計測と数理解析から探る生化学反応を伴う細胞内の力学解明と生きた構成則の構築
計測と数理解析から探る生化学反応を伴う細胞内の力学解明と生きた構成則の構築
批准号:
22KJ0208
负责人:
齋藤 匠
金额:
$2.83万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2023
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2023-03-08 至 2025-03-31
中文摘要
生体内の分子代謝メカニズム解明は、細胞生物学だけでなく、その病理的・医学的観点からも重要である。そこで我々はモデル生物である線虫と蛍光ラベルされたグルコースを用いた。線虫の腸内蛍光グルコース代謝を、顕微鏡技術(光褪色後蛍光回復法)を用いて計測した。その結果、腸内のグルコースが腸管と腸細胞の境界である微絨毛(ナノスケールの微細構造を持つ)に蓄積されていることを明らかにした。さらに、微絨毛におけるその拡散係数が、バルクのそれよりも遅いことを発見した。すなわち、この微細構造の見かけの粘性が水中よりも十分に高いことを示した。また、グリセロール中の蛍光グルコースの拡散係数計測から、蛍光グルコースの分子サイズがグルコースのそれよりも3倍程度大きいことを明らかにした。さらに、留学先(Yale University, School of Medicine)にて一分子にかかる張力の計測技術開発を行った。我々の張力センサーはアミノ酸構造物であるcoiled-coilを用いてる。そのため、センサーモジュールのサイズは一般的な分子サイズよりも小さく、それらの機能・構造への影響が小さい(これまでの代表的な張力センサーのサイズは対象分子程度あるいはそれ以上)。遺伝子組み換えが簡単な分裂酵母(fission yeast)をモデル生物として用いた。分裂酵母は細胞分裂時にcytokinetic ring(CR)と呼ばれる分子高次構造物をつくる。我々は、CRに関与する分子: Formin (Cdc12)が数pNの張力を支持していることを明らかにした。
英文摘要
生体内の分子代謝メカニズム解明は、細胞生物学だけでなく、その病理的・医学的観点からも重要である。そこで我々はモデル生物である線虫と蛍光ラベルされたグルコースを用いた。線虫の腸内蛍光グルコース代謝を、顕微鏡技術(光褪色後蛍光回復法)を用いて計測した。その結果、腸内のグルコースが腸管と腸細胞の境界である微絨毛(ナノスケールの微細構造を持つ)に蓄積されていることを明らかにした。さらに、微絨毛におけるその拡散係数が、バルクのそれよりも遅いことを発見した。すなわち、この微細構造の見かけの粘性が水中よりも十分に高いことを示した。また、グリセロール中の蛍光グルコースの拡散係数計測から、蛍光グルコースの分子サイズがグルコースのそれよりも3倍程度大きいことを明らかにした。さらに、留学先(Yale University, School of Medicine)にて一分子にかかる張力の計測技術開発を行った。我々の張力センサーはアミノ酸構造物であるcoiled-coilを用いてる。そのため、センサーモジュールのサイズは一般的な分子サイズよりも小さく、それらの機能・構造への影響が小さい(これまでの代表的な張力センサーのサイズは対象分子程度あるいはそれ以上)。遺伝子組み換えが簡単な分裂酵母(fission yeast)をモデル生物として用いた。分裂酵母は細胞分裂時にcytokinetic ring(CR)と呼ばれる分子高次構造物をつくる。我々は、CRに関与する分子: Formin (Cdc12)が数pNの張力を支持していることを明らかにした。
期刊论文(8)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
Simultaneous measurement of intracellular flow and molecular turnover in stress fibers
同时测量应力纤维中的细胞内流量和分子周转
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takumi Saito, Daiki Matsunaga, Shinji Deguchi]
通讯作者:
Shinji Deguchi
光褪色後蛍光回復法から探る生細胞内の力学が関わる分子交換(Revealing the mechanism of molecular turnover in living cells by fluorescence recovery after photobleaching)
通过光漂白后的荧光恢复揭示活细胞中分子周转的机制
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[齋藤匠, 松永大樹, 出口真次]
通讯作者:
出口真次
Long-term fluorescence recovery after photobleaching (FRAP)
光漂白后的长期荧光恢复 (FRAP)
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
Methods in Molecular Biology
影响因子:
--
作者:
[Saito, T., Matsunaga, D., Deguchi, S.]
通讯作者:
S.
Analysis of chemomechanical behavior of stress fibers by continuum mechanics-based FRAP
基于连续介质力学的 FRAP 分析应力纤维的化学力学行为
DOI:
10.1016/j.bpj.2022.06.032
发表时间:
2022
期刊:
Biophysical Journal
影响因子:
3.4
作者:
[Saito, T., Matsunaga, D., Deguchi, S.]
通讯作者:
S.
New strategies for analyzing the spatial distribution of mechanical and chemical properties of individual cells
分析单个细胞机械和化学特性空间分布的新策略
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takumi Saito, Daiki Matsunaga, Shinji Deguchi]
通讯作者:
Shinji Deguchi
共 7 条
細胞構造構成分子の分子交換計測と数理解析に基づくメカノトランスダクション機能解明
-
批准号:20J10828
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.09万
-
财政年份:2020
-
负责人:齋藤 匠
-
依托单位: