リグニン代謝系多重遺伝子族エ-テラーゼの構造と発現制御
木质素代谢系统多基因家族醚酶的结构及表达调控
基本信息
- 批准号:08760074
- 负责人:
- 金额:$ 0.64万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
- 财政年份:1996
- 资助国家:日本
- 起止时间:1996 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
リグニン分解で最も重要な反応段階であるβ-アリールエーテル開裂に関与するSphingomonas paucimobilis SYK-6のligDFE遺伝子下流領域の塩基配列を決定した。その結果、ligEの78-bp下流に795-bpのopen rerading frameが見いだされligGと命名した。ligGの推定アミノ酸配列はオーキシンで誘導されるタバコのグルタチオンS-トランスフェラーゼ(GST)様酵素と24%の相同性を示したのをはじめ、多くの植物由来GSTと相同性を示した。このことからβ-エ-テラーゼ・オペロンには3種の異なるGST様遺伝子(ligFEG)が存在することが示された。ligGは大腸菌において顕著な発現が見られなかったため、6XHis tagを持つ融合遺伝子として発現を行った。発現した約30kDaの蛋白質を用いてβ-エーテル開裂能とGSTの各種基質に対する反応性を調べたが、いずれの基質にも反応性を示さなかった。LigGはβ-アリールエーテル開裂以外の反応に関与しているものと考えられた。ligDFEGの発現制御を明らかにするために、各種リグニンモデル化合物の存在下とLB培地で生育したSYK-6のβ-エ-テラーゼ活性を比較したところβ-エーテル化合物によって4倍程度の活性化が見られた。この活性化が転写レベルでおきていることを確認するために、ligD内部に相同組換えによってlacZ遺伝子をレポーターとして導入した株を作製した。その株のLacZ活性はリグニンモデル化合物によって2倍程度の活性化が認められ、β-エーテル化合物によっては3倍以上の活性化が見られた。このことからβ-エ-テラーゼオペロンはそのレベルは高くないものの、β-エ-テラーゼ化合物によって特異的に転写誘導されることが示唆された。
The most important part of the decomposition is the β-cleavage of the Sphingomonas paucimobilis SYK-6, which determines the base alignment in the downstream region of the ligDFE. As a result, the 78-bp downstream of ligE and the 795-bp downstream of ligG were named. The putative acid sequence of ligG is shown to be 24% identical to that of GST. This is the case with three different GST vectors (ligFEG). LigG is the most common form of E. coli, and 6XHis tag is the most common form of fusion. The protein of about 30kDa was found to be able to modulate the reactivity of GST in various substrates. Ligg β-ray ray In the presence of various kinds of compounds, the β-teratogenic activity of SYK-6 was 4-fold higher than that of the β-teratogenic compounds. The activation of this gene is the same as that of the original gene. The LacZ activity of the plant is 2 times higher than that of the beta-lacZ compound, and 3 times higher than that of the beta-lacZ compound. The β-tetralogy compound was induced by the reaction of β-tetralogy compound.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
政井 英司其他文献
深層学習を用いた湿害脆弱圃場の空間分布予測―広島県中山間地の事例-
利用深度学习预测湿害脆弱地区的空间分布 - 以广岛县山区为例 -
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
新沼 皐;荒木 拓馬;上村 直史;政井 英司;清水裕太 - 通讯作者:
清水裕太
Sphingobium sp. SYK-6株の外膜におけるフェニルクマラン型化合物取り込みシステムの解明
鞘氨醇 SYK-6 菌株外膜中苯基香豆素型化合物摄取系统的阐明。
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
藤田 雅也;柴田 昴輝;田辺 幹雄;千田 俊哉;上村 直史;政井 英司 - 通讯作者:
政井 英司
Sphingobium sp. SYK-6株におけるアセトバニロン代謝経路の同定
Sphingobium sp. SYK-6 菌株中乙酰香草酮代谢途径的鉴定
- DOI:
- 发表时间:
2014 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
樋口 雄大;菖蒲田 透;上村 直史;原 啓文;笠井 大輔;片山 義博; 福田 雅夫;政井 英司 - 通讯作者:
政井 英司
フェルラ酸代謝制御系を利用したリグニン由来芳香族化合物センサー
使用阿魏酸代谢控制系统的木质素衍生芳香族化合物传感器
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
白濱 里帆;室 佳史乃;上村 直史;政井 英司 - 通讯作者:
政井 英司
リグニンの生分解を解析するためのバクテリアセンサーの開発
开发用于分析木质素生物降解的细菌传感器
- DOI:
- 发表时间:
2023 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
上村 直史;白濱 里帆;亀井 一郎;政井 英司 - 通讯作者:
政井 英司
政井 英司的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('政井 英司', 18)}}的其他基金
リグニン主要分解中間体・シリンガ酸の代謝に関与する新規芳香環開裂系遺伝子群の解析
分析参与主要木质素分解中间体丁香酸代谢的新型芳环裂解基因
- 批准号:
13760062 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
リグニン分解系・プロトカテク酸メタ開裂経路の遺伝子・酵素群の全容解明
完整阐明木质素分解系统和原儿茶酸元裂解途径的基因和酶
- 批准号:
11760057 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
リグニン分解系遺伝子群の染色体上における配置と構造
木质素降解基因在染色体上的位置和结构
- 批准号:
09760077 - 财政年份:1997
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
生分解性素材を使用した小児用人工弁輪の開発
使用可生物降解材料开发儿科人工瓣膜环
- 批准号:
24K11961 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
生分解性樹脂PHAとPCLの混合樹脂からなる繊維における生分解抑制要因の解明
生物降解树脂PHA和PCL混合树脂纤维生物降解抑制因素的阐明
- 批准号:
24K17739 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
生分解性キレート剤を利用した玄武岩層へのCO2地中貯留・鉱物固定促進法
使用可生物降解的螯合剂促进玄武岩层中CO2地下储存和矿物固定的方法
- 批准号:
24K01412 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
肺気道内定量的バイタルモニタリングのための生分解性埋込み型マルチモーダルセンサ
可生物降解的植入式多模式传感器,用于肺气道定量生命监测
- 批准号:
24K21094 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
自己細胞により完全自己血管化する静脈用緩徐生分解性シルクフィブロイン人工血管基盤
可缓慢生物降解的丝素蛋白人工静脉血管基底,由自体细胞完全自体血管化
- 批准号:
23K27659 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
生分解性材料の表面化学修飾による生分解開始機能の開発
通过生物降解材料的表面化学修饰开发生物降解引发功能
- 批准号:
24KJ0616 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
複合触媒系による可視光を利用した二酸化炭素を原料とした生分解性高分子モノマー合成
以二氧化碳为原料,采用可见光,采用复合催化剂体系合成可生物降解聚合物单体
- 批准号:
23K23140 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
分子サイズを鍵にして水圏溶存有機物の生分解モデルを刷新する
以分子大小为关键创新水生空间溶解性有机物生物降解模型
- 批准号:
24K15283 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
オゾンよる汚泥中繊維状マイクロプラスチックの化学的改質・生分解
利用臭氧对污泥中纤维微塑料进行化学改性和生物降解
- 批准号:
23K28259 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
生分解性とモノマー配列・化学構造の相関から導く3HB含有交互共重合体の開発
根据生物降解性、单体排列和化学结构之间的相关性开发含 3HB 的交替共聚物
- 批准号:
24K20953 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists