Role of fluctuation in regulating the elastic-plastic property of tissues during organogenesis
Role of fluctuation in regulating the elastic-plastic property of tissues during organogenesis
批准号:
22K18749
负责人:
奥田 覚
金额:
$4.16万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2022-06-30 至 2024-03-31
中文摘要
本研究では、器官の形成過程は,ミクロな分子・細胞レベルの力発生により駆動される動的な変形過程であり,マクロな器官レベルにおいて頑強に制御されている.近年,器官発生の進行に応じて,器官を構成する組織の弾塑性が適応的に変化することが分かってきた.特に,この組織の弾塑性を介して,内部構造である細胞骨格や接着構造等のアクティブなゆらぎが,組織の形態形成を制御している可能性がある.そこで本研究では,器官形成にみられる分子・細胞レベルの内部構造ゆらぎが,マルチスケールな相互作用を介して,組織の弾塑性をどのように制御するのかを解明する.これまでの研究により、細胞骨格から多細胞までを繋ぐマルチスケールな新規力学シミュレーション手法の開発に成功した。この基盤モデルでは、細胞表面の膜は質量を保存しない粘性流体膜として扱った。また、細胞の形態は三角形メッシュで離散化し、その動態は実効的な力学エネルギーと散逸関数で表現した。膜の運動により歪んだメッシュ構造は、改良した動的リメッシング手法により、動的に最適化した。提案した基盤モデルを検証するため、数値シミュレーションを行い、膜の流れが物理的に矛盾なく再現されること、リメッシング手法の影響が無視できることを示した。さらに、開発した基盤モデルの有用性を示すために、マランゴニ効果に類似した細胞運動の数値シミュレーションを実施した。結果として得られた細胞運動は既存の解析解と一致しており、開発した基盤モデルが膜のターンオーバーを伴う細胞の長時間動態を定量的に再現できることが示された。本基盤モデルは、細胞膜動態の単純な記述に基づき、様々な細胞の形や動きを解析するための有用な基盤を提供するものである。
英文摘要
本研究では、器官の形成過程は,ミクロな分子・細胞レベルの力発生により駆動される動的な変形過程であり,マクロな器官レベルにおいて頑強に制御されている.近年,器官発生の進行に応じて,器官を構成する組織の弾塑性が適応的に変化することが分かってきた.特に,この組織の弾塑性を介して,内部構造である細胞骨格や接着構造等のアクティブなゆらぎが,組織の形態形成を制御している可能性がある.そこで本研究では,器官形成にみられる分子・細胞レベルの内部構造ゆらぎが,マルチスケールな相互作用を介して,組織の弾塑性をどのように制御するのかを解明する.これまでの研究により、細胞骨格から多細胞までを繋ぐマルチスケールな新規力学シミュレーション手法の開発に成功した。この基盤モデルでは、細胞表面の膜は質量を保存しない粘性流体膜として扱った。また、細胞の形態は三角形メッシュで離散化し、その動態は実効的な力学エネルギーと散逸関数で表現した。膜の運動により歪んだメッシュ構造は、改良した動的リメッシング手法により、動的に最適化した。提案した基盤モデルを検証するため、数値シミュレーションを行い、膜の流れが物理的に矛盾なく再現されること、リメッシング手法の影響が無視できることを示した。さらに、開発した基盤モデルの有用性を示すために、マランゴニ効果に類似した細胞運動の数値シミュレーションを実施した。結果として得られた細胞運動は既存の解析解と一致しており、開発した基盤モデルが膜のターンオーバーを伴う細胞の長時間動態を定量的に再現できることが示された。本基盤モデルは、細胞膜動態の単純な記述に基づき、様々な細胞の形や動きを解析するための有用な基盤を提供するものである。
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Computational simulations of cell and tissue dynamics
细胞和组织动力学的计算模拟
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[S. Kishigami, Y. Matsumoto, Y. Ogawa, Y. Mizokami, D. Shiozawa, T. Sakagami, M. Hayashi, N. Arima, Satoru Okuda]
通讯作者:
Satoru Okuda
Polarized interfacial tension induces collective migration of cells, as a cluster, in a 3D tissue
极化界面张力诱导 3D 组织中细胞作为簇的集体迁移
DOI:
10.1016/j.bpj.2022.04.018
发表时间:
2022
期刊:
Biophysical Journal
影响因子:
3.4
作者:
[Okuda Satoru, Sato Katsuhiko]
通讯作者:
Sato Katsuhiko
多細胞ダイナミクスの汎用的計算手法: 3Dバーテックスモデルと非保存流体膜モデル
多细胞动力学通用计算方法:3D顶点模型和非保守液膜模型
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[三角宣博, 山田浩之, 小笠原永久, 一筆稜平, 樋口理宏, 比江嶋祐介, 新田晃平, 奥田覚]
通讯作者:
奥田覚
上皮組織の適応的な曲げ特性とその分子制御機構の解明
阐明上皮组织的适应性弯曲特性及其分子控制机制
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[寺西亜生, 奥田覚]
通讯作者:
奥田覚
Collective migration of cells as a sheet and cluster in 3D space
细胞在 3D 空间中以片状和簇状集体迁移
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Nguyen Quang Minh, 大塚雄市, Duong Thanh Tung, 宮下幸雄, Satoru Okuda]
通讯作者:
Satoru Okuda
共 13 条
三次元多細胞組織のアクティブな機械特性とその適応的な制御機構の解明
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批准号:23K20904
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$1.91万
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财政年份:2024
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负责人:奥田 覚
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依托单位:
Active mechanical properties of three-dimensional multicellular tissues and their adaptive regulatory mechanisms.
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批准号:21H01209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.15万
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财政年份:2021
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负责人:奥田 覚
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依托单位:
溶融高分子の内部において分子鎖が形成するからみあい構造のダイナミクス解析
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批准号:10J01270
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2010
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负责人:奥田 覚
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依托单位:
海外基金