気候変動時代の病害防除を見据えた植物病原細菌研究のパラダイムシフトへの挑戦

着眼于气候变化时代的疾病控制,挑战植物病原细菌研究的范式转变

基本信息

  • 批准号:
    22K19178
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 4.08万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-06-30 至 2025-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

本研究では、植物病原細菌Pseudomonas syringaeが高湿度環境で発揮するエフェクターに依存しない病原性発現機構の解明を目的としている。そのために、(研究項目1)植物体内増殖を病原性の指標として、その程度が高湿度環境下で変化するP. syringae変異体をスクリーニングし、(研究項目2)その原因遺伝子によって制御される生理機能を明らかにすることを目指した。(研究項目1)エフェクターを分泌できないP. syringae変異体の恒常的発光株“hrcC-lux”を独自に作出した。hrcC-luxのTn5トランスポゾン変異体ライブラリを構築し、発光レベルを指標とした定量的スクリーニングにより、高湿度環境下における増殖量が変化する変異体を選抜した。およそ1600変異体のスクリーニングから、35変異体を選抜した。このうちの30変異体については、TAIL-PCR法やinverse PCR法によってTn5トランスポゾンの挿入位置を同定した。(研究項目2)研究項目1で同定した原因遺伝子の中には、ヌクレオチド代謝、ヘム合成、解糖系やTCA回路に関与する遺伝子が含まれていた。これらの代謝経路に加えて、種々のアミノ酸合成に必要な遺伝子も含まれていた。興味深いことに、これらのアミノ酸合成遺伝子は、高湿度におけるエフェクター非依存的な増殖に必要であったが、それぞれのアミノ酸合成経路の寄与度は異なることが分かった。この結果は、相同組換えにより新たに作成した遺伝子欠損変異体を用いた解析からも裏付けられた。また、同定した原因遺伝子の中には、二成分制御系を構成するレスポンスレギュレーターが含まれていた。遺伝子欠損変異体を用いたさらなる解析から、このレスポンスレギュレーターとそのパートナーとして働くセンサーキナーゼの両者が、高湿度における爆発的な増殖に必要であることを明らかにした。
This study で は, plant pathogenic bacteria Pseudomonas syringae が high humidity environment で 発 swing す る エ フ ェ ク タ ー に dependent し な い pathogenicity 発 institutions now の interpret を purpose と し て い る. そ の た め に, (1) research project rights in plant breeding を pathogenicity の index と し て, そ の degree が で under high humidity environment - the す る p. syringae - variant を ス ク リ ー ニ ン グ し, (research project 2) そ の reason but 伝 child に よ っ て suppression さ れ る physiology を Ming ら か に す る こ と を refers し た. (1) research project エ フ ェ ク タ ー を secretion で き な い p. syringae - variant の 発 light of constant "hrcC - lux" を に alone make し た. HrcC - lux の Tn5 ト ラ ン ス ポ ゾ ン - variant ラ イ ブ ラ リ を build し 発 light レ ベ ル を index と し た quantitative ス ク リ ー ニ ン グ に よ り, high humidity environment に お け る amount raised colonization が variations change す る - variant を choose sorting し た. Youdaoplaceholder0 1600 variant ニ ス リ リ ニ ニ グ グ ら ら, 35 variant を selected た. こ の う ち の 30 - variant に つ い て は, TAIL - PCR method や inverse PCR method に よ っ て Tn5 ト ラ ン ス ポ ゾ ン の を scions into position with fixed し た. (research project 2) research project 1 で with fixed し た reason heritage 伝 child の に は, ヌ ク レ オ チ ド metabolism, ヘ ム synthesis, sugar solution や TCA loop に masato and す る heritage 伝 son が containing ま れ て い た. Metabolic 経 こ れ ら の way に plus え て, kind of 々 の ア ミ ノ acid synthesized ま に な necessary but 伝 son も れ て い た. Fun deep い こ と に, こ れ ら の ア ミ ノ acid synthesis heritage 伝 は, high humidity に お け る エ フ ェ ク タ ー of interdependent な に necessary rights colonization で あ っ た が, そ れ ぞ れ の ア ミ ノ acid synthesis の send 経 road and degrees は different な る こ と が points か っ た. The result of <s:1>, the same group is replaced with えによ, and a new たに is made to form a <s:1> た remnant 伝 with a damaged variant を. The えによ た is used to analyze the けられた ら and the けられた in the けられた. ま た, with し た reason heritage 伝 child の に は, twenty percent on imperial system を constitute す る レ ス ポ ン ス レ ギ ュ レ ー タ ー が containing ま れ て い た. Heritage 伝 son owe loss - variant を with い た さ ら な る parsing か ら, こ の レ ス ポ ン ス レ ギ ュ レ ー タ ー と そ の パ ー ト ナ ー と し て 働 く セ ン サ ー キ ナ ー ゼ の struck が, high humidity に お け る detonation 発 に な raised colonization necessary で あ る こ と を Ming ら か に し た.

