des Schwerpunktprogramms fortgeführt werden.

在Schwerpunktprogramms的第一个Förderperiode中，使用了代表性的脑膜炎奈瑟菌DNA片段差异分析（RDA），而不是类似于内酰胺奈瑟菌的病原菌。在这三个限制/修改系统（RMS）之前的碎片中，有一个被定义为不同版本的脑膜炎病毒的克隆线。通过分析，我们可以发现，通过自然转化的DNA转移在文化模式中的重要作用，以及三个RMS的破坏性作用，这些转化被阻断。我们通过不同的RMS菌株群来确定脑膜炎奈瑟菌的种群结构（参见手册）。在第二个Förderperiode sollen这个Ergebnisse vertieft和erweitert韦尔登。Hierzu sollen durch versatiedene experimentelle und in silico- Ansätze weitere differentiell verteilte RMS bei Meningokokokken identifiziert韦尔登。RMS溶液的分子生物学和生物化学特性可由韦尔登确定。RMS对自然转型的影响。通过多次“敲除”突变获得韦尔登。我们需要关注这些劳动力，以了解人类病原体的人口结构。因此，使用cDNA-RDA的方法可以建立并通过韦尔登，使用不同的表达基因的脑膜炎病毒株进行测序韦尔登可以解决，而使用传统的RDA则不能。在与马克·阿赫特曼（柏林）的劳动小组合作中，他的工作非常出色。“选择性清扫”和Kapselsynthes-Genenclusters von Neisseria meningitidis untersucht韦尔登。在此基础上，开始了“病原体的进化”这一主题的研究，这一主题与韦尔登的Schwerpunktprograms密切相关。