Identifikation von Schlüsselgenen in der Pathogenese Myelodysplastischer Syndrome (MDS) mittels "high-density" Genomanalyse

利用高密度基因组分析鉴定骨髓增生异常综合征 (MDS) 发病机制中的关键基因

• 批准号: 50848630
• 负责人: Professor Dr. Daniel Nowak
• 金额: --
• 依托单位: III. Medizinische Klinik: Hämatologie und Internistische Onkologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Fellowships
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2006-12-31 至 2008-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/50848630?language=en
• 关键词: Identifikation; von; Schl; sselgenen; der

Das Myelodysplastische Syndrom (MDS) ist eine klonale Knochenmarkserkrankung, die durch eine Blutbildungsstörung gekennzeichnet ist und im Verlauf in ca. 50% der Fälle in eine Akute Myeloische Leukämie (AML) transformieren kann. Es gibt zahlreiche Hinweise dafür, dass die Entstehung eines MDS auf die Akkumulation genetischer Schäden in hämatopoetischen Zellen des Knochenmarks zurückzuführen ist. Über die Art dieser Läsionen ist bisher jedoch nur wenig bekannt. Kürzlich wurde mit der Einführung von 500K SNP mapping arrays eine sehr robuste Technologie auf der Basis von microarrays entwickelt, die erstmals eine detaillierte gesamtgenomische Analyse dieser genetischen Veränderungen erlaubt. Mit diesen microarray Chips können insgesamt 500.000 SNPs (single nucleotide polymorphisms) in genomischer DNA abgefragt werden, was einer medianen Abtastungsdichte von ca. 2500 kb entspricht, und somit kann fast jedes Gen im gesamten Genom erfasst werden. Durch die Intensitätsmessungen auf dem Chip können kleinste Verluste oder Multiplikationen genetischen Materials delektiert werden. Die Erstellung des Genotyps durch die SNP Kartierung erlaubt darüber hinaus die Feststellung von Loss of Heterozygosity (LOH) oder uniparentaler Disomie (UPD). In diesem Forschungsprojekt stehen über 250 anonymisierte Proben genomischer DNA aus Knochenmark von MDS Patienten mit entsprechender klinischer Information für die Untersuchung mit 500K Chips zur Verfügung. Durch die hochauflösende genetische Untersuchung dieser Proben sollen aberrante Gene im MDS identifiziert werden und möglicherweise neue prognostische Marker für die Erkrankung erstellt werden. Des Weiteren könnten möglicherweise ein neues Subklassifizierungssystem entwickelt und neue Zielgene für molekulare Therapien entdeckt werden.

骨髓增生异常综合征(MDS)是一种由Knochenmarkserkrankung、Die dch eine Blutbildungsstörung gekennzeichnet ist和im Verlaf in约50%der Fälle in eine Akut Myeloische Leukämie(AML)Transform ieren kann.他说：“这是一件很重要的事情，因为这件事发生了。艺术家L是比舍尔的杰多克·努尔·维尼格·贝坎特。Kürzlich wurde MIT der Einführung von 500K SNP作图阵列是一种稳健的技术，它基于von微阵列包裹体，分析柴油基因的细节。麻省理工学院基因芯片中的500.000个SNPs(单核苷酸多态)在基因组中缺失约2500kb。从材料的多样性角度来看，这是一种非常重要的技术。De Erstellung des Genotyps dch die SNP Kartierung erlabt darüber hinaus die Feststellung von Lost of Heterozygity(LOH)or Unparentaler Disomie(UPD)。在Diesem Forschungsprojekt stehenüber 250匿名者Proben Genomischer DNA Aus Knochenmark von MDS Patienten MIT Ensprechner klinischer Information für die Untersuung MIT 500K Chip zur Verfügung。在MDS识别的基因和新的预测标记物的基础上，发现了一种新的诊断方法。在新的亚克拉西菲兹系统和新的治疗方法中，我们需要更多的时间和精力。

项目成果

Molecular allelokaryotyping of T-cell prolymphocytic leukemia cells with high density single nucleotide polymorphism arrays identifies novel common genomic lesions and acquired uniparental disomy

利用高密度单核苷酸多态性阵列对 T 细胞幼淋巴细胞白血病细胞进行分子等位核型分析，鉴定出新的常见基因组病变和获得性单亲二体性

• DOI: 10.3324/haematol.2008.001347
• 发表时间: 2009
• 期刊: Haematologica
• 影响因子: 10.1
• 作者: Nowak D;Le Toriellec E;Stern MH;Kawamata N;Akagi T;Dyer MJ;Hofmann WK;Ogawa S;Koeffler HP
• 通讯作者: Koeffler HP