课题基金 / 基金详情

堆積物中化石DNAによる古海洋物質循環システムの変遷解明

堆積物中化石DNAによる古海洋物質循環システムの変遷解明
利用沉积物中的化石DNA阐明古海洋物质循环系统的变化
批准号:
13J10453
负责人:
山口 保彦
金额:
$2.53万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2013
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2013-04-01 至 2016-03-31

项目摘要

项目成果

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1.前年度までに酸化還元状態とDNA量を調べた、日本海の表層堆積物試料について、次世代シーケンサーを用いて18S rRNA遺伝子の配列決定を行った。また、生物情報学ソフトウェア(MothurとARB)を使用できる計算機環境を整備し、それらのソフトウェアを用いて、配列データから真核生物の群集組成を明らかにした。その結果、群集組成は、堆積物の酸化還元状態によって異なり、DNAの保存に酸化還元状態が影響していることが示唆された。浅部と深部との比較によって、堆積物中でDNAが比較的残存しやすい生物グループを特定した。また、堆積物試料中の有機炭素・窒素の濃度や安定同位体組成を、元素分析計-同位体比質量分析計を用いて測定した。2.海洋環境試料中に含まれるアミノ酸の立体異性体比(D/L比)を精度良く測定する手法を確立し、北太平洋ハワイ沖と米国カリフォルニア沖の懸濁態有機物・溶存態有機物試料に適用した。水深や季節、有機物の放射性炭素年代によって、様々なアミノ酸に関してD/L比の変動が見られ、バクテリアの寄与などの推定を行った。3.北太平洋ハワイ沖の懸濁態有機物・溶存態有機物試料について、アミノ酸窒素同位体組成(起源生物や微生物分解の指標)を分析した。その結果、海洋表層および海洋中深層の溶存態有機窒素の起源は、ともに従属栄養バクテリアが主であることが明らかになった。特に、海洋表層の溶存態有機窒素は主に硝酸塩を窒素源に生成されている可能性、海洋中深層の溶存態有機窒素は中深層の懸濁態有機物から生成されている可能性が、それぞれ示唆された。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Sources, Transformation, and Linkage of Dissolved and Particulate Organic Nitrogen in the Oligotrophic Ocean Indicated by Compound-Specific Nitrogen Isotope Analysis of Amino Acids
氨基酸化合物特异性氮同位素分析表明寡营养海洋中溶解和颗粒有机氮的来源、转化和联系
DOI: --
发表时间: 2016
期刊:
影响因子: --
作者: [Yamaguchi, Y.T., McCarthy M.D.]
通讯作者: McCarthy M.D.
Heterotrophic sources for dissolved organic nitrogen in the oligotrophic ocean indicated by nitrogen isotopic analysis of individual amino acids
通过单个氨基酸的氮同位素分析表明寡营养海洋中溶解有机氮的异养来源
DOI: --
发表时间: 2016
期刊:
影响因子: --
作者: [Yamaguchi, Y.T., McCarthy M.D.]
通讯作者: McCarthy M.D.
Effects of sedimentary redox conditions on Eukaryotic DNA recorded in deep-sea sediments
沉积氧化还原条件对深海沉积物中记录的真核DNA的影响
DOI: --
发表时间: 2016
期刊:
影响因子: --
作者: [Yamaguchi Y.T., Kouduka M., Yamazaki T., Kawamura N., Seike K., Sakuramoto Y., Okutsu N., Suzuki Y.]
通讯作者: Suzuki Y.
海洋堆積物深部のアミノ酸の生物地球化学的動態 : 化合物レベル窒素同位体組成とD/L比からの制約
深海沉积物中氨基酸的生物地球化学动力学:化合物水平氮同位素组成和 D/L 比的约束
DOI: --
发表时间: 2013
期刊:
影响因子: --
作者: [山口 保彦, 力石 嘉人, 高野 淑識, 小川 奈々子, 菅 寿美, 横山 祐典, 大河内 直彦]
通讯作者: 大河内 直彦
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    細菌由来サブミクロン粒子が生物ポンプを駆動する可能性の探索
    • 批准号:
      24K03078
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.9万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      山口 保彦
    • 依托单位:
    Microbial Nitrogen Pump: Bacterial semi-labile dissolved organic nitrogen as a nutrient transport pathway in aquatic systems
    • 批准号:
      21H03584
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.07万
    • 财政年份:
      2021
    • 负责人:
      山口 保彦
    • 依托单位:
    Development of high-precision nitrogen isotope analysis as a new index of dissolved organic matter sources in aquatic environments
    • 批准号:
      18K18189
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    • 资助金额:
      $2.58万
    • 财政年份:
      2018
    • 负责人:
      山口 保彦
    • 依托单位:
    アミノ酸窒素同位体組成を用いた、微生物が駆動する海底下物質循環の解明
    • 批准号:
      10J06167
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.34万
    • 财政年份:
      2010
    • 负责人:
      山口 保彦
    • 依托单位:
    海外基金