細胞構造構成分子の分子交換計測と数理解析に基づくメカノトランスダクション機能解明
細胞構造構成分子の分子交換計測と数理解析に基づくメカノトランスダクション機能解明
批准号:
20J10828
负责人:
齋藤 匠
金额:
$1.09万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-24 至 2022-03-31
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研究課題「細胞構造構成分子の分子交換計測と数理解析に基づくメカノトランスダクション機能解明」のために,制細胞内の分子交換計測手法を開発した。我々はまず、分子交換を3つのフェーズに分類した:1. 生化学反応と分子拡散の両方が支配的な場合(分子交換の時定数は数秒)、2. 生化学反応と細胞内流動が支配的な場合(時定数は数分を超える)、そして3. 生化学反応と細胞内流動に加え分子高次構造物が変形する場合(2と同様に時定数は数分を超える)。採用初年度には特に1に関する研究で進展があった。具体的には、従来のFRAP計測(代表的な分子交換計測手法)に反応拡散を考慮する数理および遺伝子工学実験を組み合わせ、細胞内分子の反応ドメインごとの化学平衡定数と拡散係数を分離する計測基盤を開発した。採用2年目には、上述した2および3に関する研究で進展があった。これまでの長時間FRAP計測では、取得したデータに含まれる化学反応(生化学情報)や細胞内の流動性や変形といった力学情報を複合的に解釈するモデルがなかった。そのため、ほとんどは比較的短時間の時間に対する輝度データのみを用いて、生化学情報のみを決定していた。また、代替的に、二つ以上の指数関数から成るモデルを用いて、それら指数関数の時定数を決定する手法もあった。それらに対して、我々は新たに、反応―移流方程式に基づくモデルをたて、その解析解をFRAP計測で得られた輝度の時間と空間のデータ(時空間輝度分布)にフィッティングすることで、生化学反応と移流速度を同時に計測する手法を提案した。さらに、連続体力学をFRAPに応用し、移流に加えて変形をとらえるモデルも開発した。これらの研究は細胞内の力学依存的な生化学反応(すなわち分子交換)を理解するための計測基盤を構築するものであり、工学だけでなく、細胞生物学・生化学・細胞力学等の分野に貢献したといえる。
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DOI:
10.1152/ajpcell.00225.2020
发表时间:
2021-06-01
期刊:
AMERICAN JOURNAL OF PHYSIOLOGY-CELL PHYSIOLOGY
影响因子:
5.5
作者:
[Huang,Wenjing, Matsui,Tsubasa S., Deguchi,Shinji]
通讯作者:
Deguchi,Shinji
細胞内タンパク質の複雑な分子交換メカニズムの解析
细胞内蛋白质复杂分子交换机制分析
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[齋藤 匠, 松永 大樹, 松井 翼, 出口 真次]
通讯作者:
出口 真次
What factors determine the number of nonmuscle myosin II in the sarcomeric unit of stress fibers?
哪些因素决定应力纤维肌节单位中非肌肉肌球蛋白 II 的数量?
DOI:
10.1007/s10237-020-01375-8
发表时间:
2021
期刊:
Biomechanics and Modeling in Mechanobiology
影响因子:
3.5
作者:
[Saito, T., Huang, W., Matsui, T.S., Kuragano, M., Takahashi, M., Deguchi, S.]
通讯作者:
S.
細胞内高次構造物の力学情報と分子交換の同時計測
同时测量细胞内高阶结构的力学信息和分子交换
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[齋藤匠, 松永大樹, 出口真次]
通讯作者:
出口真次
FRAP combined with genetic manipulation reveals the kinetics of actin-binding proteins in cells
FRAP 结合基因操作揭示细胞内肌动蛋白结合蛋白的动力学
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takumi Saito, Daiki Matsunaga, Tsubasa S. Matsui, Shinji Deguchi]
通讯作者:
Shinji Deguchi
共 11 条
計測と数理解析から探る生化学反応を伴う細胞内の力学解明と生きた構成則の構築
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批准号:22KJ0208
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$2.83万
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财政年份:2023
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负责人:齋藤 匠
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依托单位: