環状構造を有する免疫抑制剤のコンフォメーション制御機構の解明

阐明环状结构免疫抑制剂的构象控制机制

• 批准号: 08877319
• 负责人: 多賀 徹
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 1997
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08877319/
• 关键词: 免疫抑制剤; 環状分子コンフォメーション; モンテカルロシミュレーション

大環状構造を有する分子である免疫抑制剤FK506やシクロスポリンAのコンフォメーションは遊離の状態と蛋白質との複合体を形成した状態とで異なる。この環状構造の変化の解析は制御機構の解明にとって重要であり、そのため、経験的ポテンシャル関数を使ったモンテカルロシミュレーションプログラムを開発し、遊離型、結合型のコンフォメーションの違いの詳細な検討をおこなってきた。環状分子の初期構造座標をコンピュータ上で設定した後、それらの構造を分子シミュレーションにより検討した結果、両構造に対し合理的エネルギー分布が得られ、孤立分子として比較的安定なローカル構造であることが分かった.しかし側鎖のねじれ角の分布に大きな違いがある場合があるなど、溶媒の影響を受けやすい側鎖が存在し、環状構造の変化にたいする溶媒水分の役割の重要性が明らかになった。そこで分子のコンフォメーションにたいする結合水分子の影響をペプチドや糖鎖など水分子結合構造のX線結晶構造解析により検討した。また新たに開発したプログラムを用いた理論計算によりFK506結合蛋白質複合体の結晶構造中で蛋白質に強く結合する水構造の予測計算をおこなった。理論的に予測された水はProtein Data Bank中の結晶構造中の実測の水と良い一致を示したが、これらの結果は環状分子構造変化に対する水分子の役割を考える重要な手がかりを与えるものと考えられる。

The macrocyclic structure of FK506 can be used as an immunosuppressant for the formation of protein complexes. The analysis of the transformation of the ring structure and the analysis of the control mechanism of the ring structure are discussed in detail. The initial structural coordinates of cyclic molecules are set at the top of the structure, and the structure of cyclic molecules is set at the top of the structure. The distribution of side locks and the importance of solvent moisture in the distribution of side locks and the influence of solvents are obvious. The influence of bound water molecules on the molecular structure of these molecules was also investigated by X-ray crystallographic analysis of the binding structures of sugar chains and water molecules. New developments have been made using theoretical calculations to predict the structure of FK506-bound protein complexes in crystalline structures and strongly bound proteins in aqueous structures. The theoretical prediction of water in the crystal structure of the protein Bank is consistent with the results of the analysis of water molecules.

项目成果

多賀 徹: "α,β-trehalose monohydrate" Acta Crystallographica. C53. 234-236 (1997)

Toru Taga：“α,β-海藻糖一水合物”晶体学报 234-236 (1997)。