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
比較ゲノミクスによるPseudomonas syringae系統間の病原性差異を生み出すエフェクターの同定
通过比较基因组学鉴定驱动丁香假单胞菌菌株毒力差异的效应子
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    田村孝太郎;竹田篤史;三瀬和之;高野義孝;峯彰
  • 通讯作者:
    峯彰
イネが病原菌の感染力の源を検出して免疫を誘導する仕組みを解明―病気に強い植物の開発に期待―
阐明水稻检测病原菌感染源并诱导免疫力的机制 - 对抗病植物开发的期待 -
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
時系列RNA-seqデータのネットワーク解析から紐解く変動環境下の植物-病原細菌相互作用
通过时间序列 RNA-seq 数据的网络分析揭示波动环境下植物病原细菌的相互作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    鈴木慎司;嶋本果穂;大竹竜馬;高田昌汰;清水元樹;寺石政義;峯彰;寺内良平;高野義孝;三瀬和之;峯彰
  • 通讯作者:
    峯彰
二成分制御系CbrABは高湿度環境下におけるトマト斑葉細菌病菌の増殖をエフェクターとは独立して促進する
双组分调控系统 CbrAB 在高湿度环境中促进番茄叶细菌的生长,独立于效应器。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    石川真太郎;三瀬和之;高野義孝;峯彰
  • 通讯作者:
    峯彰
Image-Based Quantification of <i>Arabidopsis thaliana</i> Stomatal Aperture from Leaf Images
基于图像的叶子图像中的拟南芥气孔孔径定量
  • DOI:
    10.1093/pcp/pcad018
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Takagi Momoko;Hirata Rikako;Aihara Yusuke;Hayashi Yuki;Mizutani-Aihara Miya;Ando Eigo;Yoshimura-Kono Megumi;Tomiyama Masakazu;Kinoshita Toshinori;Mine Akira;Toda Yosuke
  • 通讯作者:
    Toda Yosuke
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  • 通讯作者:
    Sato Nori
セミと冬虫夏草の切っても切れない共生関係の進化
蝉与冬虫夏草密不可分的共生关系的演变
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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Heat shock protein 70 (Hsp70)はRed clover necrotic mosaic virus (RCNMV) のRNA 複製酵素複合体の形成を制御している
热休克蛋白 70 (Hsp70) 控制红三叶草坏死花叶病毒 (RCNMV) RNA 复制酶复合物的形成。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Taniguchi T;et al.;Toshiyuki Shimizu;Toshiyuki Shimizu;真板 宣夫;Shimizu T;合田 有一郎;Toshiyuki Shimizu;Shimizu T;Toshiyuki Shimizu;藤中 雄一;清水敏之;Shimizu T;野田 武志;清水敏之;岩田 武男;峯 彰
  • 通讯作者:
    峯 彰
Tn7トランスポゾンを介したluxCDABEオペロンのゲノム挿入によるPseudomonas syringaeの植物内増殖の定量と可視化
通过 Tn7 转座子基因组插入 luxCDABE 操纵子,对丁香假单胞菌的植物内生长进行定量和可视化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    峯 彰;松本 歩;Titus Schluter;Katharina Melkonian;中神 弘史;竹田 篤史
  • 通讯作者:
    竹田 篤史
CIPRO 2.5 : Ciona intestinalis Protein integrated database with large-scale omics data, bioinformatic analyses and curated annotation, with ability for user rating and comments
CIPRO 2.5:海鞘蛋白质集成数据库,具有大规模组学数据、生物信息学分析和精选注释,具有用户评级和评论的能力
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Taniguchi T;et al.;Toshiyuki Shimizu;Toshiyuki Shimizu;真板 宣夫;Shimizu T;合田 有一郎;Toshiyuki Shimizu;Shimizu T;Toshiyuki Shimizu;藤中 雄一;清水敏之;Shimizu T;野田 武志;清水敏之;岩田 武男;峯 彰;峯彰;Sato Nori;Sato Nori;吉沢 明康;吉沢明康;Toshinori Endo
  • 通讯作者:
    Toshinori Endo

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